Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae izolatlarında kolistin direncinin ve heterodirencin araştırılması
Investigation of colistin resistance and heteroresistance in isolates of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae
- Tez No: 780794
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ CANAN ERYILDIZ
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Trakya Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 76
Özet
Çoklu ilaç dirençli bakteriler insanlarda yüksek mortalite ve morbiditeye sebep olması nedeni ile önemli bir halk sağlığı sorunudur. Kolistin, çoğu dirençli gram negatif bakteri için son basamak antibiyotik seçeneği olarak önemli bir konumda yer almaktadır. Bu çalışmanın amacı; E. coli ve K. pneumoniae suşlarında kolistin direnç ve heterodirenç varlığını araştırmak ve bunların genetik ilişkisini incelemektir. Kasım 2020 – Mayıs 2021 tarihleri arasında, TÜSAUM Mikrobiyoloji Laboratuvarı'na klinik ve yoğun bakım ünitelerinden gönderilen idrar, balgam, BOS, periton, plevra, eklem sıvısı, kan kültürü, aspirat, doku biyopsi ve yara sürüntüsü gibi materyallerde üreyen 100 E. coli ve 154 K. pneumoniae olmak üzere toplam 254 izolat çalışmaya dahil edildi. Tüm suşlarda SMD yöntemiyle kolistin duyarlılığı değerlendirildi. E. coli suşlarında kolistin direnci saptanmazken, 25 K. pneumoniae suşunda kolistin direnci saptandı. Kolistin duyarlı saptanan tüm suşlara gradiyent strip test yöntemiyle heterodirenç taraması yapıldı, heterodirençli bakteri saptanmadı. Ayrıca GSBL pozitif ve/veya karbapenem dirençli 8 kolistin duyarlı bakteri, heterodirenç açısından PAP analizi ile değerlendirildi, heterodirençli bakteri saptanmadı. Kolistin dirençli 25 K. pneumoniae suşunda PCR yöntemiyle mcr 1-5 gen bölgeleri araştırıldı, tüm örnekler negatif saptandı. Kolistin MİK değeri yüksek saptanan iki K. pneumoniae suşuna MLST analizi uygulandı, kolistin direncinin yanı sıra penisilin, sefalosporin ve karbapenem direncinin sık görüldüğü ST14 ve ST2096 klonları olduğu saptandı.
Özet (Çeviri)
Multiple drug-resistant bacteria are an important public health problem because it causes high mortality and morbidity in humans. Colistin is in an important position as a last-resort antibiotic option for most of resistant gram-negative bacteria. The aim of this study; is to investigate the presence of colistin resistance and heteroresistance in E. coli and K. pneumoniae strains and examine their genetic relationship. Between November 2020 and May 2021, a total of 254 isolates, including 100 E. coli and 154 K. pneumoniae strains isolated from materials such as urine, sputum, CSF, peritoneum, pleura, joint fluid, blood culture, aspirate, tissue biopsy and wound swab sent from clinical and intensive care units to Microbiology Laboratory of Trakya University Hospital, were included in the study. Colistin susceptibility was evaluated by the BMD method in all strains. While colistin resistance was not detected in E. coli strains, colistin resistance was detected in 25 K. pneumoniae strains. Heteroresistance screening was performed on all colistin-susceptible strains using the gradient strip test method, and no heteroresistant bacteria were detected. In addition, eight ESBL-positive and/or carbapenem-resistant colistin-sensitive strains were evaluated for heteroresistance by the PAP method, heteroresistant bacteria were not detected. mcr 1-5 genes were investigated by PCR method in 25 colistin-resistant K. pneumoniae strains, and all samples were negative. MLST analysis was performed on two K. pneumoniae strains with high colistin MIC values. It was determined that there are ST14 and ST2096 clones in which colistin resistance and penicillin, cephalosporin, and carbapenem resistance are common.
Benzer Tezler
- Karbapeneme dirençli klebsiella pneumoniae suşlarında kolistin direncinin flow sitometri yöntemi ile araştırılması
Carbapenem resistant klebsiella pneumoniae strains' investigation of colistin resistance by flow cytometry
ŞAFAK CEREN UÇAK
Doktora
Türkçe
2023
Mikrobiyolojiİstanbul ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BETİGÜL ÖNGEN
- Karbapenem dirençli klebsıella pneumonıae ve escherıchıa colı suşlarında blaOXA-48, blaKPC, blaIMP, blaVIM ve blaNDM direnç genlerinin araştırılması
Investigation of blaOXA-48, blaKPC, blaIMP, blaVIM ve blaNDM resistance genes on carbapenem resistant klebsiella pneumoniae and escherichia coli strains
AYLİN ÜSKÜDAR GÜÇLÜ
Doktora
Türkçe
2017
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıSağlık Bilimleri ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET BAYSALLAR
- Klinik örneklerden izole edilen escherichia coli, klebsiella pneumoniae ve pseudomonas aeruginosa suşlarında kolistin direnç oranlarının mikrodilüsyon yöntemiyle araştırılması
Investigation of colistin resistance rates in escherichia coli, klebsiella pneumoniae and pseudomonas aeruginosa strains isolated from clinical samples by microdilution method
ELANUR VELİOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıAtatürk ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. OSMAN AKTAŞ
- Genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz üreten escherichia coli ve klebsiella SPP. izolatlarının ertapenem, meropenem, imipenem, kolistin, fosfomisin ve temosilin'e fenotipik duyarlılığının belirlenmesi ve direnç genlerinin in house PCR yöntemiyle araştırılması
Determination of phenotypic susceptibility to ertapenem, meropenem, imipenem, colistin, fosfomycin and temocillin in which producing extended spectrum beta-lactamase isolates of eschericha coli and klebsiella spp. and investigation of resistance genes by in house pcr method
ARZU TANRIVERDİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
MikrobiyolojiAdıyaman ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜLNUR TARHAN
- Plevra sıvısının mikrobiyolojik incelenmesi ve antibiyotik dirençliliği
Microbiological examination of pleural fluid and antibiotic resistance
ESMA GÜLAÇAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
MikrobiyolojiVan Yüzüncü Yıl ÜniversitesiEczacılık Temel Bilimleri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GÜLHAN BORA