Geri Dön

Genetic analysis of smad 4 gene in TGF-B sprolling pothway in human liver cancer

TGF-B sinyal yolunda yer alan Smad 4 geninin insan karaciğer kanserinde genetik analizi

  1. Tez No: 79355
  2. Yazar: MELİHA BURCU IRMAK
  3. Danışmanlar: DR. M. CENGİZ YAKICIER
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Hepatosellüler karsinoma, TGF-3, Mutasyon, Smad4, Hücre hattı, SSCP, PCR. IV, HCC, TGF-p, Mutation, Smad4, Cell line, SSCP, PCR m
  7. Yıl: 1998
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 70

Özet

ÖZET TGF-P SİNYAL YOLUNDA YER ALAN SMAD4 GENİNİN İNSAN KARACİĞER KANSERİNDE GENETİK ANALİZİ Meliha Burcu Irmak Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü Yüksek Lisans Tez Yöneticisi: Dr. M. Cengiz Yakıcıer Temmuz, 1998 Hepatosellüler karsinoma, hepatositlerin kontrolsüz çoğalması sonucu, değişik genetik bozuklukların birikmesiyle oluşan çok basamaklı bir hastalıktır. Hepatosellüler karsinomaya yol açan moleküler olaylar henüz bilinmemektedir. Bu güne kadar, ne belli bir onkogenin, ne de tümör baskılayıcı genin, HCC'ye neden olduğu gösterilememiştir. HCC vakalarında p53, pl6, BRCA2, M6P/IGFIIR, Rb, PRLTS, ve Tg737 genlerinde gösterilen mutasyonlarm dışında gen bozuklukları hala bilinmemektedir. TGF-3, hepatosit çoğalmasını önleyici çok güçlü bir moleküldür. Hepatosellüler karsinoma ve siroz sırasında TGF-3 seviyesinde artma gözlenmiştir, buna rağmen hepatositler çoğalmaya devam etmiştir. Bu sebeple, karaciğer kanserlerinde TGF-3 sinyal yolunda bir bozukluk olabileceği düşünülebilir. TGF-3 sinyal yolunda yer alan genlerin arasında bulunan, ortak aracı, Smad4 geninin çeşitl kanser tiplerinde mute olduğu bulunmuştur. Biz de, hepatosit çoğalmasını engelleyici bir faktör olan TGF-3 'nm sinyal yolunda yer alan Smad4 geninin mutasyon analizini yapmaya karar verdik. 35 HCC vakası için, SSCP analizi ile Smad4 geninin mutasyonlarm çok yoğun olduğu MH2 bölgesine denk gelen, kodlayan bölgeler 8, 9 10, ve 11 ile MH1 bölgesine denk gelen kodlayan bölge 2'nin mutasyonlan tarandı. 3 tanesi kodlayan bölge 8, 1 tanesi kodlayan bölge 9 ve sonuncusu da kodlayan bölge 10'da olmak üzere, 35 HCC vakasinda 5 tane (14%) değişiklik göründü. Test edilen örneklerde büyük delesyonlara rastlanmadı, ama görülen değişiklikler büyük bir ihtimalle tek baz değişiklikleridir. Bununla birlikte, HCC hücre hatları olan, HepG2, Hep3B, Huh7, FOCUS, Mahlavu, ve PLC/PRF/5 mutasyonlan ve PLC/PRF/5 hariç diğer hücre hatları mRNA transkripsiyonu için kontrol edildi. Hücre hatlarının N- ve C- uçlannda büyük delesyon ve değişikliklere rastlanmadı, ve Hep3B dışında bütün hücre hatlarının mRNA yazılımı gösterildi. Elde ettiğimiz sonuçlar Smad4 geninin en azından bazı HCC vakalarının gelişiminde rol oynayabileceğini düşündürmektedir.

Özet (Çeviri)

ABSTRACT GENETIC ANALYSIS OF SMAD4 GENE IN TGF-0 SIGNALLING PATHWAY IN HUMAN LIVER CANCER Meliha Burcu Irmak M.S. in Molecular Biology and Genetics Advisor: Dr. M. Cengiz Yakıcıer July, 1998 HCC is a multistep genetic disease in which many genomic changes occur as a result of uncontrolled proliferation of hepatocytes. Molecular events leading to HCC is still unclear. Until now, neither an oncogene nor a tumor suppressor gene has been shown to be prefentially altered in HCC. Genetic alterations other than p53, pi 6, BRCA2 (Breast Carcinoma Associated Protein), M6P/IGFHR (Mannose 6 Phosphate/ Insulin Like Growth Factor II Receptor), Rb (Retinoblastoma), PRLTS (Platelet Derived Growth Factor Receptor-P-Like Tumor Suppressor Gene), and Tg737 (Candidate polycyctic kidney disease gene) genes remain unknown. TGF-P is a strong inhibitor of hepatocyte proliferation. In HCC and cirrhosis increased levels of TGF-P is observed, so this shows that the presence of high levels of TGF-P does not avoid hepatocyte proliferation. Thus, there may be a disruption in the signalling pathway of TGF-p. The common mediator Smad4 gene, which is among the genes located in TGF-P signalling pathway, is found to be mutated in many cancer types. We decided to do the mutational analysis of Smad4 gene, which is located in the signalling pathway of the hepatocyte antiproliferative factor, TGF-p. Exons 8, 9, 10, and 1 1 which are in MH2 region, and exon 2 which is in MH1 region of Smad4 is mutationally analysed by SSCP for 35 HCC cases. In the 35 HCC tumors, 5 alterations were observed (14%), 3 of them being in exon 8, one of them being in exon 9a, and the last one being in exon 10 of Smad4 gene. In the samples we tested, no big deletions were observed, but the alterations observed are probably single base changes. Also HCC cell lines namely, HepG2, Hep3B, Huh-7, FOCUS, Mahlavu, and PLC/PRF/5 were checked for their mutations and cell lines other then PLC/PRF/5 were analysed for their mRNA transcription. There were no big deletions or alterations in N- and C- terminals of the cell lines and we have shown mRNA transcription for all cell lines except Hep3B in which PCR has revealed very weak amplification. Our results suggest that Smad4 might be involved in at least a part of primary HCC tumor development.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    676190

    The relationship between urinary exosomal miRNA levels and renal outcome in type 2 diabetic nephropathy patients

    Tip 2 diyabetik nefropati hastalarında üriner eksozomal miRNA düzeylerinin renal outcome ile ilişkisi

    MEHMET SEYİT ZOR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    Genetikİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. EDA TAHİR TURANLI

  2. Tez No

    472858

    Investigation of NFIB binding to CDO and FGF19 gene regulatory regions by chromatin immunoprecipitation

    NFIB'nin CDO ve FGF19 gen düzenleyici bölgelerine bağlanmasının kromatin immün çöktürme yöntemiyle araştırılması

    CEMRE LEKTEMUR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2017

    Biyolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ASLI KUMBASAR

  3. Tez No

    424691

    Hepatosellüler karsinomada kemik morfojenik protein 9 (BMP9)'un siRNA ile baskılanarak fonksiyonel analizi

    Functional analysis of siRNA-mediated knock-down of bone morphogenetic protein 9 (BMP9) in hepatocellular carcinoma

    TUĞÇE YAŞAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    GenetikTurgut Özal Üniversitesi

    Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ÖMER FARUK HATİPOĞLU

  4. Tez No

    680453

    Biküspit aort kapak hastalığı olan türk çocuklarında BMP-2, BMP-4 ve smad6 gen polimorfizmlerinin belirlenmesi

    Determination of BMP-2, bmp-4 and smad6 gene polymorphisms in turkish children with bicuspid aortic valve

    GİZEM TÜKENMEZ SABIRLI

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıPamukkale Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. DOLUNAY GÜRSES

  5. Tez No

    778458

    Pankreas kanseri gelişiminde etkili olan TP53 genindeki R273H mutasyonunun CRISPR/CAS9 tekniği ile düzeltilmesi

    Editing of the R273H mutation in TP53 gene, which is effective in the development of pancreatic cancer, by using the CRİSPR/CAS9 tecnique

    ŞEYMA HAZAL ÇETİN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Tıbbi BiyolojiSelçuk Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ DUDU ERKOÇ KAYA

Geri Dön