Uyarıcı-tip fenilpropanolamin (PPA) ve feniletilamin (PEA) türevi schiff bazı bileşiklerinin sentezi, tek kristal yapı analizi, hirshfeld yüzey analizi ve moleküler yerleştirme
Synthesis of stimulant-type phenylpropanolamine (PPA) and phenylethylamine (PEA) derivative schiff some compounds, single crystal structure analysis, hirshfeld surface analysis, and molecular docking
- Tez No: 777992
- Danışmanlar: PROF. DR. PROF.DR.ERTAN ŞAHİN, PROF. DR. ABDULLAH MENZEK
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Kimya, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: Schiff bazı, Dopamin, Parkinson, Şizofreni, Tek Yapı Kristal Analizi, Moleküler yerleştirme, Hirshfeld Yüzey Analizi, Parkinson hastalığı, Yüzey analiz teknikleri, Schiff base, Dopamine, Parkinson, Schizophrenia, Single Structure Crystal Analysis, Molecular embedding, Hirshfeld Surface Analysis, Parkinson disease, Surface analysis techniques
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Atatürk Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kriminalistik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Amaç: Schiff bazı bileşiklerinin önemli biyolojik aktiviteleri göz önünde bulundurularak uyarıcı-tip çıkış maddeleri kullanılarak aldehitlerle kondenzasyonu sonucu bir seri yeni sekiz Schiff bazının sentezi gerçekleştirildi. Bu bileşiklerin Tek Yapı Kristal Analizi (XRD), Hirshfeld Yüzey Analizi (HS) ve Moleküler Yerleştirme (MD) çalışmalarının yapılması amaçlandı. Yöntem: Bu çalışmada sentetik psikoaktif etkilere sahip olduğu bilinen fenilpropanolamin (PPA) ve feniletilamin (PEA) çıkış bileşikleri olarak kullanıldı. Mikrodalga sentez yöntemiyle bunların farklı aril aldehitlerle olan kondenzasyon tepkiemleri gerçekleştirldi. Böylece yeni tip PPA ve PEA türevi Schiff bazı bileşikleri elde edildi. Sentezlenen moleküllerin geometrik ve termal parametreleri ile molekül içi ve moleküller arası etkileşimleri belirlendi. Kristal yapısı olan bileşiklerin simetrileri ve moleküler geometrileri Hirshfeld Yüzey Analizleri yapılarak belirlendi. Ayrıca moleküler yerleştirme teorik hesaplama yöntemi (in silico) ile ligand-protein etkileşmeleri incelendi. Bulgular: Hedeflenen bileşikler kısa sürede yüksek verimlerle sentezlendi. Bileşiklerin yapıları 1H NMR, 13H NMR, IR, kütle ve X-Ray analizleri ile belirlendi. Moleküllerin geometrik ve termal parametreleri ile molekül içi ve moleküller arası etkileşimler belirlendi. Sonuç: Tez kapsamında sentezlenen Schiff bazı bileşiklerinin in silico modelleme ile D2R-tipi (D2, D3 ve D4) reseptörlerine bağlandığı görüldü ve agonist/antagonist etkisinin uyguladığı mekanizmalar öne sürüldü. Elde edilen Schiff bazlarının bir D2/D3/D4 agonisti/antagonisti olduğu görüldü. Yeni sentezlenen bu bileşiklerin, başta şizofreni ve Parkinson hastalığı olmak üzere nörodejeneratif hastalıkların tedavisinde kullanılma potansiyeli olduğu doking skorlarına göre ön görüldü. Çalışmada sentezlenen bileşiklerden dördünün kristal yapısı incelendi. Moleküllerin kristalografik ve moleküler yapısı X-ışınları tek kristal kırınım yöntemiyle belirlendi. Tüm yapıların Hirshfeld yüzeyi belirlenerek kristal örgüleri incelendi, molekül içi ve moleküler arası etkileşimler görüntülenerek parmak izi haritaları elde edildi. Bu etkileşmeler sonucunda ligandın hangi konumu aldığı ve ligandın konformasyonları belirlendi.
Özet (Çeviri)
Purpose: Considering the important biological activities of Schiff base compounds, a series of eight new Schiff bases were synthesized by condensation with aldehydes using stimulant-type starting materials. It was aimed to perform Single Structure Crystal Analysis (XRD), Hirshfeld Surface Analysis (HS) and Molecular Arrangement (MD) studies of these compounds. Method: In this study, phenylpropanolamine (PPA) and phenylethylamine (PEA), which are known to have synthetic psychoactive effects, were used as starting compounds. Condensation reactions of these compounds with different aryl aldehydes were carried out by microwave synthesis method. Thus, new type of PPA and PEA derivative Schiff base compounds were obtained. The geometric and thermal parameters of the synthesized molecules and their intramolecular and intermolecular interactions were determined. Symmetries and molecular geometries of compounds with crystalline structure were determined by Hirshfeld Surface Analysis. In addition, ligand-protein interactions were investigated by molecular docking theoretical calculation method (in silico). Results: Targeted compounds were synthesized in a short time with high yields. The structures of the compounds were determined by 1H NMR, 13H NMR, IR, mass and X-Ray analyses. Geometric and thermal parameters of the molecules and their intramolecular and intermolecular interactions were determined. Conclusion: The synthesized Schiff base compounds were found to bind to D2R-type (D2, D3 and D4) receptors by in silico modeling method. and the mechanisms exerted by the agonist/antagonist effect were suggested. The resulting Schiff bases were found to be a D2/D3/D4 agonist/antagonist. According to the doking scores, it was predicted that these newly synthesized compounds have the potential to be used in the treatment of neurodegenerative diseases, especially schizophrenia and Parkinson's disease. In the study, the crystal structures of four of the synthesized compounds were examined. The crystallographic and molecular structures of the molecules were determined by X-ray single crystal diffraction method. By determining the Hirshfeld surface of all structures, their crystal lattices were examined, fingerprint maps were obtained by visualizing intramolecular and intermolecular interactions. As a result of these interactions, the position of the ligand and the conformation of the ligand were determined.
Benzer Tezler
- Ondokuz Mayıs Üniversitesi Tıp Fakültesi öğrencilerinde uyarıcı işleme hassasiyeti ile depresyon ilişkisi
The relationship between sensory processing sensitivity and depression of Ondokuz Mayıs University Medical Faculty students
PINAR KÜÇÜKOSMANOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Aile HekimliğiOndokuz Mayıs ÜniversitesiAile Hekimliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA FEVZİ DİKİCİ
- 2018-2020 yılları arasında Adli Tıp Kurumu Bursa Grup Başkanlığında otopsisi yapılan olgularda alkol, uyutucu- uyuşturucu ve uyarıcı madde tespit edilen vakaların retrospektif olarak incelenmesi
Retrospective analysis of the cases including alcohol, drug and stimulant substances in autopsies performed by Bursa Group Chai̇rman of Council of Forensic Medicine between 2018-2020
EMİNE TÜRKYILMAZ TEMEL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Adli TıpBursa Uludağ ÜniversitesiAdli Tıp Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DİLEK DURAK
- 2017 yılında Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi acil servisine başvuran ve tetkiklerinde alkol, uyutucu-uyuşturucu veya uyarıcı madde saptanan olguların retrospektif olarak değerlendirilmesi
Retrospective evaluation of patients who were admitted to Ege University, Faculty of Medicine, emergency ward in 2017 and tested positive for alcohol or substances
FIRAT İLERİ
- 2017 yılı ilk altı ayında Adli Tıp Anabilim Dalımız bilirkişi kurulunca 'Uyutucu, uyuşturucu, uyarıcı madde aranması' konulu rapor düzenlenmiş olguların değerlendirilmesi
Evaluation of the cases for whom the report 'screening of depressants, narcotics and stimulants' was prepared by The Department Of Forensic Medicine Of Suleyman Demirel University Faculty Of Medicine in the first six months of 2017
MUHAMMET ÖZBOSTAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2018
Adli TıpSüleyman Demirel ÜniversitesiAdli Tıp Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SÜLEYMAN SERHAT GÜRPINAR
- İzmir' de uyuşturucu ve uyarıcı madde kullanımı tespit edilen adli olguların incelenmesi
Investigation of forensic cases detected to use drugs and stimulants in İzmir
ERKAN SARUHAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
Adli Tıpİzmir Katip Çelebi ÜniversitesiAdli Tıp Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET TOKDEMİR