Geri Dön

Farklı pasaj numaralarındaki hücre hatlarında farklılaşmanın yüzey zenginleştirilmiş Raman spektroskopisi(SERS) yaklaşımı ile araştırılması

The investigation of differentiation in cell lines of different passage numbers with surface enhanced Raman spectroscopy (SERS) approach

PDF İndir

  1. Tez No: 778800
  2. Yazar: NAZLI ÖNCER
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. ASLI YILMAZ, DOÇ. DR. MEHMET YILMAZ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: pasaj numarası, replikatif hücre yaşlanması, altın nanoçubuk dizinler, yüzey-zenginleştirilmiş Raman spektroskopisi (SERS), kemometrik analizler, Hücre yaşlanması, Kemometrik yöntem, Pasajlar, Raman spektroskopisi, passage number, replicative cell senescence, gold nanorod arrays, surface-enhanced Raman spectroscopy (SERS), chemometric analysis, Cellular senescence, Chemometric method, Passages, Raman spectroscopy
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Atatürk Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Amaç: Bu tez çalışmasında etiketsiz altın nanoçubuk dizin (gold nanorod array, GNA) SERS platformunu üreterek farklı pasaj numaralarına sahip sağlıklı (MRC 5 ve MCF 10A) ve kanserli (A549 ve MCF 7) olmak üzere 12 farklı hücre hattının bu platform ile birleştirilmesi hedeflenmiştir. Ayrıca platformdan alınan SERS sinyalleri doğrultusunda farklı pasaj numaralarına sahip hücre hatlarının birbirinden ayrılması ve farklılaşan hücre hatlarındaki bant değişimlerinin hücresel yaşlanma ile ilişkisinin gösterilmesi amaçlanmıştır. Yöntem: GNA SERS substratı, fiziksel buhar birikimi (physical vapor deposition, PVD) yöntemi ile eğik açı birikimi (oblique angle deposition, OAD) tekniği kullanılarak üretilmiştir. 12 hücre hattının (4 hücre hattının her birinden üç pasaj olmak üzere) her biri uygun besiyeri ortamında kültürlenerek çoğaltılmıştır. Hücrelerden alınan SERS sinyalleri önce ön işleme aşamalarından geçirilmiş daha sonra gözetimsiz (PCA, HCA) ve gözetimli (LDA, SIMCA, SVM) istatistiksel analizlere tabi tutulmuştur. Ayrıca elde edilen verilerin, hücresel yaşlanma ile bağlantılı biyomoleküler değişimi niceliksel olarak belirlemek ve anlamlılığını tespit etmek amacıyla one-way ANOVA testi yapılmıştır. Bulgular: Anizotropik yapıya sahip GNA SERS substratı başarıyla sentezlenmiştir. GNA yüzeyi ile bir araya gelen hücrelerden alınan sinyallerin istatistiksel analizlere tabi tutulmasından sonra hücrelerin birbirinden ayrıldığı doğruluk değerleri ile gösterilmiştir. Ayrılan hücrelere ait bantlar yorumlanmış ve elde edilen biyomoleküler değişikliklerin hücresel yaşlanma ile ilişkili olabileceği değerlendirilmiştir. Sonuç: Farklı pasaj numaralarına sahip hücre hatlarının ayrımı, yapılan beş farklı analiz ile gösterilmiştir. Ayrılan hücrelere ait bant değerleri yorumlanmış ve bu bantlardaki biyokimyasal değişikliklerin, hücresel yaşlanmayla ilişkili olduğu sonucuna varılmıştır.

Özet (Çeviri)

Purpose: In this thesis study, healthy and cancerous neuron (MRC 5 and A549) healthy and cancerous breast (MCF 10A and MCF 7) cell lines with different passage numbers were cultured and combined with the gold nanorod array (gold nanorod array, GNA) SERS platform. In line with the SERS signals received from the platform, it is aimed to separate cell lines with different passage numbers from each other and to show the relationship of band changes in differentiated cell lines with cellular senescence. Method: The GNA as SERS platform was produced via the physical vapor deposition (PVD) method and the oblique angle deposition (OAD) technique. Each of the 12 cell lines (three passages from each of the 4 cell lines) were cultured in the appropriate medium and propagated. SERS signals from cells were first preprocessed and then subjected to unsupervised (PCA, HCA) and supervised (LDA, SIMCA, SVM) statistical analysis. In addition, one-way ANOVA test was performed to quantitatively determine the biomolecular change associated with cellular aging and to determine the significance of the obtained data. Findings: GNA SERS substrate with anisotropic structure has been successfully synthesized. After the statistical analysis of the signals received from the cells coming together with the GNA surface, the separation of the cells from each other was shown with accuracy values. The bands of the separated cells were interpreted and it was evaluated that the obtained biomolecular changes could be related to cellular senescence. Results: Differentiation of cell lines with different passage numbers was demonstrated by five different analyzes. The band values of the separated cells were interpreted and it was concluded that the biochemical changes in these bands are associated with cellular senescence.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    734492

    Force transducer piano keys as an innovative approach for piano pedagogy

    Piyano eğitimi için yenilikçi bir yaklaşım olarak kuvvet algılayıcısına dönüştürülmüş piyano tuşları

    ASAF ÇETİN EREN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    Müzikİstanbul Teknik Üniversitesi

    Müzik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. EMİN SÜNBÜLOĞLU

    DR. ÖĞR. ÜYESİ AHMET TUNÇ BUYRUKLAR

  2. Tez No

    760219

    Farklı hücre senkronizasyon yöntemlerinin erken ve geç pasaj sayılarındaki sığır ve koyun hücreleri üzerindeki etkilerinin incelenmesi

    Investigation of the effects of different cell synchronization methods on early and late passage number sheep and bovine cells

    ASLI TANI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    ZiraatTekirdağ Namık Kemal Üniversitesi

    Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEZEN ARAT

  3. Tez No

    682206

    İyi üretim uygulamaları standartlarında farklı tekniklerle izole edilen göbek kordonu kaynaklı erken ve geç pasaj mezenkimal kök hücrelerin immunofenotipik, genomik ve immunsüpresif özelliklerinin karşılaştırılması

    Comparison of immunophenotypic, genomic and immunosuppressive properties of umbilical cord originating early and late passage mesenchymal stem cells isolated by different techniques in good manufacturing practices standard

    ZEHRAGÜL ERGÜL YÜKSEL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Biyolojiİstinye Üniversitesi

    Kök Hücre ve Doku Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ERDAL KARAÖZ

  4. Tez No

    577728

    Amniyosit kültürlerinde gestasyonel yaş ve hücre pasaj sayısına göre kök hücre belirteçlerinin ve ekspresyon değişimlerinin incelenmesi

    The examination of stem cell markers and their expression changes in amniocyte cell cultures depending on the gestational age and number of cell passage

    EZGİ ÇOKAKLI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Tıbbi BiyolojiMersin Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ÖZLEM İZCİ AY

  5. Tez No

    518430

    Farklı insan dokularından elde edilen mezenkimal kök hücrelerin farklılaşma potansiyellerinin immünofenotipik ve gen ekspresyon düzeyinde incelenmesi

    Investigation of differentiation potentials of mesenchymal stem cells obtained from different human tissues by i̇mmunophenotypic and gene expression levels

    GÜLAY ERMAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Bilim ve TeknolojiKocaeli Üniversitesi

    Kök Hücre ve Doku Yenilenmesi Bilim Dalı

    DOÇ. DR. YUSUFHAN YAZIR

Geri Dön