Geri Dön

Molecular study of carbapenems resistant Acinetobacter baumannii isolated from clinical

Klinik kaynaklardan izole edilen karbapenemlere dayanıklı Acınetobacter baumannıı'nin moleküler çalışması

PDF İndir

  1. Tez No: 791127
  2. Yazar: MOHAMMED ADNAN FADHIL AL-NAJJAR
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. ŞİNASİ AŞKAR
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 72

Özet

Acinetobacter baumannii nozokomiyal enfeksiyonların en önemli nedenlerinden biridir. Bu tezde, Irak'taki hastanelerden elde edilen farklı klinik örneklerde A.baumannii bakterisinin kültür ve PZR ile tanımlamak, izolatların antibiyotiklere direnç/duyarlılık durumunu ve MIK değerlerini disk difüzyon belirlemek ayrıca karbapenem direnç genlerinin varlığını PZR ile araştırmak amaçlanmıştır. Kültür, biyokimyasal ve PZR test sonuçlarına göre 120 örneğin (yanık, yara, kan, idrar, balgam) 64'ünde (%53,3) A. baumannii identifiye edilmiştir. Antibiyotik duyarlılık testi, 64 örneğin (%53,3) sefotaksim'e %100 oranında en yüksek dirence sahip olduğu ve Ampicillin/ Sulbaktam'a %40,6 oranında en düşük dirence sahip olduğu belirlenmiştir. sonuçlarına göre amikasine karşı izolat 1 ve 2'nin MİK değeri sırasıyla 8 µl/ml ve 2 µl/ml, levofloksasine karşı sırasıyla 512 µl/ml and 16 µl/ml olarak belirlenmiştir. Karbapenem direnci MHT testinde 25 (%50) A. baumannii izolatında, Carba NP testinde 20 (%40) A. baumannii izolatında saptandı. Yapılan PCR testi ile 50 A. baumannii izolatında OXA- 58 geni 2 izolatta (%4,0), blaOXA-51 geni tüm izolatlarda (%100), OXA-40 geni 12 (%24) izolatta, OXA-24 geni 14 (%28) izolatta, OXA-23 geni 36 (%78,1) izolatta, ISA- BAL geni 46 (%90) izolatta belirlenirken, OXA-143 geni belirlenmemiştir.

Özet (Çeviri)

Acinetobacter baumannii is one of the most important causes of nosocomial infections. The aim of this thesis is to identify A. baumannii from different clinical sources in Iraq hospitals by culture and PCR methods, to determine the antibiotic resistance/sensitivity status and minimum inhibitor concentration against isolates by disc diffusion to investigate the presence of carbapenem resistance genes by PCR method. We detected 64 (53.3%) A. baumannii from 120 swaps (burn, wound, blood, urine, sputum) samples by morphological, biochemical and PCR tests. The antibiotic susceptibility test showed that A. baumannii isolates had the resistance to Cefotaxime at 100% and the lowest resistance to Ampicillin/ Sulbactam at 40.6%. It was determined that the MIC value of levofloxacin was 8 µl and 2 µl, and amikacin was 512 µl and 16µl for isolates 1 and 2, respectively. Carbapenem-resistant was determined 25 (%50) A. baumannii isolates in the MHT test, 20 (%40) A. baumannii isolates in the Carba NP test. We found the OXA-58 gene in 2 (%4.0), isolates, the blaOXA-51 gene in all (%100), isolates OXA- 40 gene in 12 (%24) isolates, the OXA-24 gene in 14 (%28) isolates, OXA-23 gene in 36 (%78.1) isolates, ISA-BAL gene in 46 (%90) isolates and no find OXA-143 gene from 50 A. baumannii isolate by PCR.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    759666

    Klinik örneklerden izole edilen karbapenem dirençli acinetobacter baumannii izolatlarında karbapenemazların moleküler yöntemlerle incelenmesi

    Investigation of carbapenemases by molecular methods in carbapenem-resistant acinetobacter baumannii isolates isolated from clinical specimens

    NURSEDA BÜRKÜK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ORHAN BAYLAN

  2. Tez No

    347721

    Acinetobacter baumannii suşlarında OXA-23 ve OXA-58 tipi genişlemiş spektrumlu Beta laktamaz varlığının araştırılması ve PFGE yöntemi ile klonal yakınlığının incelenmesi

    Detection of extended spectrum Beta lactamase type OXA-23 ve OXA-58 from the acinetobacter baumannii species and investigation of clonal relationship by PFGE

    ŞERAFETTİN KEYİK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    MikrobiyolojiSelçuk Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. UĞUR ARSLAN

  3. Tez No

    543375

    Karbapenem dirençli acinetobacter baumannii klinik izolatlarının moleküler epidemiyolojisinin araştırılmasında farklı yöntemlerin karşılaştırılması

    Comparison of different methods in the investigation of molecular epidemiology of clinical isolates of carbapenem resistant acinetobacter baumannii

    GÜLŞEN ULUÇAM ATAY

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    MikrobiyolojiKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GÜLÇİN BAYRAMOĞLU

  4. Tez No

    507545

    KSÜ Araştırma ve Uygulama Hastanesi'nde hastane enfeksiyonu etkeni olarak izole edilen Acinetobacter baumannii izolatlarının hızlı moleküler epidemiyolojik tanısı

    Rapid molecular epidemiologic diagnosis of Acinetobacter baumannii isolates isolated as hospital infection agent in KSU Research and Practice Hospital

    ARZU KAYIŞ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    BiyomühendislikKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Biyomühendislik ve Bilimleri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MURAT ARAL

  5. Tez No

    361336

    Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastahanesi' nde kan kültürlerinde üremiş acinetobacter baumannii suşlarında OXA-58 tipi karbapenemaz üretiminin ve moleküler epidemiyolojisinin araştırılması

    Investigation of presence and molecular epidemiology of OXA-58 type carbapenemase in Acinetobacter baumannii isolated from blood culteres in Dokuz Eylul University Hospital

    AYŞE NUR SARI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    MikrobiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Temel Tıp Bilimleri Bölümü

    PROF. DR. ZEYNEP GÜLAY

Geri Dön