Association study of polymorphic variants of candidate genes in rheumatoid arthritis and comparison of patient diets
Aday genlerin polimorfik çeşitlerinin ilişkilendirilmesi çalışması romatoid artrit ve hasta diyetlerinin karşılaştırılması
- Tez No: 795948
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ ÖZGE SEÇMELER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Altınbaş Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomedikal Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyomedikal Teknolojiler Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Romatoid artrit (RA), en çok güçten düşüren kronik otoimmün hastalıklardan biridir. sistemik inflamasyon ve otoantikor üretimi. RA etiyolojisinde hem genetik ve çevresel faktörler rol oynamaktadır. NOD2, 1040 amino asitten oluşan bir proteini kodlar. Enflamatuarın kritik bir düzenleyicisi olarak romatoid artrit etiyolojisinde yer almıştır. tepkiler. Mevcut çalışmanın amacı, rs3135500 G>A ve rs3135499'un etkisini değerlendirmekti. NOD2 geninin promotör bölgesindeki A>C polimorfizmleri, gıda etkisine ek olarak hasta sağlığı hakkında. Bu çalışmaya iki yüz katılımcı katıldı. onları ikiye ayırdık gruplar, 100 hasta ve 100 sağlıklı denek. Toplam genomik deoksiribonükleik asit (gDNA) tam kandan toplandı ve rs3135500 G>A ve rs3135499A>C için genotiplendi (rhAmp-PCR) ile polimorfizmler. Sonuçlar uygun istatistiksel analizlerle işlendi. Hastaların antropometrik ve biyokimyasal verileri t testi veya Çeşitli kalıtım modelleri altında ANOVA. Yaş, BMI, ESR, PCV, WBC, üre ve kreatinin analiz edildi. Çalışılan her iki SNP için genotip ve alel frekansı analizi, RA ve kontrolde eş baskın, baskın, çekinik ve aditif modeller altında incelendi konular. rs3135499 SNP analizi, ESR'nin önemli bir varyasyon olduğunu, ancak diğer tüm ESR ve üre baskın olanda önemli iken, parametreler eş baskında anlamlı değildir. Ortak baskındaki rs3135500 SNP değerlendirmesi önemli farklılıklar gösterdi. Ancak, altında baskın, üre araştırıldı anlamlı ve diğer parametreler anlamlı değildi. AC P<0.05 genotipinin rs3135499 bütün tahıl ile ilişkisi, terbiyeli peynir, VIT D, hafif yoğurt ve zeytinyağı önemli iken diğer gıda türleri sergilenmez. önemli. rs3135500'de SNP, tam tahıl, terbiyeli peynir ile genotip ilişkisini fark etti. light yoğurt, zeytinyağı ve süt önemlidir. Diğer tüm gıdalar herhangi bir değişiklik göstermedi. Biz NOD2 geninin rs3135499 ve rs3135500 polimorfizmleri ile ilişkili olduğu sonucuna varmak romatoid artrit riski ve rs3135499 polimorfizmi içindeki C alleli ve A alleli gibi görünüyordu rs3135500 içinde hastalık aktivitesi ile ilişkilendirilmiştir.
Özet (Çeviri)
Rheumatoid arthritis (RA) is one of the most debilitating chronic autoimmune illnesses marked by systemic inflammation and the production of autoantibodies. In the etiology of RA, both genetic and environmental factors play a role. NOD2 encoding a protein consisting of 1040 amino acids. It has been implicated in the etiology of rheumatoid arthritis as a critical regulator of inflammatory responses. The aim of the current work was to assess the effect of rs3135500 G>A and rs3135499 A>C polymorphisms in the promoter region of the NOD2 gene in addition to the impact of food on patient health. Two hundred participants were involved in this study. We divided them into two groups, 100 patients and 100 healthy subjects .Total genomic deoxyribonucleic acid (gDNA) was harvested from whole blood and genotyped for rs3135500 G>A and rs3135499A>C polymorphisms by (rhAmp-PCR). The results were treated by appropriate statistical analysis. Anthropometric and biochemical data of patients were analyzed by using either the t test or the ANOVA under various inheritance models. Age, BMI, ESR, PCV, WBC, urea, and creatinine were analyzed. The analysis for genotype and allele frequency for both studied SNPs were examined under co-dominant, dominant, recessive, and additive models in RA and control subjects. The rs3135499 SNP analysis revealed that ESR is significant variation but all other parameters are no significant in the co-dominant while ESR and urea are significant in dominant. The rs3135500 SNP assessment in co-dominant exhibited significant variations. However, under the dominant, urea explored significant and other parameters showed no significant. Association rs3135499 of the genotype AC P<0.05 with a relationship with each of the whole grain, seasoned cheese, VIT D, light yogurt, and olive oil are significant while other types of foods are not exhibit significant. In rs3135500 SNP noticed genotype association with whole grain, seasoned cheese, light yogurt, olive oil and milk are significant. All other foods were not showed any variation. We conclude the polymorphisms rs3135499 and rs3135500 of NOD2 gene were associated with rheumatoid arthritis risk, and it seemed that C allele within rs3135499 polymorphism, and A allele within rs3135500 were associated with disease activity.
Benzer Tezler
- Afyonkarahisar ili bölgesinde yetiştirilen holstein sığırlarda süt verimliliği ile ilişkili pit 1 geni mutasyonlarının araştırılması
Investigation of pit 1 gene mutations associated with milk productivity in holstein cattle raised in Afyonkarahisar province region
PELİN GEZER BİLECEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
GenetikAfyon Kocatepe ÜniversitesiMedikal Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CEVDET UĞUZ
- Angiotensin Converting Enzim (ACE) gen polimorfizminin uzun mesafe koşucuları, sprinter, futbolcular ve sedenter populasyonda karşılaştırılması
The Comparison of angiotensin converting enzyme (ACE) genetic polymorphism among long distance runners, sprinters, football players and sedentary population
FİGEN ÇİLOĞLU
Doktora
Türkçe
2001
Tıbbi BiyolojiMarmara ÜniversitesiSağlık Bilimleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İSMAİL PEKER
- İnflamatuvar Barsak hastalığında sitokin gen polimorfizmleri
Başlık çevirisi yok
YASEMİN ÇELİK
Yüksek Lisans
Türkçe
2004
BiyoteknolojiAnkara ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
PROF.DR. MİTHAT BOZDAYI
- Güreşçilerde ve sedenter populasyonda eNOS gen polimorfizminin karşılaştırılması
Compairing gene polymorphism of eNOS in wrestlers and sedentary population
ZÜMRÜT KAVUNCUOĞLU
- Major depresyon olgularında norepinefrin transfer geni polimorfizmleri sıklığı
Frequency of norepinephrine transporter gene polymorphisms in major depression
HAKAN GÜRKAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2006
Tıbbi BiyolojiTrakya ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. GÖKAY BOZKURT