Geri Dön

Determination of Campylobacter ssp. isolates from stool samples and their antibiotic susceptibility

Dışkı örneklerinden Campylobacter spp. izolatlarının elde edilmesi ve bu izolatların antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi

PDF İndir

  1. Tez No: 793799
  2. Yazar: HUSSEIN ALI KAMIL
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ABDURRAHMAN AYVAZ, DR. ÖĞR. ÜYESİ PINAR SAĞIROĞLU
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Mikrobiyoloji, Biology, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Campylobacter spp, Quinolone resistance, MALDI-TOF MS, AST, MAMA PCR
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Erciyes Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 64

Özet

Bu çalışma Erciyes Üniversitesi hastanelerine ishal şikâyeti ile başvuran hastalarda Campylobacter izolatlarının prevalansını belirlemek, antibiyotik direncini ortaya çıkarmak ve kinolon direncini genetik olarak saptamak amacıyla yapılmıştır. Erciyes Üniversitesi hastanelerine ishal şikâyeti ile başvuran bireylerden alınan dışkı örnekleri (150) mikrobiyoloji laboratuvarına gönderildi. Gaita örneklerinin ilk izolasyonunda gram boyama, son izolasyonunda ise selektif besiyeri kullanıldı. Kültürde üreyen Campylobacter izolatlarının tür düzeyinde teşhisi MALDI-TOF MS ile yapıldı, izolatların sırasıyla %82,4 (42/51) ve %17,6 (9/51) oranlarında C. jejuni ve C. coli oldukları belirlendi. İzolatların antibiyotik duyarlılık testleri (AST) Mueller Hinton Fastidious (MHF) agarda EUCAST tavsiyelerine göre disk difüzyon yöntemi ile yapıldı. Siprofloksasin, tetrasiklin ve eritromisin için sırasıyla %94 (47/50), %58 (29/50) ve %2 (1/50) direnç oranları belirlendi. C. jejuni suşlarının her üç antibiyotiğe karşı C. coli'den daha dirençli olduğu görüldü. Siprofloksasine dirençli izolatlardaki mutasyonları belirlemek için gryA geninin PCR ürünleri, spesifik bir primer kullanılarak mismatch amplifikasyon mutasyon testi (MAMA PCR) ile elde edildi ve dizi analizi yapıldı. Dizilenen 7 izolatın tamamında kinolon direncinin bir belirteci olan Thr-86 to-I mutasyonu gözlendi. Yine bu çalışmada 7 sessiz mutasyon 2 tane de novel mutasyon saptandı. incelenen dışkı örneklerinden %35,33 (53/150) oranında Campylobacter spp. izole edilmiş olup, pozitif izolatların çoğu (%64,15, 34/25) 0-10 yaş grubundan, özellikle erkeklerden elde edilmiştir (%75,5, 40/ 53). Anahter kelimeler: Campylobacter spp., kinolan direnci, MALDI-TOF MS, ADT, MAMA PCR

Özet (Çeviri)

This study was carried out to determine the prevalence of Campylobacter isolates, to reveal antibiotic resistance and to genetically detect quinolone resistance in patients who applied to Erciyes University hospitals with the complaint of diarrhea. Stool samples (150) from individuals with diarrhea who applied to different units at Erciyes University hospitals sent to the microbiology laboratory. Gram stain was used for the initial isolation of the stool samples, and selective medium was used for the final isolation. Species-level diagnosis of Campylobacter isolates grown in culture was determined by MALDI-TOF MS. C. jejune and C. coli strains were determined at the rates of 82.4% (42/51) and 17.6% (9/51), respectively. Antibiotic susceptibility tests (AST) of the isolates were assigned on Mueller Hinton Fastidious (MHF) agar according to the EUCAST recommendations by disc diffusion method. Respectively 94% (47/50), 58% (29/50) and 2% (1/50) resistance rates determined for ciprofloxacin, tetracycline, and erythromycin. C. jejuni strains showed higher resistance to all three antibiotics more than C. coli. To identify mutations in isolates resistant to ciprofloxacin, PCR products of the gryA gene were obtained by mismatch amplification mutation test (MAMA PCR) using a specific primer and sequenced. Thr-86 to-I mutation, which is a marker of quinolone resistance, was observed in all 7 isolates sequenced. Again, in the current study, while 7 silent mutations were identified, 2 novel mutations were detected. Campylobacter spp. was isolated at a rate of 35.33% (53/150) from the stool samples examined, and most of the positive isolates (64.15%, 34/25) were obtained from 0-10 age group, especially male (75.5%, 40/53) individuals.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    876788

    Kasaplık sığırlarda campylobacter varlığının ISO 10272-1:2017 ile belirlenmesi

    Determination of campylobacter presence in slaughtered cattle by ISO 10272-1:2017

    FATMA GÜRLER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Besin Hijyeni ve TeknolojisiBursa Uludağ Üniversitesi

    Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞE GÜL EYİGÖR

  2. Tez No

    518708

    Çeviren ineklerde bakteriyel infertilite nedenlerinin ve sıklığının belirlenmesi

    Determination of causes and incidence of bacterial infertility in repeat breeder cows

    MÜCAHİT PALAZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    MikrobiyolojiAnkara Üniversitesi

    Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MÜJGAN İZGÜR

  3. Tez No

    881017

    Nevşehir Bölgesi ʼnde satışa sunulan tavuk karkaslarından izole edilen campylobacter jejunı izolatlarının moleküler karakterizasyonu ve antibakteriyel duyarlılıklarının belirlenmesi

    Determination of molecular characterization and antibacterial sensitivities of campylobacter jejuni isolated from chickhen carcasses offered for sale in Nevşehir Region

    CAN YAMAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Besin Hijyeni ve TeknolojisiErciyes Üniversitesi

    Veteriner Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim dalı

    DOÇ. DR. HARUN HIZLISOY

  4. Tez No

    729105

    Akut gastroenteritli hastaların klinik örneklerinde salmonella, shigella ve campylobacter türlerinin kültür ve PCR yöntemi ile tespit edilmesi ve antibiyogram duyarlılığının saptanması

    Determination of salmonella, shigella and campylobacter species by culture and PCR method in clinical samples of patients with acute gastroenteritis and determination of antibiotic sensitivity

    GAMZE AVCİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    GastroenterolojiTekirdağ Namık Kemal Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NURİ KİRAZ

  5. Tez No

    458306

    Klinik örneklerden campylobacter türlerinin üretilmesinin araştırılması ve antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi

    Investigation of growth of campylobacter species from clinical specimens and determination of their antimicrobial susceptibility

    RECEP BORUCU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    MikrobiyolojiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. YELİZ TANRIVERDİ ÇAYCI

Geri Dön