Şerbetçi otu ve turunçgil bitkilerinde bulunan viroidlerin araştırılması, biyolojik, moleküler karakterizasyonu ve bu bitki gruplarında viroid gen bankası oluşturulması
Study of viroids in hop plants and citrus plants, biological and molecular characterization of these viroids and formation of a gene bank
- Tez No: 783875
- Danışmanlar: PROF. DR. NÜKET ÖNELGE
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Gen bankası, Moleküler karakterizasyon, Turunçgiller, Viroidler, Şerbetçiotu, Gene bank, Molecular Characterisation, Citrus fruits, Viroids, Hops
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çukurova Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışma; 2016-2018 yılları arasında Adana, Hatay, Mersin ve Osmaniye illerinde Turunçgil üretimi yapılan alanlarda ve Bilecik ili Pazaryeri ilçesi Şerbetçi otu üretimi yapılan alanlarda viroid hastalık etmenlerinin varlığını tespit etmek amacıyla gerçekleştirilmiştir. Güdümlü survey çalışmaları ile toplanan örneklerde moleküler karakterizasyon çalışmaları yürütülmüştür. Çalışma kapsamında, turunçgil örneklerinin Citrus exocortis viroid (CEVd), Citrus bent leaf viroid (CBLVd), Hop stunt viroid (CVd II) (CCaVd: Cachexia ve HSVd: Non-Cachexia), Citrus dwarfing viroid (CDVd; CVd III), Citrus bark cracking viroid (CBCVd: CVd-IV), Citrus viroid V (CVd-V), Citrus viroid VI (CVd-VI) viroidleri ile ve Şerbetçi otu örneklerinin Hop latent viroid (HLVd) ve Hop stunt viroid (HSVd) viroidleri ile enfekteli olduğu her etmene ait spesifik primerler ile RT-PCR yöntemleri ile tanılanmiştir. Turunçgil viroidleri açısından incelenen örneklerin Adana'da %70, Mersin'de %78, Hatay'da %77,5 ve Osmaniye'de %80 oranında kontamine olduğu RT-PCR analizi ile belirlenmiştir. Şerbetçi otu bitkilerinde Bilecik'in Pazaryeri ilçesinden toplanan 214 örneğin %66'sı HLVd, %23,8'i HSVd ile enfekteli olduğu tespit edilmiştir. Moleküler olarak tanımlanmış ve nükleotid dizilimleri belirlenen izolatlar, NCBI kayıtlı izolatlarla %96-99 benzerlik göstermiştir. Bu çalışmada tanımlanan dizilimler, NCBI gen bankasına kaydedilmiştir. Bu çalışmada belirlenen HLVd ülkemiz için ilk kayıt olarak bildirilmiştir.
Özet (Çeviri)
This study was carried out to determine the latest status of citrus viroid agents in citrus growing areas of Adana, Hatay, Mersin, Osmaniye between 2016-2019 and to investigate for the first time viroid disease agents in hops production areas in Pazaryeri districts of Bilecik province. In the other part of the study, identification and molecular characterization of the obtained isolates were performed. Within the scope of the study, all viroid pathogens found in citrus and hop plants were investigated with agent-specific primers. Respectively, were determined in the isolates examined by RT-PCR method. Citrus exocortis viroid (CEVd), Citrus bent leaf viroid (CBLVd), Hop stunt viroid (CVd II), CCaVd: Cachexia and HSVd: Non-Cachexia, Citrus dwarfing viroid (CDVd; CVd III), Citrus bark cracking viroid (CBCVd), Citrus viroid V (CVd-V), Citrus viroid VI (CVd-VI), Hop latent viroid (HLVd) and Hop stunt viroid (HSVd) were found on examined isolates. It was determined by RT-PCR analysis that the samples examined in terms of citrus viroids were 70% contaminated in Adana, 78% in Mersin, 77.5% in Hatay, and 80% in Osmaniye. In hop plants, 66% of 214 samples collected from Pazaryeri district of Bilecik were infected with HLVd and 23.8% with HSVd. Molecularly identified and sequenced isolates showed 96-99% similarity with the NCBI registered isolates. Sequences identified in this study were registered in the NCBI gene bank. HLVd was reported as the first record for our country.
Benzer Tezler
- Şerbetçi otu atığından selüloz elde edilmesi ve yenilebilir film formülasyonlarında kullanımının incelenmesi
Extraction of cellulose from spent hops and investigation of its use in edible film formulations
ZEYNEP AKGÜN
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Gıda Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ CELALE KIRKIN GÖZÜKIRMIZI
- Humulus lupulus (şerbetçi otu) su ekstraktı ile biyolojik (green) sentez yöntemiyle magnezyum nanopartikül sentezi ve antioksidan, antimikrobiyal, antikanser gibi biyolojik aktivitelerinin belirlenmesi
Magnesium nanoparticle synthesis with Humulus lupulus (hop) water extract and biological (green) synthesi̇s method and determination of biological activities such as antioxidant, antimicrobial, anticancer
ÖZGÜR BAYNAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
BiyoteknolojiBingöl ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ BÜLENT KAYA
- Kekik ve şerbetçi otu içeren yenilebilir filmlerin hamburgerlerin bazı mikrobiyal ve fizikokimyasal özellikleri üzerine etkisi
The effect of edible films containing thyme and hops on some microbial and physicochemical properties of hamburgers
HATİCE SENA OLCAY
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Gıda MühendisliğiSelçuk ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CEMALETTİN SARIÇOBAN
- Bazı şifalı bitkilerin ekonomiye kazandırılması: Şerbetçi otu (Humulus lupulus L.) bitkisinin antioksidan, sitotoksik, enzim aktif özüt ve bileşenlerinin belirlenmesi
Identification of antioxidant, cytotoxic, enzyme active components from Humulus lupulus L. extracts
FERAH CÖMERT
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
KimyaÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET AY
- Malatya ili meyve ağaçlarında şerbetçi otu cücelik ve şeftali latent mozaik viroidlerinin araştırılması ve tespit edilen izolatların moleküler karakterizasyonu
Investigation of hop stunt and peach latent mosaic viroids in fruit trees in Malatya province and the molecular characterization of the identified isolates
FEYZA TUNCEL
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
ZiraatMalatya Turgut Özal ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HİKMET MURAT SİPAHİOĞLU