Geri Dön

Staphylococcus aureus izolatlarinin biyokimyasal ve moleküler olarak tanımlanması, PVL geninin saptanması

Biochemical and molecular identifiction of staphylococcus aureus isolatles detection of PVL gene

PDF İndir

  1. Tez No: 783703
  2. Yazar: DHUHA YAHYA RAHEEM RAHEEM
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SEÇİL AKILLI ŞİMŞEK, PROF. DR. NAJWA SHİHAB AHMED AL-SAMARİA
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 80

Özet

Bu çalışma, Irak hastanelerindeki yara ve yanık hastalarında Staphylococcus aureus'un antibiyotik direnci ile ilgili risk faktörlerini belirlemeyi ve bu virülansı PVL geni ile ilişkilendirmeyi amaçlamaktadır. Al-Yarmuk Genel Eğitim ve Bağdat Tıp Şehri Hastanesi'nde yanık ve yara enfeksiyonu olan hastalardan 200 klinik örnek alınmıştır. Bunların incelenmesi sonucunda 103 örnekte S. aureus belirlenmiştir. 50 örnek biyokimyasal olarak test edilirken kalan 53'ü VITEK2 sistemi kullanılarak tanımlanmıştır. VITEK2 sisteminde antimikrobiyal duyarlılık testi için dört antibiyotik kullanılmıştır. İncelenen izolatların, Sefoksitin (% 100), Benzilpenisilin (% 96,2), Oksasilin (% 94,3) dirençli ve Gentamisin'e (% 96,2) duyarlı olduğunu ve tüm izolatların Metisiline Dirençli olduğu tespit edilmiştir. 16S rRNA geninin saptanması ve PVL virülans geni'nin saptanması için 53 izolatta Staphylococcus aureus'un moleküler tanımlaması için geleneksel PCR yapılmıştır. Bunun sonucunda test edilen izolatlarda 16S rRNA (% 100) ve PVL (% 35,8) agaroz jelde görüntülenmiştir. Daha sonra 16SrRNA geni için 12 bakteri izolatına ve PVL geni için 5 bakteri izolatına dizileme uygulanmış, ve NCBI'deki dizilim 16S rRNA geni %99 ve PVL geni %99 özdeşliklerini göstermiştir. Daha sonra Gerçek zamanlı PCR uygulandı. PVL prevalansı %41.5 idi. PVL'nın kat geni ekspresyonu 2,1, 16S rRNA'nın ise 0,8 olarak bulunmuştur. PVL önceki çalışmalara göre MRSA klinik izolatlarında daha yüksek prevalansa sahip olduğu ve MRSA'nın virülans ve patojenitesini arttırdığı, ayrıca bu MRSA'ların test edilen antibiyotiklere karşı yüksek çoklu ilaç direncine sahip olduğu sonucuna varılmıştır.

Özet (Çeviri)

This study aimed to identify the risk factors for wounds and burns patients in Iraq hospitals by antibiotic resistance of Staphylococcus aureus, and relate that virulence to their associated with PVL gene. 200 clinical samples were taken from patients with burns and wound infections at Al-Yarmuk General Education and Baghdad Medical City Hospital. As a result of their examination, Staphylococcus aureus was determined in 103 samples. While 50 samples were tested biochemically, the remaining 53 were identified using the VITEK2 system. Four antibiotics were used for antimicrobial susceptibility testing in the VITEK2 system. It was determined that the examined isolates were resistant to Cefoxitin (100 %), Benzylpenicillin (96.2 %), Oxacillin (94.3 %) and sensitive to Gentamicin (96.2 %), and all isolates were Methicillin-Resistant. Conventional PCR was performed for the molecular identification of S. aureus in 53 isolates for the detection of the 16S rRNA gene and the detection of the PVL virulence gene. As a result, 16S rRNA gene (100 %) and PVL gene (35.8 %) were visualized on agarose gel in tested isolates. Then, sequencing was applied to 12 bacterial isolates for the 16SrRNA gene and 5 bacterial isolates for the PVL gene, which gave positive results for two genes, and the alignment in the NCBI showed identities of 16SrRNA gene 99% and PVL gene 99% with global isolates of Staphylococcus aureus. Real-time PCR was applied for the detection of PVL genes in 53 isolates. The prevalence of the PVL gene was 41.5%. The fold gene expression of the PVL gene was 2.1 and the 16SrRNA was 0.8. In this study, it was concluded that the PVL virulence gene, which has a role in leukocyte lysis and tissue necrosis, has a higher prevalence in Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus clinical isolates compared to previous studies and increases the virulence and pathogenicity of MRSA, as these MRSA had high multidrug resistance to the tested antibiotics.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    343980

    Alüminyum ve baryum dirençli çevre izolatlarının moleküler karakterizasyonu

    Molecular characterization of environmental isolates resistant to aluminium and barium

    GAMZE SERİM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    BiyolojiKırıkkale Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYSUN ERGENE

    DOÇ. DR. BÜLENT İÇGEN

  2. Tez No

    887954

    Molecular identification and antimicrobial resistance profiles of Escherichia coli isolated in urine cultures from Shamiya State Hospital (Iraq)

    Şamiye Devlet Hastanesi (Irak) idrar kültürlerinden izole edilen Escherichia coli'nin moleküler tanımlanması ve antimikrobiyal direnç profilleri

    ALI HAMEED NEAMAH ALHUSSEINI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    MikrobiyolojiAfyon Kocatepe Üniversitesi

    Moleküler Biyokimya ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET OĞUZ ÖZTÜRK

  3. Tez No

    780201

    Güney Irak'ta gebe kadınlarda idrar yolu enfeksiyonuna neden olan bakterilerin izolasyonu ve antibiyotik direnç genlerinin moleküler teknikler ile tanımlanması

    The isolation and identification of bacteria causing urinary tract infection in pregnant women and the identification of antibiotic resistance genes by molecular technique in Southern Iraq

    MUQDAD JABBAR ALI AL-RIKABI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ŞİNASİ AŞKAR

    DR. ÖĞR. ÜYESİ WİSAM JASİM ABED ALI

  4. Tez No

    487899

    Muş yöresindeki mastitisli sütlerden Staphylococcus aureus ve Pseudomonas aeruginosa izolasyonu ve plazmit içeriklerinin belirlenmesi

    Isolation of Staphylococcus aureus ve Pseudomonas aeruginosa from mastitis milk in Mus region and determination of plasmid content

    NİMETULLAH AKCAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    BiyolojiMuş Alparslan Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. YUSUF ALAN

  5. Tez No

    815695

    Molecular study of the biofilm formation associated with methicillin-resistance of Staphylococcus aureus isolated from clinical samples

    Klinik örneklerden izole edilen Staphylococcus aureus'un metisiline direnci ile ilişkili biyofilm oluşumunun moleküler çalışması

    MUSTAFA SAHIB ABS ABS

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. IRMAK POLAT

    PROF. DR. HASANAİN KHALEEL IBRAHİM SHAREEF

Geri Dön