Geri Dön

Tiroid kanseri patogenezinde insan lıne-1 retrotranspozonlarının mutajenik rollerinin araştırılması

Investigation of mutagenic roles of human line-1 retrotransposons in the pathogenesis of thyroid cancer

PDF İndir

  1. Tez No: 797989
  2. Yazar: ÇAĞRI GÜMÜŞKAPTAN
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ ÜMMET ABUR
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Genetik, Moleküler Tıp, Genetics, Molecular Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 111

Özet

Tiroid kanseri dünya çapında en yaygın endokrin malignite olup yeni görülen tüm kanser vakaları arasında 9. sırada yer almaktadır. Son 30 yılda papiller tiroid karsinomu insidansında önemli bir artış görülmektedir. TC-PTK (Tall Cell alt tip Papiller Tiroid Karsinomu)'nda gözlemlenen insidans artışı ise klasik PTK (K-PTK)'den daha yüksektir. Bu nedenle, K-PTK ve TC-PTK genomlarını etkileyen hücre içi mutajenik faktörlerin açığa çıkarılması önem arz etmektedir. Literatürde, insana özgü LINE-1 (L1HS) retrotranspozonlarının birçok farklı kanser tipinin patogenezinde rol oynadığı bildirilmiş; ancak tiroid kanseri patogenezindeki rolü henüz tartışılmamıştır. Histopatolojik olarak sınıflandırılmış klasik ve TC-PTK hastalarına ait tümör ve kontrol FFPE (Formalinle Fikse edilmiş Parafine Gömülmüş) doku örneklerinden izole edilen DNA'larda, en genç / aktif L1 retrotrotranspozonları olan L1HS alt ailesinin insersiyon profilleri, TE-NGS (Transpoze olabilen Element Yeni Nesil Dizileme) yöntemi kullanılarak karşılaştırılmıştır. K-PTK ve TC-PTK örneklerinin hem tümör hem de kontrol dokularında tespit edilen L1HS insersiyonlarının sıklıkla intronik bölgelerde lokalize olduğu görülmüştür. K-PTK ve TC-PTK gruplarında, kanserlerde yanlış uç birleştirme mutasyonları raporlanmış birçok gende L1HS insersiyonları tespit edilmiştir. Tümör doku örneklerinde saptanan L1HS'lerin kanser-ilişkili sinyal yolaklarındaki dağılımları, her iki grupta da benzer bulunmuştur. Bununla birlikte L1HS'lerin K-PTK kontrol dokularında RTK-RAS sinyal yolağı proto-onkogenlerinde birikim gösterdiği, TC-PTK'de ise Hippo sinyal yolağının tümör baskılayıcı genlerinde zenginleştiği saptanmıştır. Doku tipinden bağımsız olarak gruplarda aynı sinyal yolaklarının proto-onkogenlerinde görülen L1HS insersiyonlarının K-PTK grubunda sıklıkla intronik bölgelerde, TC-PTK grubunda ise sonucunda hedef proto-onkogenlerin upregülasyonuna neden olabilecek 5'Komşu gen bölgelerinde lokalize olduğu görülmüştür. Sonuçlar, L1HS retrotranspozonlarının klasik ve tall cell alt tip PTK'nin hem kontrol hem de tümör dokusu genomlarında aktif olduğunu ve neoplastik transformasyon için gerekli arka plan genetik kararsızlığına katkı sağladığını göstermektedir. Ayrıca, K-PTK ve TC-PTK gruplarının sahip olduğu farklı L1HS insersiyon profillerinin özgün histopatolojik ve klinik sonuçların oluşmasında rol oynayabilecek nitelikte olduğu görülmektedir. Buradaki bulgular, L1HS retrotranspozonlarının tiroid kanserinde potansiyel bir terapötik hedef olarak önemini ortaya koymaktadır.

Özet (Çeviri)

Thyroid cancer is the most common endocrine malignancy worldwide and ranks 9th among all new cancer cases. There has been a significant increase in the incidence of papillary thyroid carcinoma in the last 30 years. The incidence increase observed in TC-PTC (Tall Cell subtype Papillary Thyroid Carcinoma) is higher than in classical PTC (C-PTC). Therefore, identifying intracellular mutagenic factors affecting C-PTC and TC-PTC genomes is essential. It has been reported in the literature that human-specific LINE-1 (L1HS) retrotransposons play a role in the pathogenesis of many different cancer types; however, its role in the pathogenesis of thyroid cancer has not yet been discussed. Insertion profiles of the L1HS subfamily, the youngest / most active L1 retrotransposons, in DNAs isolated from tumour and control FFPE (Formalin-Fixed Paraffin-Embedded) tissue samples of histopathologically classified classical and TC-PTC patients were compared using TE-NGS (Transposable Element Next Generation Sequencing) method. L1HS insertions detected in both tumour and control tissues of C-PTC and TC-PTC samples were frequently localised in intronic regions. In the C-PTC and TC-PTC groups, L1HS insertions were found in many genes with mis-splicing mutations reported in cancers. The distribution of L1HS insertions in cancer-associated signalling pathways was found to be similar in both C-PTC and TC-PTC tumour tissue samples. Nevertheless, it was determined that L1HSs accumulated in the RTK-RAS signalling pathway proto-oncogenes in C-PTC control tissues, while in the TC-PTC, they were enriched in tumour suppressor genes of the Hippo signalling pathway. Regardless of tissue type, L1HS insertions seen in proto-oncogenes of the common signalling pathways in the groups were frequently localised within the intronic regions in the C-PTC group, and in the TC-PTC group, they mainly were at 5' flank regions, which could result in upregulation of the target proto-oncogenes. The results suggest that L1HS retrotransposons are active in both control and tumour tissue genomes of classical and tall cell subtype PTC and contribute to the background genetic instability required for neoplastic transformation. In addition, it is observed that the different L1HS insertion profiles of the C-PTC and TC-PTC groups may play a role in forming of unique histopathological and clinical results. The findings here reveal the importance of L1HS retrotransposons as a potential therapeutic target in thyroid cancer.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    855769

    Demodeks enfestasyonu ile tiroid otoimmünitesi arasındaki ilişkinin araştırılması

    Investigation of the relationship between demodex infestation and thyroid autoimmunity

    MUHAMMED BURAK YÜCEL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    DermatolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Deri ve Zührevi Hast. Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. RAGIP ERTAŞ

  2. Tez No

    809040

    Tiroid kanserli olgularda ilişkili genlerin yeni nesil dizileme yöntemi ile taranması: verilerin biyoinformatik analizi

    Screening of associated geneswith new generation sequencing in patient swith thyroidcancer: bioinformatics analysis of data

    MERVE MAŞA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyomühendislikSüleyman Demirel Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. KUYAŞ HEKİMLER ÖZTÜRK

  3. Tez No

    818583

    Development of mirna biomarkers for the differentiation between gingivitis and periodontitis: A pilot study

    Gingivitis ve periodontitis ayrımı için mirna biyobelirteçlerinin geliştirilmesi: Pilot çalışma

    DHAFIR LATIEF FAYADH FAYADH

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    BiyokimyaSüleyman Demirel Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUSTAFA CALAPOĞLU

  4. Tez No

    796758

    İyot refrakter papiller tiroid karsinomunda PTTG-1 (pıtuıtary tumor transformıng gene 1) gen ekspresyonunun değerlendirilmesi

    Evaluation of PTTG-1 (pituitary tumor transforming gene 1) gene expression in iodine refractory papillary thyroid carcinoma

    BAŞAK ÖZTÜRKMEN ÇAKIR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    İç HastalıklarıGaziantep Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ZEYNEL ABİDİN SAYİNER

  5. Tez No

    316934

    Diferansiye tiroid kanserlerinde insülin direnç gen polimorfizmlerinin araştırlması

    Investigation of insulin resistance gene polymorphisms in differentiated thyroid cancers

    MUSTAFA AKKER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    Endokrinoloji ve Metabolizma HastalıklarıTrakya Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SİBEL GÜLDİKEN

Geri Dön