Geri Dön

Hastane kaynaklı ishallerde clostridioides (clostridium) difficile araştırılması

Investigation of clostridioides (clostridium) difficile in patients with hospital-acquired diarrhea

  1. Tez No: 759875
  2. Yazar: EYYÜP KAYA
  3. Danışmanlar: PROF. DR. CANDAN ÖZTÜRK
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Mersin Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 116

Özet

Clostridioides difficile (C. difficile); kapsülsüz, düz, yuvarlak uçlu, subterminal sporlu, Gram pozitif anaerobik bir basildir. C. difficile enfeksiyonu (CDE), sağlık hizmetiyle ilişkili bir enfeksiyon olup özellikle hastanede yatan hastalar için önemli bir mortalite, morbidite ve nüks kaynağıdır. Çalışmamızda; hastane kaynaklı ishallerde C. difficile insidansını belirlemek için anaerobik kültür ile etkenin izolasyonu, toksijenik kültür yöntemi ile toksijenik ve non-toksijenik suşların tespiti ve ELISA toksin A/B kullanılarak gaitada toksin varlığının araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmaya, Ekim 2020 - Temmuz 2021 tarihleri arasında Mersin Üniversitesi Hastanesi'nde çeşitli servislere yatırılan, en az 2 gün boyunca günde 3'den fazla gevşek veya sulu dışkılama yapan, 2 yaş üzerindeki ve Bilgilendirilmiş Gönüllü Olur Formu'nu imzalayan 85 hasta dahil edilmiştir. Sızdırmaz kaplarda toplanan gaita örneklerinde, 24-48 saat içinde 'Epilisa Fecal C. difficile Toksin A/B ELISA Kit"i kullanılarak C. difficile toksin A/B varlığı araştırılmıştır. Gaita örnekleri; sikloserin, sefoksitin, amfoterisin B içeren C. difficile agar (CLO), ChromID C. difficile agar (CDIF) ve %5 koyun kanlı Columbia agar besiyerlerine ekilmiştir. Besiyerleri 37 °C'lik etüvde anaerobik ortamda 48-72 saat inkübe edildikten sonra değerlendirilmiştir. Katı besiyerlerinde üreyen ve C. difficile olarak tanımlanan kolonilerden Schaedler Anaerop Broth besiyerine ekim yapılmış ve 48-72 saatlik anaerobik inkübasyonun sonunda bu karışımdan ELISA yöntemiyle toksin varlığı araştırılmıştır. Çalışmamızda ELISA toksin A/B pozitifliği %4.7(n=4) olarak bulunmuştur. Anaerop kültürde üreyen 6(%7.1) C. difficile izolatının, toksijenik kültür ile 3(%3.5)'ünde toksin varlığı saptanmış, 3(%3.5)'ünde saptanmamıştır. Kültürde üreyen 6(%7.1) C. difficile izolatının 3(%3.5)'nün toksijenik kültürü pozitif olarak değerlendirilmiştir. Toksijenik kültürü negatif olan 3 hasta ise, non toksijenik C. difficile olarak düşünülmüştür (p=1.000). Hasta popülasyonumuzda CDE sıklığının %3.5(n=3) olduğu belirlendi. Toksijenik kültür referans test olarak alındığında, ELISA Toksin A/B testinin duyarlılık, özgüllük, pozitif prediktif değer ve negatif prediktif değeri sırasıyla; %100, %98.8, %75 ve %100 olarak belirlenmiştir. C. difficile enfeksiyonu, antibiyotik kullanımı ve hastane yatış ile ilişkili olup akılcı antibiyotik kullanımı ve uygun enfeksiyon kontrol önlemleriyle önlenebilir.

Özet (Çeviri)

Clostridioides difficile (C. difficile); a Gram-positive anaerobic bacillus bacteria non-encapsulated, flat, round-tipped, subterminal spore forming. C. difficile infection (CDI) is a healthcare-associated infection and is an important source of mortality, morbidity and recurrence, especially for hospitalized patients. In our study; aimed to isolation of the agent with anaerobic culture to determine the incidence of C. difficile in hospital-acquired diarrhea, detection of toxigenic and non-toxigenic strains by toxigenic culture method and investigate the presence of toxin in stool using ELISA toxin A/B. The study included 85 patients over the age of 2 who applied to Mersin University between October 2020 and July 2021 and were hospitalized in various services in this hospital, having more than 3 loose or watery stools per day for at least 2 days and signed the Informed Consent Form. The presence of C. difficile toxin A/B was investigated using the 'Epilisa Fecal C. difficile Toxin A/B ELISA Kit" in accordance with the manufacturer's recommendations within 24-48 hours of collection in the stool samples collected in sealed containers. Stool samples were inoculated on Clostridium difficile agar containing cycloserine, cefoxitin amphotericin B (CLO), ChromID C. difficile agar (CDIF), and Columbia agar with 5% sheep blood. The media were evaluated after 48-72 hours of incubation in an anaerobic environment in an oven at 37 oC colonies grown on solid media and defined as C. difficile were inoculated into Schaedler Anaerobic Broth medium and the presence of toxin was investigated from this mixture by ELISA method at the end of 48-72 hours of anaerobic incubation. In our study, ELISA toxin A/B positivity was found to be 4.7%(n=4). Toxin presence was detected in 3(3.5%) of 6(7.1%) C. difficile isolates grown in anaerobic culture with toxigenic culture, and not in 3(3.5%) of them. 3(3.5%) of 6(7.1%) C. difficile isolates grown in culture were evaluated as positive toxigenic culture. 3 patients with negative toxigenic cultures were considered as non-toxic C. difficile (p=1.000). The frequency of CDE in our patient population was found to be 3.5%(n=3). When the toxigenic culture is taken as a reference, the sensitivity, specificity, positive predictive value and negative predictive value of the ELISA Toxin A/B test are determined respectively; as 100%, 98.8%, 75% and 100%. C. difficile infection is associated with antibiotic use and hospitalization and can be prevented with rational antibiotic use and appropriate infection control measures.

Benzer Tezler

  1. Kalp yetmezliği olan hastaların hastane kaynaklı uykusuzluğa ilişkin görüşlerinin incelenmesi: karma yöntem araştırması

    Investigation of the opinions of patients with heart failure on hospital-induced insomnia: A mixed method research

    MEHMET EMİN ATAY

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    HemşirelikAtatürk Üniversitesi

    Hemşirelik Esasları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BAHAR ÇİFTÇİ

  2. Mathematical and statistical modelling of hospital-acquired infections in an intensive care unit

    Hastane kaynakli enfeksiyonlarin bir yogun bakim ünitesi ıçin ıstatistiksel ve matematiksel modellenmesi

    MARAL TAHER SHABESTARI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2020

    Endüstri ve Endüstri Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Endüstri Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ EMİNE YAYLALI

  3. Anestezi yoğun bakımda 2011-2014 yılları arasında ortaya çıkan enfeksiyonların etkenleri sistemik dağılımı ve antibiyotik direncinin retrospektif incelenmesi

    The factors of infections appearing in anesthesia intensive care between 2011-2014,the systemic distribution and studying of its antibiotic resistance retrospectively

    RIDVAN KONAK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Anestezi ve ReanimasyonDicle Üniversitesi

    Anesteziyoloji ve Reanimasyon Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ORHAN TOKGÖZ

  4. 2010 ve 2011 yıllarında yoğun bakım enfeksiyonlarının dağılımının, etkenlerinin ve duyarlılıklarının retrospektif olarak karşılaştırılması

    A retrospective comparision of distribution, pathogens and susceptibility of pathogens of intensive care infections in 2010 and 2011

    AYŞEGÜL TARHAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Anestezi ve ReanimasyonAnkara Üniversitesi

    Anesteziyoloji ve Reanimasyon Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MELEK TULUNAY

  5. Hastane kaynaklı pan drug resistant Acinetobacter baumannii enfeksiyonlarında risk faktörlerinin araştırılması

    Risk factors for nosocomial pan drug resistant Acinetobacter baumannii infections

    HAVVA TÜNAY

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıAfyon Kocatepe Üniversitesi

    Klinik Mikrobiyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. TUNA DEMİRDAL