Geri Dön

Şerbetçi otu ve turunçgil bitkilerinde bulunan viroidlerin araştırılması, biyolojik, moleküler karakterizasyonu ve bu bitki gruplarında viroid gen bankası oluşturulması

Study of viroids in hop plants and citrus plants, biological and molecular characterization of these viroids and formation of a gene bank

  1. Tez No: 783875
  2. Yazar: PAKİZE GÖK GÜLER
  3. Danışmanlar: PROF. DR. NÜKET ÖNELGE
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Ziraat, Agriculture
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Çukurova Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 186

Özet

Bu çalışma; 2016-2018 yılları arasında Adana, Hatay, Mersin ve Osmaniye illerinde Turunçgil üretimi yapılan alanlarda ve Bilecik ili Pazaryeri ilçesi Şerbetçi otu üretimi yapılan alanlarda viroid hastalık etmenlerinin varlığını tespit etmek amacıyla gerçekleştirilmiştir. Güdümlü survey çalışmaları ile toplanan örneklerde moleküler karakterizasyon çalışmaları yürütülmüştür. Çalışma kapsamında, turunçgil örneklerinin Citrus exocortis viroid (CEVd), Citrus bent leaf viroid (CBLVd), Hop stunt viroid (CVd II) (CCaVd: Cachexia ve HSVd: Non-Cachexia), Citrus dwarfing viroid (CDVd; CVd III), Citrus bark cracking viroid (CBCVd: CVd-IV), Citrus viroid V (CVd-V), Citrus viroid VI (CVd-VI) viroidleri ile ve Şerbetçi otu örneklerinin Hop latent viroid (HLVd) ve Hop stunt viroid (HSVd) viroidleri ile enfekteli olduğu her etmene ait spesifik primerler ile RT-PCR yöntemleri ile tanılanmiştir. Turunçgil viroidleri açısından incelenen örneklerin Adana'da %70, Mersin'de %78, Hatay'da %77,5 ve Osmaniye'de %80 oranında kontamine olduğu RT-PCR analizi ile belirlenmiştir. Şerbetçi otu bitkilerinde Bilecik'in Pazaryeri ilçesinden toplanan 214 örneğin %66'sı HLVd, %23,8'i HSVd ile enfekteli olduğu tespit edilmiştir. Moleküler olarak tanımlanmış ve nükleotid dizilimleri belirlenen izolatlar, NCBI kayıtlı izolatlarla %96-99 benzerlik göstermiştir. Bu çalışmada tanımlanan dizilimler, NCBI gen bankasına kaydedilmiştir. Bu çalışmada belirlenen HLVd ülkemiz için ilk kayıt olarak bildirilmiştir.

Özet (Çeviri)

This study was carried out to determine the latest status of citrus viroid agents in citrus growing areas of Adana, Hatay, Mersin, Osmaniye between 2016-2019 and to investigate for the first time viroid disease agents in hops production areas in Pazaryeri districts of Bilecik province. In the other part of the study, identification and molecular characterization of the obtained isolates were performed. Within the scope of the study, all viroid pathogens found in citrus and hop plants were investigated with agent-specific primers. Respectively, were determined in the isolates examined by RT-PCR method. Citrus exocortis viroid (CEVd), Citrus bent leaf viroid (CBLVd), Hop stunt viroid (CVd II), CCaVd: Cachexia and HSVd: Non-Cachexia, Citrus dwarfing viroid (CDVd; CVd III), Citrus bark cracking viroid (CBCVd), Citrus viroid V (CVd-V), Citrus viroid VI (CVd-VI), Hop latent viroid (HLVd) and Hop stunt viroid (HSVd) were found on examined isolates. It was determined by RT-PCR analysis that the samples examined in terms of citrus viroids were 70% contaminated in Adana, 78% in Mersin, 77.5% in Hatay, and 80% in Osmaniye. In hop plants, 66% of 214 samples collected from Pazaryeri district of Bilecik were infected with HLVd and 23.8% with HSVd. Molecularly identified and sequenced isolates showed 96-99% similarity with the NCBI registered isolates. Sequences identified in this study were registered in the NCBI gene bank. HLVd was reported as the first record for our country.

Benzer Tezler

  1. Sustainable strategies to obtain protein from brewery wastes and evaluation of film forming properties

    Malt atıklarından protein eldesi ve proteinin biyobozunur film üretiminde değerlendirilmesi

    HANDE YENİPAZAR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    Gıda Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NEŞE ŞAHİN YEŞİLÇUBUK

  2. Gelir dağılımı dengesizliğini azaltmada piyasa ekonomisi çözümleri

    Market economy solutions in reducing the imbalance of income distribution

    EMİNE ATEŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    EkonomiAfyon Kocatepe Üniversitesi

    Maliye Ana Bilim Dalı

    PROF. İSA SAĞBAŞ

  3. Malatya ili meyve ağaçlarında şerbetçi otu cücelik ve şeftali latent mozaik viroidlerinin araştırılması ve tespit edilen izolatların moleküler karakterizasyonu

    Investigation of hop stunt and peach latent mosaic viroids in fruit trees in Malatya province and the molecular characterization of the identified isolates

    FEYZA TUNCEL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    ZiraatMalatya Turgut Özal Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HİKMET MURAT SİPAHİOĞLU

  4. Saccharomyces boulardii ve escherichia coli nissle 1917 kullanılarak probiyotik bira üretimi

    Probiotic beer production with saccharomyces boulardii and escherichia coli nissle 1917

    EMİN EMİRLEROĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Gıda MühendisliğiEge Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HATİCE KALKAN YILDIRIM

  5. Humulus lupulus (şerbetçi otu) su ekstraktı ile biyolojik (green) sentez yöntemiyle magnezyum nanopartikül sentezi ve antioksidan, antimikrobiyal, antikanser gibi biyolojik aktivitelerinin belirlenmesi

    Magnesium nanoparticle synthesis with Humulus lupulus (hop) water extract and biological (green) synthesi̇s method and determination of biological activities such as antioxidant, antimicrobial, anticancer

    ÖZGÜR BAYNAL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    BiyoteknolojiBingöl Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ BÜLENT KAYA