Kronik granülomatoz hastalıkta nadph oksidaz aktivitesi ve patogenez ilişkisinin yeni tanısal yöntemlerle araştırılması
Investigation of nadph oxidase activity and pathogenesis of chronic granulomatous disease by new diagnostic methods
- Tez No: 778934
- Danışmanlar: PROF. DR. MUSTAFA YAVUZ KÖKER
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Allerji ve İmmünoloji, Allergy and Immunology
- Anahtar Kelimeler: Neutrophil, Chronic Granulomatous Disease, NADPH oxidase
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Erciyes Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: İmmünoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 145
Özet
KRONİK GRANÜLOMATOZ HASTALIKTA NADPH OKSİDAZ AKTİVİTESİ VE PATOGENEZ İLİŞKİSİNİN YENİ TANISAL YÖNTEMLERLE ARAŞTIRILMASI Nezihe KÖKER Erciyes Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü İmmünoloji Anabilim Dalı İmmünoloji Programı Doktora Tezi, Ocak 2023 Danışman: Prof. Dr. Mustafa Yavuz KÖKER ÖZET Kronik Granülomatoz Hastalık (KGH) nötrofil NADPH oksidaz enzim fonksiyon bozukluğu sonucu sık enfeksiyonla seyreden nadir bir immün yetmezlik hastalığıdır. Çalışmamızda, KGH tanısal sürecindeki karmaşanın azaltılması ve uygulanacak tanısal testlerin akılcı yaklaşım çizelgesi ile doğru bir zamanlamada yapılabilmesi ve otozomal resesif KGH'da en sık mutasyon görülen NCF1 geninin toplum taraması amaçlandı. Bu amaçla İmmünoloji Anabilim Dalına KGH klinik şüphesi ile gelen 42 hasta (37 aile), 80 aile bireyi ve 40 sağlıklı kontrol DHR 123 testi, anti-NADPH oksidaz antikorları, fragment analizi, MLPA ile delesyon tarama ve NGS hastalık ilişkili mutasyon (varyant) taraması ile araştırıldı. Araştırma laboratuvarımıza gelen ve KGH tanısı konulan hastaların 18 inde (%44) X'e bağlı KGH, 23'ünde (%56) ise otozomal resesif KGH bulundu. X-KGH olan 2 hastada, annede taşıyıcılık oluşmayan, de novo mutasyon bulundu. Otozomal resesif KGH hastalarının 9'unda (%21) genscan yöntemi ile NCF1 ekzon 2 GTdel oluşan hotspot mutasyon bulundu. X-KGH grubunda 18 hastadan 15'inde farklı mutasyonlar bulundu. X-KGH hastalarından birinde -65 CYBB gen promotor noktasında yeni bir mutasyon tanımlandı. Elde edilen sonuçlar KGH tanısında DHR testinin etkin bir uygula olduğunu, ancak MPO defektinin ekarte edilmesi gerektiğini ve genscan analizinin bütün KGH hastalarında rutin uygulanması gerektiğini gösterdi. Elde edilen tanısal veriler işlenerek bir KGH tanısal diyagramı oluşturuldu. Ayrıca 100 kişide NCF1 geninde gen/psödogen analizi yapıldı. Ülkemize ait bir veri oluşturuldu. Sonuç olarak, hem 41 KGH hastalarının tanısal süreci tamamlandı, hem de elde edilen deneyim ile tanıda izlenecek güncel iş akış şeması oluşturuldu. Bu diyagram ile KGH tanısal sürecinin doğru, hızlı bir şekilde tamamlanması ve enfeksiyon hastalarında KGH ayırıcı tanısının kolaylaşmasını sağlanabilir. Anahtar kelime: Nötrofil; Kronik granülomatöz hastalık; NADPH oksidaz.
Özet (Çeviri)
INVESTIGATION OF NADPH OXIDASE ACTIVITY AND PATHOGENESIS OF CHRONIC GRANULOMATOUS DISEASE BY NEW DIAGNOSTIC METHODS Nezihe KÖKER Erciyes University, Institute of Health Sciences Department of Immunology Immunology Program Doctoral Thesis, January 2023 Advisor: Prof. Dr. Mustafa Yavuz KOKER ABSTRACT Chronic Granulomatous disease (CGD) is a primary immunodeficiency characterized by defective bacterial and fungi intracellular killing due to NADPH oxidase enzyme dysfunction. In our study, we aimed to set a simple and cost-effective diagnostic workflow to achieve diagnosing CGD patients accurately and early period of life. Also one of the major CGD-causing autosomal gene; NCF1 we screened gene pseudogene ratio in healthy individuals to enlighten pathogenesis of CGD. For this purpose, 42 patients (37 families), 80 family members and 40 healthy control included in our study. DHR 123 tests were performed and then for CGD patients anti-NADPH oxidase subgroup analysis, fragment analysis, deletion detection with MLPA, and mutation (variant) screening by NGS steps were applied. %44 of patients were X-linked CGD and %56 of them were autosomal resessive CGD. In 2 patients with X-CGD, de novo mutation was found which mother was not a carrier. In 9 (21%) of autozomal resessive CGD patients known hotspot mutation (NCF1 ekzon 2 GTdel) detected by genscan method. 15 different mutations were found in 18 X-KGH patients. A new mutation has been identified in one of the X-KGH patients at -65 CYBB promotor point. The results showed that the DHR test was an active application in the KGH diagnostic, but the MPO deficiency should be eliminated and the genscan analysis should be performed routinely on all CGD patients. A diagnostic diyagram was created by processing the diagnostic data obtained. In addition, gene/psodogen analysis was performed in NCF1 genes in 100 people. A data of our country has been created. As a result, the diagnostic process for both CGD patients has been completed and the current workflow scheme to be monitored through the experience obtained has been created. This diyagram can help reduce the cost and accelerate the process to improve the patients quality of life.
Benzer Tezler
- Kronik granülomatöz hastalıkta akan hücre ölçerde belirlenen NADPH oksidaz enzim aktivitesinin ve alt ünitelerinin genotipi öngörmede rolü
Başlık çevirisi yok
HATİCE EZGİ BARIŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2018
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıMarmara ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ELİF KARAKOÇ AYDINER
- Kronik granülamatoz hastalık'ta interferon gamma tedavisinin fagositik hücreler üzerine etkisi
The effect of inf- on phagocytic cells in chronic granulamatous disease
SERKAN FİLİZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2012
Allerji ve İmmünolojiAkdeniz ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. OLCAY YEĞİN
- Kronik granulomatoz hastalık ve alt gruplarının tanısında DHR 123 testi ve anti-NADPH oksidaz komponent antikorlarla akım sitometrik analizin yeri
The place of DHR 123 test and flowcytometric analysis by anti-NADPH oxidase component antibodies in the diagnosis of cgd and in its subgroups
MUSTAFA YAVUZ KÖKER
Doktora
Türkçe
2006
Allerji ve İmmünolojiHacettepe Üniversitesiİmmünoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖZDEN SANAL
- Nadph oksidazın bazı fonksiyonel analiz testleri ve x'e bağlı kronik granulomatoz hastalık tanısında moleküler testler ile uygulaması
Some functional analysis tests of nadph oxidase and application with molecular tests in the diagnosis of x-li̇nked chronic granulomatous disease
ESMA BENTLİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
Allerji ve İmmünolojiErciyes Üniversitesiİmmünoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA YAVUZ KÖKER
- Kronik granülomatöz hastalık moleküler tanısında fragment analizinin uygulanması
Application of fragment analysis in the molecular diagnosis of chronic granulomatous di̇sease
ZEYNEP AKİDAĞI
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
Allerji ve İmmünolojiErciyes Üniversitesiİmmünoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA YAVUZ KÖKER