Genotyping and detection of virulence genes for bacteria isolated from urinary tract infections in Salahuddin Hospital (Iraq)
Salahuddin Hastanesinde (Irak) idrar yolu enfeksiyonlarından izole edilen bakteriler için genotiplendirme ve direnç genlerinin tespiti
- Tez No: 781080
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ İLKER ŞİMŞEK, DR. ÖĞR. ÜYESİ RAFEA ZAİDAN ALSUGMIANY
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 80
Özet
Bu çalışma, Irak'ta Salahuddin Hastanesinde 2022 yılı içerisinde, idrar yolu enfeksiyonunun mikrobiyal patojenlerinin tespiti ile ilgilidir. Yaşları 2 ile 70 arasında değişen 120 idrar yolu enfeksiyonlu kişiden idrar örneklerinin toplandığı, mikroskobik incelemeler ve biyokimyasal testler yapılarak idrar yolu enfeksiyonuna neden olan (90) örneği (E. coli, S. aureus ve P. mirabilis) elde edilmiştir ve demografik olarak dağıtılmıştır.14 farklı antibiyogram diske 90 örnek için bir antibiyotik duyarlılık testi yapılmıştır. E. coli, S. aureus ve P. mirabilis amikasin, nitrofenil ve imipenem'e karşı en yüksek direnç gerçekleştirilmiştir, fakat amoksisilin, penisilin ve sefiksim'e duyarlıdır. Polimeraz zincir reaksiyonu (PCR), daha önce izole edilmiş olan aşağıdaki bakterilerin (E. coli, S. aureus ve P. mirabilis) her biri için önceden tanımlanmış olan dört direnç geni (coA, rsbA, fimH ve cnf1) için gerçekleştirilmiştir. Daha sonra DNA dizileri yöntemi kullanılarak 16S rRNA dizileri çalışıldı ve tüm sonuçlar NCBI programında kaydedilenlerle aynıdır. Bu çalışmadan, E. coli bakterilerinin en yüksek idrar yolu enfeksiyonu insidansına ve aynı zamanda en yüksek antibiyotik direnci oranlarına ulaştığı sonucuna varılmıştır. Bunu S. aureus ve P. mirabilis izlemiştir. Bu nedenle, hastane ortamlarındaki son zamanlarda artan bu bakterileri kontrol etmek için yapılacak araştırmaların modern yöntemlere ve kontrol yöntemlerine odaklanması önerilmektedir.
Özet (Çeviri)
This study is about the detection of microbial pathogens of urinary tract infection at Salah Al-Din General Hospital in Iraq in 2022. Urine samples were collected from 120 people with urinary tract infections aged between 2 and 70 years, after microscopic examinations and biochemical tests were performed to obtain (90) specimens (E.coli, Staphylococcus aureus and P. mirabilis) causing urinary tract infection and demographically has been distributed. An antibiotic susceptibility test was performed on 14 different antibiogram discs,90 specimens, E.coli, S.aureus and proteus mirabilis had the highest resistance to amikacin, nitrophenyl and imipenem, but were sensitive to amoxicillin, penicillin and cefixime. Polymerase chain reaction (PCR) was performed for four previously identified resistance genes (coA, rsbA, fimH and cnf1) for each of the following bacteria (E.coli, S.aureus and P. mirabilis) that were previously isolated.16S rRNA sequences were then studied using the DNA sequences method and all results were identical to those recorded in the NCBI program. From this study, we concluded that E. coli bacteria had the highest incidence of urinary tract infections as well as the highest rates of antibiotic resistance, it was for E. coli bacteria, followed by S. aureus and then P. mirabilis. For this reason, it is recommended that research to control these bacteria, which has increased recently in the hospital community, should focus on modern methods and control methods in hospitals.
Benzer Tezler
- Irak Salah Eldin Hastanesinde farklı kaynaklardan izole edilen Staphylococcus spp. direnç genlerinin genotiplendirilmesi ve tespiti
Genotyping and detection of Staphylococcus spp. resistance genes isolated from different sources at Salah Eldin Hospital–Iraq
ALHAMZAH QAHTAN NAJI NAJI
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MELDA DÖLARSLAN
DR. ÖĞR. ÜYESİ RAFEA ZAİDAN MUKHİLF ALSUGMAINY
- Sığır mastitisi ve çevresel kaynaklı klebsiella pneumoniae suşlarının virulans faktörlerinin belirlenmesi
Determination of virulence factors of bovine mastitis and environmentally originated klebsiella pneumoniae strains
MEVLÜT ATALAY
Doktora
Türkçe
2023
Veteriner HekimliğiSelçuk ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. UÇKUN SAİT UÇAN
- Isoӏation molecular identification of Salmoneӏla typhemurium from Iraqi patients/Babylon
Irak/Babil'deki hastalardan Salmonella typhemurium'un izole moleküler tanımlanması
AHMED YOUNUS HASAN HOOGY
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ YAŞAR KEMAL YAZGAN
PROF. DR. AӏYAA SAAD ABED KARKOSH
- Sinop ilinde satışa sunulan gıdalardan izole edilen bakterilerin antibiyotik direnç genlerinin belirlenmesi
Detection of antibiotic resistance genes of isolated bacteria from foods offered for sale in the sinop province
SEYHAN CİVEK
- Investigation of ndm enzymes in Escherichia Coli in women and infant children with urinary tract infection in Diyala / Iraq
Diyala / Irak'ta idrar yolu enfeksiyonu olan kadın ve bebek çocuklarda Escherichia Coli' de NDM enzimlerinin araştırılması
SAHAR MEZHER ASSI AL-OBAIDI
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ OKAN ÜRKER