Hastane kaynaklı ishallerde clostridioides (clostridium) difficile araştırılması

Investigation of clostridioides (clostridium) difficile in patients with hospital-acquired diarrhea

PDF İndir

Tez No: 759875
Yazar: EYYÜP KAYA
Danışmanlar: PROF. DR. CANDAN ÖZTÜRK
Tez Türü: Doktora
Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
Yıl: 2022
Dil: Türkçe
Üniversite: Mersin Üniversitesi
Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
Sayfa Sayısı: 116

Özet

Clostridioides difficile (C. difficile); kapsülsüz, düz, yuvarlak uçlu, subterminal sporlu, Gram pozitif anaerobik bir basildir. C. difficile enfeksiyonu (CDE), sağlık hizmetiyle ilişkili bir enfeksiyon olup özellikle hastanede yatan hastalar için önemli bir mortalite, morbidite ve nüks kaynağıdır. Çalışmamızda; hastane kaynaklı ishallerde C. difficile insidansını belirlemek için anaerobik kültür ile etkenin izolasyonu, toksijenik kültür yöntemi ile toksijenik ve non-toksijenik suşların tespiti ve ELISA toksin A/B kullanılarak gaitada toksin varlığının araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmaya, Ekim 2020 - Temmuz 2021 tarihleri arasında Mersin Üniversitesi Hastanesi'nde çeşitli servislere yatırılan, en az 2 gün boyunca günde 3'den fazla gevşek veya sulu dışkılama yapan, 2 yaş üzerindeki ve Bilgilendirilmiş Gönüllü Olur Formu'nu imzalayan 85 hasta dahil edilmiştir. Sızdırmaz kaplarda toplanan gaita örneklerinde, 24-48 saat içinde 'Epilisa Fecal C. difficile Toksin A/B ELISA Kit"i kullanılarak C. difficile toksin A/B varlığı araştırılmıştır. Gaita örnekleri; sikloserin, sefoksitin, amfoterisin B içeren C. difficile agar (CLO), ChromID C. difficile agar (CDIF) ve %5 koyun kanlı Columbia agar besiyerlerine ekilmiştir. Besiyerleri 37 °C'lik etüvde anaerobik ortamda 48-72 saat inkübe edildikten sonra değerlendirilmiştir. Katı besiyerlerinde üreyen ve C. difficile olarak tanımlanan kolonilerden Schaedler Anaerop Broth besiyerine ekim yapılmış ve 48-72 saatlik anaerobik inkübasyonun sonunda bu karışımdan ELISA yöntemiyle toksin varlığı araştırılmıştır. Çalışmamızda ELISA toksin A/B pozitifliği %4.7(n=4) olarak bulunmuştur. Anaerop kültürde üreyen 6(%7.1) C. difficile izolatının, toksijenik kültür ile 3(%3.5)'ünde toksin varlığı saptanmış, 3(%3.5)'ünde saptanmamıştır. Kültürde üreyen 6(%7.1) C. difficile izolatının 3(%3.5)'nün toksijenik kültürü pozitif olarak değerlendirilmiştir. Toksijenik kültürü negatif olan 3 hasta ise, non toksijenik C. difficile olarak düşünülmüştür (p=1.000). Hasta popülasyonumuzda CDE sıklığının %3.5(n=3) olduğu belirlendi. Toksijenik kültür referans test olarak alındığında, ELISA Toksin A/B testinin duyarlılık, özgüllük, pozitif prediktif değer ve negatif prediktif değeri sırasıyla; %100, %98.8, %75 ve %100 olarak belirlenmiştir. C. difficile enfeksiyonu, antibiyotik kullanımı ve hastane yatış ile ilişkili olup akılcı antibiyotik kullanımı ve uygun enfeksiyon kontrol önlemleriyle önlenebilir.

Özet (Çeviri)

Clostridioides difficile (C. difficile); a Gram-positive anaerobic bacillus bacteria non-encapsulated, flat, round-tipped, subterminal spore forming. C. difficile infection (CDI) is a healthcare-associated infection and is an important source of mortality, morbidity and recurrence, especially for hospitalized patients. In our study; aimed to isolation of the agent with anaerobic culture to determine the incidence of C. difficile in hospital-acquired diarrhea, detection of toxigenic and non-toxigenic strains by toxigenic culture method and investigate the presence of toxin in stool using ELISA toxin A/B. The study included 85 patients over the age of 2 who applied to Mersin University between October 2020 and July 2021 and were hospitalized in various services in this hospital, having more than 3 loose or watery stools per day for at least 2 days and signed the Informed Consent Form. The presence of C. difficile toxin A/B was investigated using the 'Epilisa Fecal C. difficile Toxin A/B ELISA Kit" in accordance with the manufacturer's recommendations within 24-48 hours of collection in the stool samples collected in sealed containers. Stool samples were inoculated on Clostridium difficile agar containing cycloserine, cefoxitin amphotericin B (CLO), ChromID C. difficile agar (CDIF), and Columbia agar with 5% sheep blood. The media were evaluated after 48-72 hours of incubation in an anaerobic environment in an oven at 37 oC colonies grown on solid media and defined as C. difficile were inoculated into Schaedler Anaerobic Broth medium and the presence of toxin was investigated from this mixture by ELISA method at the end of 48-72 hours of anaerobic incubation. In our study, ELISA toxin A/B positivity was found to be 4.7%(n=4). Toxin presence was detected in 3(3.5%) of 6(7.1%) C. difficile isolates grown in anaerobic culture with toxigenic culture, and not in 3(3.5%) of them. 3(3.5%) of 6(7.1%) C. difficile isolates grown in culture were evaluated as positive toxigenic culture. 3 patients with negative toxigenic cultures were considered as non-toxic C. difficile (p=1.000). The frequency of CDE in our patient population was found to be 3.5%(n=3). When the toxigenic culture is taken as a reference, the sensitivity, specificity, positive predictive value and negative predictive value of the ELISA Toxin A/B test are determined respectively; as 100%, 98.8%, 75% and 100%. C. difficile infection is associated with antibiotic use and hospitalization and can be prevented with rational antibiotic use and appropriate infection control measures.

Benzer Tezler

Tez No
281588
Süleyman Demirel Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi yoğun bakım ve cerrahi servis hastalarından izole edilen MDR (Multi Drug Resistant) Acinetobacter baumannii izolatlarının rep-PCR (Repetative sequence based PCR) ve PFGE (Pulsed Field Gel Electrophoresis) yöntemleri ile kökenlerinin araştırılması.
Investigation of the origin of Multi Drug Resistant (MDR) Acinetobacter baumannii strains isolated from patients of surgery service and intensive care units of Süleyman Demirel University,Medical School Hospital, with the Repetative sequence-based PCR (Rep-PCR) and Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE) methods.
OSMAN KILINÇ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2011
Mikrobiyoloji Süleyman Demirel Üniversitesi
Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BUKET CİCİOĞLU ARIDOĞAN
Tez No
604679
Kalkon türevlerinin farklı hammaddeye sahip örme kumaş yapıları üzerindeki antibakteriyel aktivitelerinin incelenmesi
Investigation of antibacterial activities of chalcon derivatives on knitted fabric structures with different raw materials
GÜRSEL KORKMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Biyokimya Bursa Uludağ Üniversitesi
Tekstil Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YAŞAR DİLEK KUT
Tez No
652054
Hastane kaynaklı metisiline dirençli stafilokok infeksiyonlarında risk faktörlerinin incelenmesi, vankomisin ve teikoplanin duyarlılıklarının etest yöntemi ile karşılaştırılması
Investigation of risk factors in nosocomial methicillin resistant staphylococcus infections, comparison of vancomycin and teicoplanin sensitivity with etest method
ÇİĞDEM ATAMAN HATİPOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1999
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Sağlık Bakanlığı
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
UZMAN BAŞAK DOKUZOĞUZ
Tez No
745948
Hastane kaynaklı klebsiella pneumoniae'ya yönelik inaktif ve rekombinant aşı denemeleri
Inactive and recombinant vaccine trials for hospital acquired klebsiella pneumoniae
AYŞEGÜL İLBAN
Doktora
Türkçe
2022
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Selçuk Üniversitesi
Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ASLI SAKMANOĞLU
Tez No
33403
Hastane kaynaklı stafilokok suşlarının metisilin' e dirençlerinin tesbiti
The Determination of the methicillin resistance of staphylococcus which are one of the cause of nosocomial infections
MELTEM MENTEŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
1995
Mikrobiyoloji Çukurova Üniversitesi
Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. SAİT YİĞİT

Geri Dön