Geri Dön

Klinik gram negatif bakterilerde virulans faktör genleri ile biyofilm oluşumlarının belirlenmesi ve rumex gümüş nanopartikülünün antibiyofilm aktivitesinin araştırılması

Determination of virulence factor genes and biofilm formations in clinical gram negative bacteria and investigation of antibiofilm activity of rumex silver nanoparticle

PDF İndir

  1. Tez No: 784438
  2. Yazar: GAMZE YÜKSEL
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. AZER ÖZAD DÜZGÜN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Gümüşhane Üniversitesi
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 72

Özet

Çeşitli örneklerden 188 Gram negatif bakteri izole edilmiş ve antibiyotik duyarlılık testleri yapılmıştır.188 suşta, sınıf 1 integron, virülans ve antibiyotik direnç genlerinin varlığı PCR ile araştırıldı. blaOXA-23 ve blaOXA-51 genleri pozitif olan örnekler, pGEM-T vektörüne klonlandı ve plazmitler, DNA dizi analizine gönderildi. Suşların biyofilm oluşturma kapasiteleri ve Rumex gümüş nanopartikülün antibiyofilm etkisi kantitatif olarak belirlendi. İzolatlarda sırasıyla aer (%29.78), sfa (%28.19), afa (%27.12), cnf (%21.27), pap (%12.76) ve hly (%12.76) virulans faktör genleri bulundu. Sınıf 1 integronlar suşlar arasında yüksek oranda (%88.82) tespit edildi. İzolatların %46.27'sinin biyofilm oluşturma yeteneğine sahip olduğu belirlendi. PMQR genleri, 15 izolatta tespit edildi. 16 suşta blaOXA-23 geni, 19 izolatta ise blaOXA-51 geni tespit edildi. Bu çalışmada Türkiye'den ilk kez hem blaOXA-23 hem de blaOXA-51 genlerini taşıyan klinik K. oxytoca izolatı tanımlandı. Rumex gümüş nanoparçacıklarının (NP'ler), orta ve güçlü biyofilm oluşturma kabiliyetine sahip farklı izolatlara karşı antibiyofilm aktivitesi gösterdiği ortaya çıktı. NP'ler, 2.66 kat A. baumannii'nin, 3.25 kat K. pneumonaie'nin ve 1.25 kat E.coli'nin biyofilm oluşturma kapasitesini azalttığı gözlemlendi. Mikrobiyal biyofilmin araştırılması, tedavi seçenekleri için yeni stratejiler geliştirmede önemli bir rol oynayabilir. Sonuç olarak, ciddi enfeksiyonlara neden olan antibiyotiğe dirençli Gram negatif patojenlerin tedavi seçeneklerinin sınırlı olması halk sağlığı açısından önemli bir sorun olduğundan, bu patojenlerde antibiyotik direnci, virülans faktör genleri ve biyofilm oluşumunun araştırılması önemlidir.

Özet (Çeviri)

188 Gram-negative bacteria were isolated from various samples and antibiotic susceptibility testing were performed. 188 strains were screened by PCR for class 1 integron, virulence and antibiotic resistance genes. blaOXA-23 and blaOXA-51 genes positive samples were cloned into the pGEM-T vector and the plasmids were sent for DNA sequence analysis. The biofilm forming capacities of the strains and the antibiofilm effect of Rumex silver nanoparticle were quantitatively determined. Virulence factor genes were found in the isolates aer (29.78%), sfa (28.19%), afa (27.12%), cnf (21.27%), pap (12.76%) and hly (12.76%), respectively. Class 1 integron was detected high rate (88.82%) among strains. The observed that 46.27% of the isolates had the ability to form biofilms. PMQR genes were detected 15 strains. blaOXA-23 gene was detected in 16 and blaOXA-51 gene in 19 isolates.In this study, clinical isolate K. oxytoca carrying both blaOXA-23 and blaOXA-51 genes was identified first time from Turkey. Rumex silver nanoparticles (NPs) were revealed to exhibit antibiofilm activity against different isolates with moderate and strong biofilm-forming ability. The NPs reduced the biofilm-forming capacity of A. baumannii and K. pneumonaie by 2.66-fold and 3.25-fold, whereas they decreased the E.coli biofilm-forming capacity by 1.25-fold. The investigation of microbial biofilm could play an important role in developing new strategies for treatment options. In conclusion since the limited treatment options of antibiotic-resistant Gram-negative pathogens that cause serious infections are an important problem in terms of public health it is important to investigate antibiotic resistance, virulence factor genes and biofilm formation in these pathogens.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    766449

    Study some virulence characteristics of multidrug resistant biofilm forming acinetobacter Baumannii isolated from clinical sites

    Çoklu ilaçlara dayanıklı biyofilm oluşturan asinetobakter Baumannıı'nin klinik sitelerden izol edilmiş bazı virülans özelliklerinin çalışması

    ZAINAB MOHAMMED MAHMOOD AL-MASHHADANI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ RAMAZAN SERDAR ESMER

    PROF. DR. SUHAD SAAD MAHMOOD

  2. Tez No

    688560

    İdrar yolu enfeksiyonu olan hastalardan izole edilen klebsiella pneumoniae ve escherichia coli bakterilerinin antibiyotik direncinin moleküler açıdan değerlendirilmesi

    The molecular study for evaluation of antibiotic resistance of klebsiella pneumoniae and escherichia coli bacteria isolated from patients with urinary tract infection

    WASAN JASIM MOHAMMED AL-MAHFOODH

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ FİLİZ SARIKAYA PEKACAR

  3. Tez No

    823936

    Investigation of helicobacter pylori virulence genes and t-cell responses in pediatric gastritis patients

    Pediatrik gastrit hastalarında helikobakter pylori virülans genleri ve t-hücre cevaplarının araştırılması

    NİRAN ÖZDEMİR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    Allerji ve İmmünolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYÇA SAYI YAZGAN

    DR. ÖĞR. ÜYESİ SİNEM ÖKTEM OKULLU

  4. Tez No

    419885

    Mastitisli sütlerden izole edilen escherichia coli suşlarında virülens genlerin araştırılması

    Investigation of virulence genes of escherichia coli isolated from mastitis milk

    NERGİZ VURUCU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    MikrobiyolojiAdnan Menderes Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SERAP SAVAŞAN

  5. Tez No

    343629

    Endüstriyel sistemlerde istenmeyen biyofilmlere neden olan gram negatif bakterilerin virülans faktörlerinin ve quorum sensing ile ilişkisinin araştırılması

    Investigation of relation between quorum sensing and virulence factors of unwanted biofilm-forming gram negati̇ve bacteria in industrial systems

    ZÜHAL ZORLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    BiyolojiMuğla Sıtkı Koçman Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NUR CEYHAN GÜVENSEN

Geri Dön