Geri Dön

Isolation and diagnosis of staphylococcus aureus and detection of some virulence genes using pcr technique depending on the specific primers

Sbesifik primerlerde bağlı olarak pcr tekniği kullanılarak staphylococcus aureus izolasyonu ve teşhisi ve bazı virolans genlerinin tespiti

PDF İndir

  1. Tez No: 795047
  2. Yazar: ASAAD EYADA HUSSAIN AAL-ALI
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ FATİH KARAYÜREK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Biyoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 86

Özet

Staphylococcus aureus tüm dünyaya yayılmış olup hastane enfeksiyonlarının en yaygın nedenlerinden biri olarak şu anda önemli bir halk sağlığı sorunudur. Bu çalışmanın amacı S. aureus'un virülans genlerinin belirlenmesidir. Çalışma, Kasım 2021- Mart 2022 tarihleri arasında, Al-Ramadi Eğitim Hastanesi ve Haditha Hastanesi'ndeki tıbbi mikrobiyoloji laboratuvarlarında gerçekleştirilmiştir. S. aureus, kan kültürlerinden, yara enfeksiyonlarından, idrar kültürlerinden, yanık sürüntülerinden ve vajinal ve kulak enfeksiyonlarından alınan 110 örnekte mikrobiyolojik ve biyokimyasal testler kullanılarak tespit edilmiştir. Duyarlılık için altı farklı antibiyotik (Tetrasiklin, Sefaleksin, Eritromisin, Klindamisin, Kloramfenikol ve Trimetoprim) test edilmiştir. İzolatlar daha sonra virülans genleri için moleküler taramaya tabi tutulmuş olup, S. aureus 110 izolatta (%52,38) bulunmuştur. Sonuçlar, Tetrasiklin (%72,30), Eritromisin (%61,55), Sefaleksin (%46,15), Klindamisin (%36,92), Kloramfenikol (%33,84) ve Trimetoprim (%20) karşı yüksek direnç göstermiştir. Bu çalışmada, sırasıyla Trimethoprim, Chloramphenicol ve Clindamycin (80), (66.15), (64.61) antibiyotiklerinde en yüksek duyarlılığı kaydedilmiştir. 110 (%100) izolatın, sırasıyla, 96'sında (%87,5), 55'inde (%50), 96'sında (%87,5) 16srRNA, hla, etb, crtN genleri tespit edilmiştir. Toksin genleri içeren S. aureus klinik izolatlar arasında çok sayıda görülmektedir. Sekans analizinin sonuçları, polimorfizmi saptamak için National Center Biotechnology Information (NCBI) ve BioEdit programında patlama ile analiz edilmiştir. (NCBI) tarafından sekans, 3 transversiyon, 1 geçiş nükleotidi arasında 4 varyasyon bulmuş ve 9 -788 ve 75-984'den sekans ID:MG230264.1 ve ID: MH603394.1 altında %99 göstermiştir. Gen Bankasından alınan S. aureus suşu AM ve S.aureus suşu AT1'den gelen nükleotidlerin sayısı sırasıyla (1394) ve (1637) olmuştur.

Özet (Çeviri)

Staphylococcus aureus has spread around the globe and is now a major public health problem as one of the most prevalent causes of nosocomial infections. The aim of this study was to determine the virulence genes of S. aureus. From November 2021 until March 2022, the study was conducted in the medical microbiology laboratories at Al-Ramadi Teaching Hospital and Haditha Hospital. The 110 samples were detected utilizing microbiological and biochemical testing from blood cultures, wound infections, urine cultures, burns swabs, vaginal and ear infections. Six different antibiotics were tested for sensitivity (Tetracycline, Cephalexin, Erythromycin, Clindamycin, Chloramphenicol, Trimethoprim). The isolates were then subjected to molecular screening for virulence genes. S. aureus was found in 110 isolates (52.38%). The results showed high resistance to Tetracycline (72.30%), Erythromycin (61.55%), Cephalexin (46.15%), Clindamycin (36.92%), Chloramphenicol (33.84%) and Trimethoprim (20%). This study recorded the highest sensitivity in the antibiotics Trimethoprim, Chloramphenicol and Clindamycin (80%), (66.15%), (64.61%), respectively. 16srRNA, hla, etb, crtN genes were detected in 110 (100%), 96 (87.5%), 55 (50%), 96 (87.5%) of the isolates, respectively. S. aueus which contains toxin genes, is seen in large numbers among clinical isolates. The results of the sequence analysis was analyzed by blast in the National Center Biotechnology Information (NCBI) and BioEdit program to detect polymorphism, the sequence by (NCBI) found 4 variations between 3 transversions , 1 transitions nucleotide, showed 99% under sequence ID: MG230264.1| and ID: MH603394.1 from 9 -788, 75-984 number of nucleotide from S. aureus strain AM and Staphylococcus aureus strain AT1 respectively of Gene Bank, and score (1394) and (1637).

Benzer Tezler

  1. Tez No

    719902

    Sığırlarda mastitisin teşhisinde mikrobiyolojik kültür ve çiftlik- kültür yöntemlerinin karşılaştırılması

    Comparison of microbiological culture and farm-culture methods for diagnosis of mastitis in cattles

    HALİD TEKKAL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiHarran Üniversitesi

    Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. OSMAN YAŞAR TEL

  2. Tez No

    552654

    Çeşitli tatlı su örneklerinden izole edilen bazı mikroalglerin antimikrobiyal özelliklerinin ve anti-çoğunluk algılama aktivitelerinin belirlenmesi

    Detection of antimicrobial and anti-quorum sensing activitiy of some microalgae isolated from various freshwater samples

    EDA BOZKURT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    MikrobiyolojiDumlupınar Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TUBA İÇA

  3. Tez No

    462952

    Kültür deniz balıklarında stafilokok enfeksiyonlarının çeşitli diyagnostik metotlarla tespiti üzerine bir çalışma

    A study on the detection of staphylococcal infections in cultured marine fish using various diagnostic methods

    ÖZGÜR ÇANAK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Histoloji ve Embriyolojiİstanbul Üniversitesi

    Su Ürünleri Yetiştiriciliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜLŞEN TİMUR

  4. Tez No

    79567

    Antibiyotiğe bağlı ishallerde Clostridium difficile'nin rolünün araştırılması

    The Investigation of the role clostridium difficile in antibiotic-associated diarrhea

    BÜLENT YERGÖK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1999

    MikrobiyolojiAnkara Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MEHMET KIYAN

  5. Tez No

    498392

    Tavuk etlerinde Salmonella spp. ve Campylobacter spp.'nin standart kültürel yöntem, ilmiğe dayalı izotermal amplifikasyon (LAMP) ve real-time PCR ile belirlenmesi ve doğrulanması

    Determination and identification of Salmonella spp. and Campylobacter spp. by standard culture method, loop-mediated isothermal amplification and real-time PCR in chicken meats

    MEHMET YÜKSEL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    GenetikAtatürk Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SELAHATTİN SERT

Geri Dön