Geri Dön

Kıl, tiftik, honamlı ve kilis keçi ırklarında miyojenik faktör 5 ve 6 genlerinin ekspresyon seviyelerinin belirlenmesi

Determination of expression levels of myogenic factor 5 and 6 genes in hair, angora, honamli and kilis goat breeds

PDF İndir

  1. Tez No: 790928
  2. Yazar: BÜŞRA BAYRAK
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. UĞUR ŞEN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Ziraat, Biotechnology, Agriculture
  6. Anahtar Kelimeler: Yerli ırklar, MDF gen ailesi, İskelet kası, Et üretimi, Oğlak, Native breeds, MDF gene family, Skeletal muscle, Meat production, Kid
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Hayvansal Biyoteknoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 45

Özet

Miyojenik düzenleyici faktörler (MDF) ailesinden olan miyojenik faktör 5 (Myf5) ve miyojenik faktör 6 (Myf6) genleri, iskelet kası miyogenezinin ana düzenleyicisi olarak görev yapmakta olup kas lifi gelişimini ve farklılaşmasını düzenleyen genler arasında yer almaktadır. Dolayısıyla bu çalışmanın amacı, 90 günlük sütten kesim yaşındaki Honamlı (n=6), Kıl (n=6), Kilis (n=6) ve Tiftik (n=6) oğlaklarının longissimus dorsi (LD) ve semitendinosus (ST) iskelet kaslarındaki Myf5 ve Myf6 genlerinin ekspresyon seviyesinin belirlenmesidir. Kas örneklerinden ticari RNA saflaştırma kiti ile RNA izole edilmiştir. RNA'nın saflığı ve miktarı NanoDrop™ 2000/2000c spektrofotometre kullanılarak ölçüldü ve RNA kalitesi %1'lik agaroz jel ile kontrol edilmiştir. RNA, Thermal Cycler cihazında ticari cDNA kiti kullanılarak cDNA'ya dönüştürülmüştür. LD ve ST iskelet kaslarındaki Myf5 ve Myf6 gen ekspresyon seviyesi, gerçek zamanlı kantitatif polimeraz zincir reaksiyonu ile belirlendi. LD kasında Honamlı oğlakları daha fazla (P < 0.05) Myf5 gen ifade düzeyine (159,8 ± 14,6 kat değişim) sahipken, Kıl oğlakları en düşük (P < 0.05) Myf5 gen düzeyine (42,0 ± 14,9 kat değişiklik) sahipdi. Benzer şekilde ST kasında Myf 5 geninin ekspresyon seviyeleri Kıl oğlaklarında (57,2 ± 6,6 kat değişim), Tiftik oğlakları hariç, Honamlı (98,4 ± 9,2 kat değişim) ve Kilis ırkına (80,7 ± 6,8 kat değişim) göre daha düşük (P < 0.05) gen ekspresyon seviyesine sahip oldukları tespit edilmiştir. Çalışmada LD kasında Myf 6 geninin ekspresyon seviyesi Kilis oğlaklarında (12,0 ± 2,9 kat değişim), Honamlı (44,5 ± 11,3 kat değişim), Kıl (34,2 ± 7,5 kat değişim) ve Tiftik (39,8 ± 10,1 kat değişim) oğlaklarına göre daha düşük (P < 0.05) olduğu tespit edilmiştir. Çalışmada ST kasında Myf 6 geninin ekspresyon seviyesi bakımında ırklar arasında istatistiki olarak önemli farklılıklar olup, en yüksek (P < 0.05) Myf 6 gen ekspresyon seviyesi Honamlı ve Tiftik oğlaklarında, en düşük (P < 0.05) gen ekspresyon seviyesi ise Kıl ve Kilis oğlaklarında tespit edilmiştir. Bu çalışmanın sonuçları, Honamlı oğlaklarının Myf5 ve Myf6 gen ekspresyon seviyesinin daha yüksek olması nedeniyle daha yüksek kas büyümesine sahip olabileceğini ve bu ırkın daha verimli bir besi uygulaması için önerilebileceğini göstermiştir. Ayrıca, Kilis oğlak ırklarının Myf6 gen ekspresyon seviyelerinin düşük olması nedeniyle daha düşük kas büyümesine sahip olabileceğini göstermiştir. Sonuç olarak, Türk yerli keçi ırklarının Myf5 ve Myf6 gen ekspresyon seviyelerine sahip olduğu ve bu farklılıkların besi uygulamaları için daha verimli ırklar seçmek için kullanılabileceği sonucuna varılmıştır.

Özet (Çeviri)

Myogenic factor 5 (Myf5) and myogenic factor 6 (Myf6) genes, which are member of myogenic regulatory factors (MRFs) family, serve as the main regulators of skeletal muscle myogenesis and these genes that regulate muscle fiber development and differentiation. Therefore, the aim of this study was to investigate the expression level of Myf5 and Myf6 genes in longissimus dorsi (LD) and semitendinosus (ST) skeletal muscles of 90-day weaning age Honamlı (n=6), Hair (n=6), Kilis (n=6) and Angora (n=6) kids. RNA was isolated from muscle samples with a commercial RNA purification kit. The purity and amount of RNA was measured using the NanoDrop™ 2000/2000c spectrophotometer and the RNA quality was checked with a 1% agarose gel. RNA was converted to cDNA using a commercial cDNA kit in a Thermal Cycler device. The Myf5 and Myf6 gene expression level in LD and ST skeletal muscles was determined by real-time quantitative polymerase chain reaction. Honamli kids had higher (P < 0.05) Myf5 gene expression level (159.8 ± 14.6 fold change) in LD muscle, while Hair kids had the lowest (P < 0.05) Myf5 gene level (42.0 ± 14.9 fold change) in LD muscle. Similarly, expression levels of Myf 5 gene in ST muscle were lower (P < 0.05) in Hair kids (57.2 ± 6.6 fold), except for Angora, than those of Honamlı (98.4 ± 9.2 fold change) and Kilis breeds (80.7 ± 6.8 fold change). In the study, the expression level of Myf 6 gene in LD muscle of Kilis kids (12.0 ± 2.9 fold change) were found lower (P < 0.05) compared to Honamlı (44.5 ± 11.3 fold), Hair (34.2 ± 7.5 fold change) and Angora ( 39.8 ± 10.1 fold change) kids. In the study, there were statistically significant differences between breed in terms of the expression level of Myf 6 gene in ST muscle, the highest (P < 0.05) Myf 6 gene expression levels were found in Honamlı and Angora kids, and the lowest (P < 0.05) gene expression levels were found in Hair and Kilis kids. The results of this study showed that Honamli kids can have higher muscle growth due to higher Myf5 and Myf6 genes expression level and this breed can be recommended for a more efficient fattening application. It also showed that Kilis kid breeds may have lower muscle growth due to low Myf6 gene expression levels. As a result, it was concluded that Turkish domestic goat breeds have Myf5 and Myf6 gene expression levels and these differences can be used to select more productive breeds for fattening practices.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    32635

    Koyun (dağlıç ve karaman) ve keçilerde (kıl ve tiftik) Pancreas'ın histomorfolojik özellikleri üzerinde komparativ araştırmalar

    Başlık çevirisi yok

    VEDAT ONAR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1994

    Morfolojiİstanbul Üniversitesi

    Morfoloji (Anatomi) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TAYYİP ÇALIŞLAR

  2. Tez No

    654425

    Türkiye'de bulunan kilis, tiftik ve kıl ırkı keçilerin kalpain ve kalpastatin genlerindeki mutasyonların incelenmesi

    Research of calpain and calpastatin gene mutations in kilis goat, tiftik goat and kil goat in Turke

    BURHANETTİN BAHADIR KÜÇÜK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Biyokimyaİstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FERAYE ESEN GÜRSEL

  3. Tez No

    618717

    Bazı yerli keçi ırklarında kap 1.1 ve kap 1.3 genlerine ait polimorfizminlerin incelenmesi

    An investigation of polymorphism kap 1.1 and kap 1.3 genes in some indigenous goat breeds

    AYLA FİDAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    ZiraatTekirdağ Namık Kemal Üniversitesi

    Zootekni Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. EMEL ÖZKAN ÜNAL

  4. Tez No

    842930

    Ankara keçilerinde tiftik gelişimini etkileyen genlerin RNA dizileme yöntemiyle belirlenmesi

    Determination of the genes affecting mohair development in angora goats by RNA sequencing

    SENEM ESİN SELÇUK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    GenetikAnkara Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. REYHAN ÇOLAK

    DOÇ. DR. ÖZGE ÖZMEN

  5. Tez No

    460535

    Anadolu'da keçi kılı/tiftik dokumalar ve ekose desen önerilerinin analizi

    Goat hair/mohair weave in Anatolia and analysis of tartan pattern proposals

    LÜTFİYE GÜL GÜNDÜZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Güzel SanatlarMarmara Üniversitesi

    Tekstil Ana Sanat Dalı

    PROF. DR. GÜNAY ATALAYER

Geri Dön