The cell division role of Glypican 5 in mammalian cells
Memeli hücrelerinde Glypican 5'in hücre bölünmesi rolü
- Tez No: 761033
- Danışmanlar: PROF. DR. NURHAN ÖZLÜ SICAKKAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Koç Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 77
Özet
Glypican'lar (GPC'ler), Heparan Sülfat Proteoglikanlar (HSPG'ler) glikozaminoglikan ailesinin üyeleridir. GPI çapaları aracılığıyla plazma zarına sabitlenmiş hücre dışı proteinlerdir. Glypican'lar, Hedgehog ve Wnt gibi morfojenlerin aktivitesini düzenleyerek gelişimsel süreçlerde, hücre farklılaşmasında, kanserin ilerlemesinde ve kök hücre fonksiyonunda rol oynar. Daha önce yapılan siRNA incelemesi, Glypican 5'in (GPC5) yıkılmasının, hücre bölünmesinde bir işlev öneren çoklu çekirdeklenmede bir artışa yol açtığını göstermiştir. Ancak hücre bölünmesindeki rolleri araştırılmamıştır. Sitokinezdeki önceki yakınlığa bağlı proteomik analizimiz, GPC5'in hücre yapışması, aktin yeniden organizasyonu ve RhoA aktivasyonunda yer alan proteinlerle etkileşime girdiğini ortaya koydu. Hücre bölünmesi, kromozom ayrımı ve hücre iskeleti dinamiği açısından kapsamlı bir şekilde çalışılmış olsa da, hücre yüzeyi proteinlerinin sitokinezdeki işlevi belirsizliğini koruyor. Bu tezde, GPC5 KO hücrelerde canlı hücre görüntülemesi yaparak Glypican 5'in hücre bölünmesindeki rolünü araştırıyorum. Buna paralel olarak, GPC5'in önceden tanımlanmış etkileşim ortaklarının işlevselliğini araştırdım. Analizim, GPC5'in özellikle absisyon sırasında bölünen hücrelerin yapışma özelliklerini düzenleyerek geç sitokinezde bir rolü olduğunu ortaya koydu. Bu çalışma, bölünme sırasında hücrenin dış ve iç kısmının nasıl iletişim kurduğunun mekanizmasını aydınlatmaktadır.
Özet (Çeviri)
Glypicans (GPCs) are members of the Heparan Sulphate Proteoglycans (HSPGs) family of glycosaminoglycans. They are extracellular proteins anchored to the plasma membrane through their GPI anchor. Glypicans play role in developmental processes, cell differentiation, cancer progression, and stem cell function by regulating the activity of morphogens like Hedgehog and Wnt. An early RNAi screen has shown that the knockdown of Glypican 5 (GPC5) led to an increase in multinucleation suggesting a function in cell division. However, their role in cell division is not investigated. Our previous proximity dependent proteomic analysis in cytokinesis revealed that GPC5 interacts with proteins that are involved in cell adhesion, migration, actin reorganization, and RhoA activation. Even though cell division was extensively studied in terms of chromosome segregation and cytoskeleton dynamics, the function of cell surface proteins in cytokinesis remains elusive. In this thesis, I investigate the role of Glypican 5 in cell division by performing live cell imaging in GPC5 knock-out cells. In parallel, I investigated the functionality of previously identified interaction partners of GPC5. My analysis revealed that GPC5 have a role in the late cytokinesis by regulating adhesion properties of dividing cells specifically during abscission. This study illuminates the mechanism of how the outside and the inner part of the cell communicates during division.
Benzer Tezler
- Roles of cell surface proteins during cytokinesis
Hücre yüzeyi proteinlerinin sitokinezdeki rollerinin belirlenmesi
EZGİ MEMİŞ
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
BiyokimyaKoç ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NURHAN ÖZLÜ SICAKKAN
- Cellular role of a protocadherin family member in mammalian cells
Protocadherin aile üyesinin memeli hücrelerindeki hücresel rolü
SELDA BÜLBÜL
Yüksek Lisans
İngilizce
2013
GenetikKoç ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. NURHAN ÖZLÜ
- Normal prostat ve prostat adenokarsinomlarında CHEK-2 üzerinden aktive olan hücre döngüsü düzenleyici proteinlerden cell division cycle 25 homolog A, cell division cycle 25 homolog C ve apoptosis antagonizing transcription factor proteinlerinin prostat karsinogenezi üzerine etkileri
Evaluation of 'cell division cycle 25 homolog C' (CDC25), 'cell division cycle 25 homolog A (CDC25A)' and 'apoptosis antagonizing transcription factor' (AATF) proteins which are activated by CHEK-2 with immunohistochemistry in normal prostate tissue and prostatic adenocarcinomas
SERAP İŞLER
- Analysis of cell surface reorganization during cell division
Hücre bölünmesi sırasında hücre yüzey düzenlenmesinin analizi
NAZLI EZGİ ÖZKAN KÜÇÜK
Doktora
İngilizce
2018
BiyolojiKoç ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. NURHAN ÖZLÜ
- Cell Cycle Dependent Role of Chloride Intracellular Channel Protein 4 in mammalian cells
Memeli hücrelerinde Chloride Intracellular Channel Protein 4'ün hücre döngüsüne bağlı rolü
ZEYNEP CANSU ÜRETMEN
Yüksek Lisans
İngilizce
2015
GenetikKoç ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. NURHAN ÖZLÜ