The in vitro and in silico inhibition mechanism of glutathione reductase by some small molecules
Bazı küçük moleküller tarafından glutatyon redüktazın in vitro ve in silico inhibisyon mekanizması
- Tez No: 782868
- Danışmanlar: PROF. DR. VOLKAN EYÜPOĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 56
Özet
Antioksidan glutatyon redüktazın (GR) bir ürünü olan indirgenmiĢ glutatyon (GSH), etkilenen hücrelerde ikili bir iĢleve sahiptir ve bu nedenle birçok hastalık için terapötik bir hedeftir. Bu araĢtırmanın amacı, mevcut bilimsel literatüre yeni GR inhibitörlerini dahil etmekti. Orijinal kumarin yapısında bazı modifikasyonlar yapılmıĢ ve bu incelemede enzime karĢı yerleĢtirme araĢtırması yapılmıĢtır. Burada standart kumarin yapısı modifiye edilmiĢ ve Molegro Virtual Docker yazılımı kullanılarak bir enzime bağlanmıĢtır. Ġnsan glutatyon redüktazının (PDB ID: 2GH5) kristal yapısı üzerinde yerleĢtirme deneyleri yapıldı. Kumarin izotopları için Ģablon değerleri -158,567 ile 109,516 arasında değiĢiyordu. Enzim glutatyon redüktaz için afinite derecesi. Sonuçlar, biraz ince ayar ile kumarin türevlerinin Glutatyon Redüktaz enzimini etkili bir Ģekilde bloke etmek için kullanılabileceğini göstermektedir. Bu çalıĢmada sekiz kompleks kullanıldı ve bu komplekslerden biri olan Cu (S1M-S2) molekülü 2, baĢka bir deyiĢle GR enzimini inhibe etti. 7,92168 µM'lik bir IC50 değerinde, Cu(S1M-S2)2'nin GR enzimini inhibe ettiği gösterildi ve ikisi arasındaki 3D etkileĢim haritaları gösterildi.
Özet (Çeviri)
Reduced glutathione (GSH), a product of the antioxidant glutathione reductase (GR), has a dual function in affected cells and is thus a therapeutic target for many diseases. The purpose of this investigation was to include new GR inhibitors in the current scientific literature. Some modifications were made to the original coumarin structure, and a docking research against the enzyme was performed in this investigation. Here, the standard coumarin structure was modified and bound to an enzyme using the Molegro Virtual Docker software. Docking experiments were performed on the crystal structure of human glutathione reductase (PDB ID: 2GH5). Template values for coumarin isotopes ranged from -158.567 to 109.516. The degree of affinity for the enzyme glutathione reductase. The results indicate that with a little tweaking, coumarin derivatives can be used to effectively block the enzyme Glutathione Reductase. In this study, eight complexes were used, and one of these complexes The Cu (S1M-S2) molecule 2 inhibited the GR enzyme, to put it another way. At an IC50 value of 7.92168 µM, Cu(S1M-S2)2 was shown to inhibit the GR enzyme, and 3D interaction maps between the two were shown.
Benzer Tezler
- İnsan glukoz 6-fosfat dehidrogenaz enzimi üzerine anti-aritmik ilaçların etkilerinin belirlenmesi ve inhibisyon mekanizmalarının aydınlatılması
Determining the effects of anti-arithmic drugs and inhibitionmechanisms on human glucose 6-phosphate dehydrogenase enzyme
GÖKÇE KIZILBAY
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
BiyokimyaKilis 7 Aralık ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MUHAMMET KARAMAN
- Yeni kinazolinon-imin türevi moleküllerin sentezlenmesi ve glukoz 6-fosfat dehidrogenaz enzim aktivitesi üzerine etkilerinin in vitro ve in siliko yöntemler ile belirlenmesi
Synthesis of new quinazolinone-imine derivative molecules and determination of their effects on activity of glucoses 6-phosphate dehydrogenase enzyme using in vitro and in silico methods
FATMA YAPICI
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyokimyaKilis 7 Aralık ÜniversitesiMoleküler Biyokimya ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUHAMMET KARAMAN
- Chrysophanol molekülünün In siliko ve In vitro ortamda Pseudomonas aeruginosa Quorum sensing mekanizması ve biyofilm formu üzerine etkilerinin belirlenmesi
Determination of the effects of Chrysophanol on Pseudomonas aeruginosa Quorum sensing mechanism and biofilm formation via In vitro and In silico methods
AYLA YILDIZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
MikrobiyolojiMarmara ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NÜZHET CENK SESAL
PROF. DR. SERDAR DURDAĞI
- Bisfenol türevlerinin asetilkolinesteraz enzimi üzerindeki inhibisyon etkisinin in vitro ve in silico modellenmesi
In vitro and in silico modelling of inhibitory effects ofbisphenol derivatives on acetylcholinesterase enzyme
WALEED MOHAMMED KHORSHEED KHORSHEED
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
GenetikVan Yüzüncü Yıl ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ CAN YILMAZ
- Bazı yeni organik bileşiklerin tirosinaz ve alfa amilaz inhibisyon potansiyellerinin in vitro ve in siliko olarak incelenmesi
In vitro and in silico investigation of tyrosinase and alpha amylase inhibition potentials of some new organic compounds
BÜŞRA KURNAZ