Geri Dön

Ülkemizde HCV türünün tayini

HCV genotype determination in Turkey

  1. Tez No: 80205
  2. Yazar: KAZIM SOYLU
  3. Danışmanlar: PROF. DR. İSMAİL HAKKI GÖKHUN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyokimya, Biochemistry
  6. Anahtar Kelimeler: Chronic hepatitis, HCV-RNA, genotype, PCR, RFLP
  7. Yıl: 1997
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ankara Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 75

Özet

ÖZET ÜLKEMİZDE HCV TÜRÜNÜN TAYİNİ Bu çalışmada kronik hepatit tanısı almış 45 hastanın serumlarında ELISA yöntemi ile Anti- HCV-Ab, nested RT- PCR ile HCV-RNA ve RFLP yöntemi ile de genotip tayinleri yapılmıştır. Anti-HCV-Ab tayininde Abbott firmasına ait II. kuşak ELISA kiti kullanılmıştır. HCV-RNA tayininde ise hasta serumları GSCN ve fenol-kloroform karışımları ile ekstrakte edilerek, elde edilen virüs RNA'sı ters transkripsiyon ile c DNA elde edilmiştir. Virüs genomunun çok iyi korunduğu belirtilen 5'NCR bölgesine ait primeler kullanılarak nested-PCR yapılmıştır. İkinci PCR ürünü agarose jel elektroforezinde yürütülerek, jeldeki ethidiumbromür sayesinde görünür hale getirilmişlerdir. Kullanılan bir DNA markeri ile kıyaslanan numunelerin bant büyüklüğü 251 bp uzunluğunda olmaları beklendiğinden, buna uygun örnekler pozitif olarak kabul edilmiştir. İkinci PCR ürünü olan 251 bp'lik DNA fragmanları, genotip tayini yapılmak üzere uygun restriksiyon endonükleazlarla kesilmeleri sağlanmıştır. Kırılmış DNA parçaları PAGE'de yürütülerek büyüklüklerine göre PAGE'de ayrılmaları sağlanmıştır. Bu DNA fragmanlarının boyutları kullanılan uygun bir marker ile kıyaslanmıştır. Burada değişik bp'lik 0XHae III markeri kullanılarak, HCV genotipleri belirlenmiştir. Anahtar kelimeler : Kronik Hepatit, HCV-RNA, genotip, PCR, RFLP

Özet (Çeviri)

SUMMARY HCV Genotype Determination in Turkey In this study anti-HCV-Ab, was determinated by ELISA, HCV-RNA was determinated by RT-PCR and genotyping was determinated by RFLP in the sera of 45 patients diagnosed as chronic hepatitis. Second generation ELISA kit was used for Anti-HCV-Ab. For HCV-RNA determination patient sera was extracted with GSCN and phenol-chloroform mixture and cDNA was obtained by reverse transcription of virus RNA. Nested PCR was achieved by using the primers belonging to the 5 'NCR of the genom which is known to be well conserved. Th second PCR product was made visible by the ethidium bromide of the gel in agarose gel electrophoresis. Since 25 1 bp band length was expected when compared with a DNA marker used, samples suitable to that length were considered as positive,. 251 bp DNA fragments of the second generation products have been cut with suitable restriction endonucleases in order for genotyping. Cut DNA fragments were separated according to size in PAGE. Lengths these DNA fragments were compared with a suitable marker In this study X Hae III marker of different bps were used for genotyipe determination.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    194027

    Kronik hepatit C tedavisinde interferon-alfa; 2a indüksiyon + ribavirin ile peginterferon-alfa; 2a + ribavirin kombinasyonlarının karşılaştırılması

    A comparison of interferon alfa-2a induction plus ribavirin combination therapy with peginterferon alfa-2a plus ribavirin combination therapy for the treatment of chronic hepatitis C

    HAYATİ DEMİRASLAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıErciyes Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BİLGEHAN AYGEN

  2. Tez No

    118431

    Erzurum ve çevresinde hepatit C seroprevalansının araştırılması

    Başlık çevirisi yok

    SERVET KÖLGELİER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2002

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıAtatürk Üniversitesi

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. MEHMET A. TAŞYARAN

  3. Tez No

    91973

    Uzun süre yurt dışında yaşama öyküsü bulunan ve bulunmayan HCV ile infekte olmuş bireylerdeki risk faktörlerinin ve viral genotiplerin araştırılması

    The Investigation of the risk factors and viral genotypes in the HCV infected patients who have been living abroad for many years and who have not

    VEDAT TURHAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2000

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıGATA

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. CAN POLAT EYİGÜN

  4. Tez No

    131777

    Kronik hepatit C virüs infeksiyonlu hastalarda infeksiyon kaynakları ile hepatit C virüs genotipleri arasındaki ilişki

    Hepatitis C virus transmission routes in chronic hepatitis C patients and the relationship between the virus genotype and the transmission routes

    FAHRİYE KESKİN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2003

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SALİH TÜRKOĞLU

  5. Tez No

    107814

    Kronik HCV infeksiyonlu hastalarda otoimmun serolojik göstergelerin ve doku antijenlerinin araştırılması

    Başlık çevirisi yok

    AYLA YENİGÜN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2001

    MikrobiyolojiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BELMA DURUPINAR

Geri Dön