Modeling of drug delivery by modifying tumor microenvironment
Tümör mikroçevresinin değiştirilmesiyle ilaç iletiminin modellenmesi
- Tez No: 792684
- Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET BURÇİN ÜNLÜ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyofizik, Biophysics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Fizik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 121
Özet
Tümör mikroçevresi, tümörlerin oluşumunda ve ilerlemesinde kritik bir özelliktir. Tümör mikroçevresinin karmaşık yapısı, genellikle anormal vasküler yapı ve hipoksi, yüksek interstisyel basınç ve asidite olmak üzere tümör kaynaklı durumlar ile ayırt edilmektedir. Tümör mikroçevresi antikanser tedavilerinin etkinliği üzerinde önemli bir etkiye sahiptir, bu nedenle kanser araştırmalarında tümör mikroçevre özelliklerini hedefleyen stratejilerin benimsenmesi çok önemlidir. Bu bağlamda, tümör mikroçevresini hedef alan terapötik stratejileri incelemek amacıyla, burada damarlı tümör büyümesi ve tedavilere yanıtı içeren bir matematiksel modelleme yaklaşımı kullanılmaktadır. Uzay-zamansal model, ilaç tedavileriyle birlikte tümör hücresi büyümesini, damar yapısını ve oksijenlenmeyi içermektedir. Tümör mikroçevresinin önemli bir özelliği olan hipoksiyi hedefleyen ilaçların etkileri, kemoterapi ilaçları ile birlikte verildiğinde araştırılmaktadır. Farklı ilaç programlaması ve sıralaması uygulanmakta ve tümörün bu çeşitli durumlara verdiği yanıt incelenmektedir. Ayrıca, tümörün tedavilere verdiği yanıtı incelemek için derin öğrenme yaklaşımı kullanılmış ve bir yanıt tahmin modeli sunulmuştur. Model, tümör büyümesi ve ilaca yanıt davranışlarını içermektedir. Sunulan modelin amacı, devam eden tedavi planına göre tümör yanıtını tanımlamaktır. Model, ilaç skalerlerini ve tümör mikroçevre kanallarını girdi olarak kullanarak, gelecekteki tümör mikroçevre haritalarını tahmin eder ve bu, hastalar için kombine tedavilerin optimum planını ve dozlarını belirlemeye yardımcı olabilir.
Özet (Çeviri)
The tumor microenvironment is a critical aspect in the formation and progression of tumors. Its complex nature is commonly distinguished by abnormal vascular structure and tumor-induced states, including hypoxia, elevated interstitial pressure, and acidity. The tumor microenvironment has a significant impact on the effectiveness of anticancer treatments, so it is crucial to adopt strategies in cancer research that target tumor microenvironment features. In this regard, to study the therapeutic strategies targeting the tumor microenvironment, a mathematical modeling approach is utilized here to incorporate vascular tumor growth and response to treatments. The spatiotemporal model captures the tumor cell growth, vasculature, and oxygenation, along with drug treatments. The effects of drugs targeting hypoxia, an important feature of the tumor microenvironment, are investigated when given in combination with chemotherapy drugs. Different scheduling and sequencing are applied, and the tumor response to these various cases is examined. In addition, to examine the response of the tumor to chemotherapy treatment, a deep learning approach is employed, and a response prediction model is presented. The model includes tumor growth and drug response behaviors. The goal of the presented model is to represent the tumor response behavior according to the ongoing treatment schedule. The model predicts future tumor microenvironment maps using drug scalars and tumor microenvironment channels as inputs, which might aid in determining the optimum schedule and dosages of combination therapy for patients.
Benzer Tezler
- A mathematical model of drug delivery by modifying the tumor microenvironment:MMP activation
Tümör mikroçevresinin değiştirilmesi yoluyla ilaç iletiminin matematiksel modellemesi: MMP aktivasyonu
DUYGU KABA
Yüksek Lisans
İngilizce
2013
MatematikBoğaziçi ÜniversitesiMatematik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BURAK GÜREL
DOÇ. DR. MEHMET BURÇİN ÜNLÜ
- Endotoksin ile indüklenmiş koryoamniyonit gebe sıçan modelinde magnezyum ve fingolimodun fetal inflamatuvar belirteçlere etkisi
Effects of magnesium and fingolimod on fetal inflammatory markers in endotoxin-induced chorioamnionitis pregnant rat model
SERENAT YALÇIN
Tıpta Yan Dal Uzmanlık
Türkçe
2018
Kadın Hastalıkları ve DoğumSüleyman Demirel ÜniversitesiKadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEKİN SEZİK
- Physical modeling of drug delivery in solid tumors
Tümörlere ilaç iletiminin fiziksel modellenmesi
DENİZ ÖZTÜRK
Yüksek Lisans
İngilizce
2013
BiyofizikBoğaziçi ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MEHMET BURÇİN ÜNLÜ
- Synthesis and modeling of hydrogels for controlled drug delivery
Kontrollü ilaç salımı için hidrojel sentezi ve modellenmesi
DUYGU KAYA
Doktora
İngilizce
2019
Kimya MühendisliğiMarmara ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NESLİHAN ALEMDAR YAYLA
- Modeling of nanoparticle - membrane interactions
Nanopartikül – membran etkileşimlerinin modellenmesi̇
GÜLŞAH GÜL
Doktora
İngilizce
2022
Kimya MühendisliğiBoğaziçi ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NAZAR İLERİ ERCAN