Geri Dön

Analysis of p73 gene in hepatocellular carcinoma

Karaciğer kanserinde p73 geninin analizi

  1. Tez No: 79354
  2. Yazar: NECATİ FINDIKLI
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET ÖZTÜRK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Genler, Karaciğer neoplazmları, Genes, Liver neoplasms
  7. Yıl: 1998
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

ÖZET KARACİĞER KANSERİNDE p73 GENİNİN ANALİZİ Necati Fındıklı Moleküler Biyoloji ve Genetik Yüksek Lisans Tez Yöneticisi: Prof. Dr. Mehmet Öztürk Ağustos 1998 Hepatoselüler karsinom (HCC) dünyada sekizinci en yaygın kanserdir. Epidemiyolojik olarak araştırılmış risk faktörleri arasında hepatit B virüsü (%80'den fazla), hepatit C virüsü ve afiatoksinler başta gelmektedir. Hepatoselüler karsinogenezin moleküler mekanizmaları çok iyi bilinmemektedir. Bu tümörlerde sıkça rolü olduğu saptanan tek gen p53 tümör baskılayıcı genidir. Ancak, bu genin mutasyonu ya da inaktivasyonu HCC'lerin yaklaşık %30'unda gözlenmiştir. Hepatoselüler karsinogenezin tam olarak anlaşılabilmesi için diğer genlerin de incelenmesi gerekmektedir. p73 yakın zamanda p53-homoloğu bir gen olarak bulunmuştur. Bu çalışmada, bu genin hepatoselüler karsinomdaki olası rolü araştırılmıştır. p73 geninin HCC'deki yapısı ve ifadesi, olası değişimler açısından incelenmiştir. Önce p73'ün alternatif olarak ifade edilen iki transkriptini (p73a ve p73|3) ayni zamanda incelemek için yeni bir yöntem geliştirilmiştir. RT-PCR'a dayanan bu teknik, p73 transkriptlerinin miktarını kabaca belirleyebilmektedir. Böylece HCC tümörlerden ve normal karaciğerden türetilmiş 8 hücre hattında p73a'nm ifade edildiği gözlenmiştir. Buna karşılık p73p sadece 5 farklılaşmış hücre hattında görüldü. Farklılığını yitirmiş 3 hücre hattında ise p73|3 bulunamadı. Bu hücrelenin farklılaşma durumları RT-PCR tekniği ile albumin ve alfa-fetoprotein transkriptleri incelenerek test edildi. Bu transkriptler 5 farklılaşmış hücrenin 3 'ünde görüldü ancak 3 farklılığım yitirmiş hücre hattında görülmedi. Daha sonra, 25 HCC örneği p73 geninin seçilmiş ekzonlarmdaki olası mütasyonlan belirlemek amacıyla non-radyoaktif heterodupleks testi, radyoaktif SSCP analizi, restriksiyon enzim analizi ve DNA dizi analizi yöntemleri ile tarandı. p53 geninin en çok mütasyona uğradığı bilinen ekzonlarma benzerlik gösteren p73 eksonlarmda mutasyon bulunmadı. Bu gözlemlerden yola çıkarak, p73 geninin HCC de mütasyona uğramadığı, ama hepatoselüler farklılaşmada kritik bir rol oynayabileceği sonucunu çıkardık. p73p sadece farklılaşmış hücrelerde görüldüğünden, bu form karaciğere-özgün genlerin RNA ifadesinin düzenlenmesinde rol oynayabilir. Bu hipotezin ek çalışmalarla doğrulanması gerekmektedir.

Özet (Çeviri)

ABSTRACT ANALYSIS OF p73 GENE IN HEPATOCELLULAR CARCINOMA Necati Fındıklı M.S. in Molecular Biology and Genetics Supervisor: Prof. Dr. Mehmet Öztûrk August 1998 Hepatocellular carcinoma (HCC) is the eighth most frequent cancer worldwide. Epidemiologically-studied risk factors include hepatitis B virus (greater than 80%), hepatitis C virus and aflatoxins. Molecular mechanisms of hepatocarcinogenesis are poorly understood. The only gene known to be consistently involved in these tumors is the p53 tumor suppressor gene. However, this gene was found to be mutated or inactivated in about 30% of HCC. There is a need to study additional genes in order to fully understand hepatocellular carcinogenesis. p73 has been identified recently as a p53-homolog gene. In this study, we analyzed the possible involvement of this gene in HCC. We investigated both the expression and structure of p73 gene in HCC for possible alterations. We first developed a novel method to analyze the expression of alternatively spliced transcripts of p73 (p73a and p73|3) simultaneously. This technique, based on RT-PCR, allows the analysis of p73 transcripts semi-quantitatively. We found that p73a was expressed ubiquituously in 8 cell lines derived from normal liver or HCC tumors. Interestingly, p73|3 was present only in 5 differentiated but not in 3 undifferentiated cell lines. The differentiation status of these cell lines were tested by the analysis of albumin and a-fetoprotein transcripts by RT-PCR. These transcripts were present in 3/5 differentiated but not in 3 undifferentiated cell lines. Next, we screened 25 HCC samples for possible mutations of p73 gene at selected exons with non-radioactive heteroduplex test, radioactive SSCP analysis, restriction enzyme analysis and DNA sequencing. No alterations were found in exons homologous to those of p53 known to harbor mutational hotspots.From these observations, we conclude that p73 gene is not mutated in HCC, but it may play a critical role in hepatocellular differentiation. As p73p was found in differentiated cell lines, this form may be involved in transcriptional regulation of liver-specific genes. Additional studues are needed to confirm this hypothesis.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    713551

    Determination and verification of new targets in liver cancer

    Karaciğer kanserinde yeni hedeflerin belirlenmesi ve doğrulanması

    UMUT EKİN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    Tıbbi BiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Genom Bilimleri ve Moleküler Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ YAVUZ OKTAY

    PROF. DR. MEHMET ÖZTÜRK

  2. Tez No

    129236

    Acquired expression of transcriptionally active p73 in hepatocellular corcinoma cells

    Karaciğer kanseri hücrelerinde p73'ün transkripsiyonel olarak aktif formunun edinilmiş ifadesi

    ABDÜLKADİR EMRE SAYAN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2002

    Tıbbi Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET ÖZTÜRK

  3. Tez No

    1011517

    Investigation of sorafenib resistance mechanisms and the effects of TAp73β transcription factor on cell proliferation, metastasis, and angiogenesis in the presence of sorafenib in a zebrafish xenograft model in hepatocellular carcinoma

    Hepatoselüler karsinomada sorafenıb direnç mekanizmalarının ve TAp73β tranksripsiyon faktörünün sorafenıb varlığında hücre proliferasyonuna, mestastaza, ve anjiyogeneze olan etkisinin zebralığı ksenograft modelinde incelenmesi

    MİRAY SEVİNİN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2026

    BiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. EVİN İŞCAN

  4. Tez No

    201

    Çimentonun sertleşmesi üzerinde kimyasal komponentlerin etkisi

    Başlık çevirisi yok

    NACİYE TÜRKEL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1986

    Kimya MühendisliğiUludağ Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUSTAFA CEBE

  5. Tez No

    204

    Nükleer rezonasta moleküler yapıların incelenmesi (yapısal faz geçiş kuramları üzerine bir inceleme)

    Başlık çevirisi yok

    ABDURRAHMAN ANDİÇ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1986

    Fizik ve Fizik MühendisliğiUludağ Üniversitesi

    Fizik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYTAÇ YALÇINER

Geri Dön