Molecular study of carbapenems resistant Acinetobacter baumannii isolated from clinical
Klinik kaynaklardan izole edilen karbapenemlere dayanıklı Acınetobacter baumannıı'nin moleküler çalışması
- Tez No: 791127
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ŞİNASİ AŞKAR, PROF. DR. NUHA JOSSEF KINDLA
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Acinetobacter baumannii, Antibiyogram, Beta laktamazlar, Genler-blaOXA, Karbapenemaz, Acinetobacter baumannii, Beta lactamases, Genes-blaOXA, Carbapenemase
- Yıl: 2023
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Acinetobacter baumannii nozokomiyal enfeksiyonların en önemli nedenlerinden biridir. Bu tezde, Irak'taki hastanelerden elde edilen farklı klinik örneklerde A.baumannii bakterisinin kültür ve PZR ile tanımlamak, izolatların antibiyotiklere direnç/duyarlılık durumunu ve MIK değerlerini disk difüzyon belirlemek ayrıca karbapenem direnç genlerinin varlığını PZR ile araştırmak amaçlanmıştır. Kültür, biyokimyasal ve PZR test sonuçlarına göre 120 örneğin (yanık, yara, kan, idrar, balgam) 64'ünde (%53,3) A. baumannii identifiye edilmiştir. Antibiyotik duyarlılık testi, 64 örneğin (%53,3) sefotaksim'e %100 oranında en yüksek dirence sahip olduğu ve Ampicillin/ Sulbaktam'a %40,6 oranında en düşük dirence sahip olduğu belirlenmiştir. sonuçlarına göre amikasine karşı izolat 1 ve 2'nin MİK değeri sırasıyla 8 µl/ml ve 2 µl/ml, levofloksasine karşı sırasıyla 512 µl/ml and 16 µl/ml olarak belirlenmiştir. Karbapenem direnci MHT testinde 25 (%50) A. baumannii izolatında, Carba NP testinde 20 (%40) A. baumannii izolatında saptandı. Yapılan PCR testi ile 50 A. baumannii izolatında OXA- 58 geni 2 izolatta (%4,0), blaOXA-51 geni tüm izolatlarda (%100), OXA-40 geni 12 (%24) izolatta, OXA-24 geni 14 (%28) izolatta, OXA-23 geni 36 (%78,1) izolatta, ISA- BAL geni 46 (%90) izolatta belirlenirken, OXA-143 geni belirlenmemiştir.
Özet (Çeviri)
Acinetobacter baumannii is one of the most important causes of nosocomial infections. The aim of this thesis is to identify A. baumannii from different clinical sources in Iraq hospitals by culture and PCR methods, to determine the antibiotic resistance/sensitivity status and minimum inhibitor concentration against isolates by disc diffusion to investigate the presence of carbapenem resistance genes by PCR method. We detected 64 (53.3%) A. baumannii from 120 swaps (burn, wound, blood, urine, sputum) samples by morphological, biochemical and PCR tests. The antibiotic susceptibility test showed that A. baumannii isolates had the resistance to Cefotaxime at 100% and the lowest resistance to Ampicillin/ Sulbactam at 40.6%. It was determined that the MIC value of levofloxacin was 8 µl and 2 µl, and amikacin was 512 µl and 16µl for isolates 1 and 2, respectively. Carbapenem-resistant was determined 25 (%50) A. baumannii isolates in the MHT test, 20 (%40) A. baumannii isolates in the Carba NP test. We found the OXA-58 gene in 2 (%4.0), isolates, the blaOXA-51 gene in all (%100), isolates OXA- 40 gene in 12 (%24) isolates, the OXA-24 gene in 14 (%28) isolates, OXA-23 gene in 36 (%78.1) isolates, ISA-BAL gene in 46 (%90) isolates and no find OXA-143 gene from 50 A. baumannii isolate by PCR.
Benzer Tezler
- Çeşitli klinik örneklerden izole edilen karbapenem dirençli Acinetobacter baumannii suşlarında karbapenemaz varlığının fenotipik ve genotipik yöntemlerle araştırılması
Investigation of carbapenemase presence in carbapenem resistant Acinetobacter baumannii strains isolated from various clinical samples by phenotypic and genotypic methods
ŞÜKRAN ÖZHAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
MikrobiyolojiAtatürk ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUHAMMET HAMİDULLAH UYANIK
- İnvaziv enfeksiyonlardan izole edilen acinetobacter baumannii suşlarındaki direnç genlerinin kliniğe yansıması ve izolatlar arasındaki klonal yaygınlığın araştırılması
Reflection of resistance genes in clinical outcome and investigation of clonal distribution among acinetobacter baumannii strains isolated from invasive infections
BARIŞ BORAL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2015
MikrobiyolojiHacettepe ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖZGEN ESER
- Acinetobacter baumannii suşlarında OXA-23 ve OXA-58 tipi genişlemiş spektrumlu Beta laktamaz varlığının araştırılması ve PFGE yöntemi ile klonal yakınlığının incelenmesi
Detection of extended spectrum Beta lactamase type OXA-23 ve OXA-58 from the acinetobacter baumannii species and investigation of clonal relationship by PFGE
ŞERAFETTİN KEYİK
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
MikrobiyolojiSelçuk ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. UĞUR ARSLAN
- Klinik örneklerden izole edilen karbapenem dirençli acinetobacter baumannii izolatlarında karbapenemazların moleküler yöntemlerle incelenmesi
Investigation of carbapenemases by molecular methods in carbapenem-resistant acinetobacter baumannii isolates isolated from clinical specimens
NURSEDA BÜRKÜK
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
MikrobiyolojiSağlık Bilimleri ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ORHAN BAYLAN
- Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastahanesi' nde kan kültürlerinde üremiş acinetobacter baumannii suşlarında OXA-58 tipi karbapenemaz üretiminin ve moleküler epidemiyolojisinin araştırılması
Investigation of presence and molecular epidemiology of OXA-58 type carbapenemase in Acinetobacter baumannii isolated from blood culteres in Dokuz Eylul University Hospital
AYŞE NUR SARI
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
MikrobiyolojiDokuz Eylül ÜniversitesiTemel Tıp Bilimleri Bölümü
PROF. DR. ZEYNEP GÜLAY