Çeşitli klinik örneklerden izole edilen salmonella SPP. suşlarında biyofilm varlığının tespit edilmesi ve antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi
From various clinical samples, salmonella SPP. isolated and determination of biofilm development and antibiotic sensitivity
- Tez No: 797285
- Danışmanlar: PROF. DR. AKGÜN YAMAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Antibiyotik duyarlılığı, biyofilm, salmonella, salmonelloz, Vitek-2, Antibiotic susceptibility, biofilm, salmonella, salmonellosis, Vitek-2
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çukurova Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 71
Özet
Dünya çapında genellikle en yaygın olan Salmonella serovarları, S. enterica subsp. enterica ve S. enterica serovar typhimurium ve S. enterica serovar enteritidis'tir. Sanayileşmiş ülkelerde Salmonella spp. enfeksiyonları, tifo dışı salmonellozun daha sık görüldüğü dört farklı klinik tabloya neden olur. Bunlar, gastorenterit olguları, tifo-paratifo, sepsis ve lokal organ enfeksiyonlarıdır. Salmonella'rın diğer mikroorganizmalar gibi antibiyotiğe dirençli olgusu halk sağlığı için ciddi bir tehdittir. Aynı zamanda bu bakterilerin biyofilm oluşturma yeteneği konusu da göz önüne alındığında, antibiyotik direnci sorununu daha ciddi hale getirmektedir. Çalışmamıza, çeşitli hastanelerin merkez laboratuvarlarına gönderilen Ocak 2020- Aralık 2022 arasında çeşitlik klinik örneklerden izole edilen 101 Salmonella spp. suşunun, biyofilm varlığının tespit edilmesi ve antibiyotik duyarlılıkları incelenmiştir. İzolatların antibiyotik duyarlılık testleri Vitek-2 compact sistemle çalışılmış, Eucast 2022 MİK değerlerine göre belirlenmiştir. Suşların biyofilm özellikleri mikroplak yöntemi ile belirlenmiştir. Salmonella spp. izolatlarının % 39.60'ında biyofilm gelişimi gözlenmiş % 60.40'ında biyofilm gözlenmemiştir. En hassas antibiyotikler Trimetoprim / Sülfametaksezol (% 99.00), Amikasin (%99.00), Ertapenem (% 99.00), Meropenem (% 99.00), Piperasilin / Tazobaktam (%98.01), Seftazidim (% 97.02), Sefepim (% 97.02), Gentamisin (% 97.02), Kolistin (%96.03), Seftriakson (% 95.04), Sefoksitin (% 94.05), Amoksisilin / Klavulanik Asit (% 90.09), Ampisilin (% 87.12) ve Siprofloksasin (% 83.16) iken en direçli olan antibiyotikler Siprofloksasin (% 16.83), Ampisilin (% 12.87), Amoksisilin / Klavulanik Asit (% 9.90), Sefazolin (% 5.94), Seftriakson (% 4.95), Kolistin (% 3.96), Sefoksitin (% 2.97), Seftazidim (% 2.97), Gentamisin (% 2.97), diğerleri (% 0.99) şekilde sıralanmıştır Çalışmamızdaki bulguların Salmonella'nın virülansla ilişkili bazı özellikleri kimyasal dezenfektanlara ve antibiyotiklere direnç gibi, bakterinin adezyonu, abiyotik yüzeylerde biyofilm oluşumunu, antibiyotik direnci ile bakterilerin biyofilm oluşturma yeteneği arasında yol gösterici olacağı düşünülmektedir.
Özet (Çeviri)
In general, the most common Salmonella serovars worldwide are S. enterica subsp. enterica and S. enterica serovar typhimurium and S. enterica serovar enteritidis. In industrialized countries, Salmonella spp. infections cause four different clinical pictures in which non-typhoidal salmonellosis is more common. These are cases of gastroenteritis, typhoid paratyphoid, sepsis and local organ infections. Antibiotic-resistant Salmonella species, like other microorganisms, pose a serious threat to public health. In addition, considering the ability of these bacteria to form biofilms, it makes the problem of antibiotic resistance more serious. In our study, 101 Salmonella spp. isolated from various clinical specimens sent to the central laboratories of various hospitals. Between January 2020 and December 2022, the presence of biofilm and detection of antibiotic susceptibility of the strain were investigated. Antibiotic susceptibility tests of isolates were studied with Vitek-2 compact system and determined according to Eucast 2022 MIC values. Biofilm development of strains was determined by microplate method.While biofilm development was observed in 39.60 % of Salmonella spp. isolates, no biofilm was observed in 60.40 %. The susceptibility rate of Ampicillin, Amoxicillin / Clavulanic Acid, Piperacillin / Tazobactam, Cefazolin, Cefoxitin, Ceftazidime, Ceftriaxone, Cefepim, Ertapenem, Meropenem, Amikacin, Gentamicin, Ciprofloxacin, Colistin, Trimethoprim/Sulfametaxesol, respectively; 87.12%, 90.09%, 98.01%, 16.83%, 94.05%, 97.02%, 95.04%, 97.02%, 99.00%, 99.00%, 99.00% 97.02%, 83.16%, 96.03% and 99.00% and resistance rates 12.87%, respectively. 9.90%, 1.98%, 5.94%, 2.97%, 2.97%, 4.95%, 0.99%, 0.99%, 0.99%, 2.97%, 16.83%, 3.96%, 0.99%. The ratios of Cefazolin, Cefoxitin, Cefepim are moderately sensitive, respectively; 77.22%, 2.97%, 1.98%. It is thought that the findings of our study will lead to some virulence-related properties of Salmonella such as resistance to chemical disinfectants and antibiotics, as well as bacterial adhesion, biofilm formation on abiotic surfaces, antibiotic resistance and the ability of bacteria.
Benzer Tezler
- Bakteriyofajların bazı gıda ve klinik örneklerden izole edilen Salmonella spp. ve Salmonella biyofilmi üzerine etkisi
The effect of bacteriophages on Salmonella spp, and Salmonella biofilms which were isolated from some food and clinical samples
BEHZAD HESHMATI
Doktora
Türkçe
2019
BiyoteknolojiÇukurova ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. IŞIL VAR ÖNGEL
- Istranca meşesi (quercus hartwıssıana steven)'nin hastane patojenlerine karşı antimikrobiyal aktivitesi
Antimicrobial activity of istranca oak (quercus hartwissiana steven) against hospital pathogens
ADEM AKKUŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
MikrobiyolojiDüzce ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. EMEL ÇALIŞKAN
- İshal yakınmasıyla çocuk kliniğine başvuran hastalarda bakteriyel gastroenterit etkenlerin araştırılması
The investigation of bacterial gastroenteritis agents in patients who admitted to pediatric clinic with complaints of diarrhea
MUHAMMET ŞÜKRÜ AĞRALI
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
MikrobiyolojiNecmettin Erbakan ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. METİN DOĞAN
- Diyarbakır Çocuk Hastalıkları Hastanesinde, kan kültüründen izole edilen, kolay üreyen gram negatif bakterilerin prevelansı ve antibiyotiğe duyarlılıkları
Prevalance and antimicrobial susceptibilities of non-fastidious gram negative bacteria isolated from blood samples of patients in Diyarbakır Pediatric Hospital
ENGİN TURAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıHarran ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET BAYRAKTAR
- Toplum kökenli ve hastane kökenli infeksiyonlardan elde edilen gram negatif bakterilerin kinolon grubu antibiyotiklere direncinin araştırılması
Investigation of resistance to quinolone group antibiotics in gram-negative bacteria derived from population based and hospital based infections
AYŞE BAŞTOPÇU
Yüksek Lisans
Türkçe
2008
MikrobiyolojiAtatürk ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HALİL YAZGI