Klinik örneklerden izole edilen karbapenem dirençli acinetobacter baumannii izolatlarında karbapenemazların moleküler yöntemlerle incelenmesi
Investigation of carbapenemases by molecular methods in carbapenem-resistant acinetobacter baumannii isolates isolated from clinical specimens
- Tez No: 759666
- Danışmanlar: PROF. DR. ORHAN BAYLAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Acinetobacter baumannii, Grup A karbapenemaz, Karbapenemaz, Metallo beta laktamaz, Oksasilinaz, Acinetobacter baumannii, carbapanemases, Class A carbapenemases, Metallo beta lactamases, Oxacillinases
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Sağlık Bilimleri Üniversitesi
- Enstitü: Hamidiye Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 92
Özet
Amaç: Acinetobacter baumannii, tüm dünyada hastane enfeksiyonlarına yol açan en önemli patojenlerden biridir. Çoklu ilaca dirençli A. baumannii izolatlarının tedavisinde kullanılan karbapenemlere karşı giderek artan direnç, endişe verici boyutlara ulaşmıştır. Karbapenem dirençli A. baumannii enfeksiyonlarında altta yatan direnç mekanizmasının tespiti, hastane kaynaklı enfeksiyonların önlenmesi ve gerekli önlemlerin alınması için gereklidir. Gereç ve Yöntem: Çalışmaya, Ocak 2021-Aralık 2021 tarihleri arasında Sağlık Bilimleri Üniversitesi Sultan 2. Abdülhamid Han Eğitim ve Araştırma Hastanesi'nde yatan hastalardan Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı'na gönderilen çeşitli klinik örneklerden izole edilen karbapenem dirençli 100 A. baumannii izolatı dahil edilmiştir. Karbapenemaz varlığını saptamak amacıyla fenotipik yöntemlerden karbapenem inaktivasyon yöntemi ve RAPIDEC CARBA NP (bioMérieux, Fransa) testleri kullanılmış; genotipik yöntemlerden ise PCR ile blaOXA-23, blaOXA-51, blaOXA-58, blaIMP, blaNDM ve blaKPC karbapenemaz direnç genleri araştırılmıştır. Bulgular: Çalışmaya dahil edilen izolatlar en çok trakeal aspirat kültüründen (%61) izole edildi ve klinik örnekler en çok Anesteziyoloji ve Reanimasyon Yoğun Bakım Ünitesi'nden (%53) gönderildi. Klinik örneklerin tamamı imipeneme, siprofloksasine ve levofloksasine dirençli bulundu. Meropeneme %98 oranında direnç saptanırken A. baumannii'ye karşı en etkili antibiyotikler kolistin (%87) ve tigesiklin (%87) olarak tespit edildi. Karbapenemaz varlığını araştırmak için yapılan fenotipik testlerde CIM ile yedi, RAPIDEC CARBA NP ile dört izolatta negatiflik bulundu. PCR ile araştırılan direnç genlerinden blaOXA-51 %100, blaOXA-23 %38, blaNDM ise %26 oranında saptandı. blaOXA-58, blaIMP ve blaKPC direnç genlerine sahip hiçbir köken bulunamadı. Sonuç: Hastanemize başvuran hastalardan izole edilen A. baumannii izolatlarındaki karbapenem direncine yol açan mekanizmalar arasında blaOXA-51, blaOXA-23 ve blaNDM'nin baskın olduğu görülmüştür.
Özet (Çeviri)
Aim: Acinetobacter baumannii is isolated as one of the most important factors causing nosocomial infections all over the world. Increasing resistance to carbapenems used in the treatment of multidrug-resistant A. baumannii isolates has reached alarming levels. Detection of the underlying resistance mechanism in carbapenem-resistant A. baumannii infections is necessary to prevent hospital-acquired infections and to take necessary precautions. The results obtained will contribute to the formation of epidemiological data. Materials and Methods: The study included 100 carbapenem-resistant A. baumannii isolates isolated from various clinical samples sent to the Medical Microbiology Laboratory from patients hospitalized in Sultan 2. Abdulhamid Han Training and Research Hospital of Health Sciences University between January 2021 and December 2021. Carbapenem inactivation method and RAPIDEC CARBA NP tests from phenotypic methods were used to detect the presence of carbapenemase, and resistance genes of blaOXA-23, blaOXA-51, blaOXA-58, blaIMP, blaNDM and blaKPC were investigated by PCR from genotypic methods. Results: Isolates were most commonly isolated from tracheal aspirate culture (61%), and clinical specimens were mostly sent from the Anesthesia and Reanimation ICU (53%). All clinical specimens were resistant to imipenem, ciprofloxacin and levofloxacin. While 98% resistance to meropenem was detected, the most effective antibiotics against A. baumannii were colistin (87%) and tigecycline (87%). In the phenotypic tests performed to investigate the presence of carbapenemase, seven isolates were negative with CIM and four isolates with RAPIDEC CARBA NP. Among the resistance genes investigated by PCR, blaOXA-51 was 100%, blaOXA-23 was 38%, and blaNDM was 26% positive. No isolates with the blaOXA-58, blaIMP and blaKPC genes were detected. Conclusion: Among the mechanisms leading to carbapenem resistance in A. baumannii isolates isolated from patients admitted to our hospital, blaOXA-51, blaOXA-23 and blaNDM were dominant.
Benzer Tezler
- Klinik Acinetobacter baumannii izolatlarında direnç genlerinin moleküler yöntemlerle araştırılması
Investigation of resistance genes by molecular methods in clinical isolates of Acinetobacter baumannii
GÜLŞAH AŞIK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2011
MikrobiyolojiAfyon Kocatepe ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İHSAN HAKKI ÇİFTCİ
- Karbapenem dirençli pseudomonas suşlarında OXA-23, OXA-40, OXA-58 genlerinin moleküler yöntemle tesbiti
Detection OXA-23, OXA-40, OXA-58 genes with molecular investigation in carbapenem resistant pseudomonas strains
FATMA ESENKAYA TAŞBENT
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2014
MikrobiyolojiNecmettin Erbakan ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MEHMET ÖZDEMİR
- Klinik örneklerden izole edilen çoklu ilaç dirençli Acinetobacter baumannii suşlarında bazı karbapenemazların genotipik yöntemlerle araştırılması
Investigation of some carbapenemases by genotypic methods in multi-drug resistant Acinetobacter baumannii strains isolated from clinical specimens
NİDA ÖZCAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
MikrobiyolojiDicle ÜniversitesiTemel Tıp Bilimleri Bölümü
PROF. DR. KADRİ GÜL
- MDR ve XDR acinetobacter izolatlarında OXA gen varlığının gösterilmesi ve suşlar arasındaki klonalitenin araştırılması
MDR ve XDR aci̇netobacter i̇zolatlarinda OXE gen varliğinin gösteri̇lmesi̇ ve suşlar arasindaki̇ klonali̇teni̇n araştirilmasi
TUĞBA KULA ATİK
- Klinik örneklerden izole edilen acinetobacter izolatlarında metallobetalaktamaz varlığının fenotipik ve genotipik yöntemlerle belirlenmesi
Phenotypic And Genotypic Determination Of Metallo Beta Lactamases In Acinetobacter Isolates Isolated From Clinical Samples
FERHAN KORKMAZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2018
MikrobiyolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ASUMAN BİRİNCİ