Geri Dön

Sığır karkaslarında ve kesimhane ortamında antibiyotik dirençli ekstraintestinal patojenik escherichia coli (Expec) varlığının belirlenmesi

Determination of presence of antibiotic resistant extraintestinal pathogenic escherichia coli (Expec) in cattle carcasses and slaughterhouse environment

PDF İndir

  1. Tez No: 803664
  2. Yazar: REŞAT ÇİFTÇİ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. HÜSNÜ ŞAHAN GÜRAN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Besin Hijyeni ve Teknolojisi, Food Hygiene and Technology
  6. Anahtar Kelimeler: Besi sığırı, Ekstraintestinal patojenik E. coli (ExPEC), kesimhane, antimikrobiyal duyarlılık, filogenetik grup, klonal ilişki, Beef cattle, Extra-intestinal pathogenic E. coli (ExPEC), slaughterhouse, antimicrobial susceptibility, phylogenetic groups, clonal relatedness
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Dicle Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Gıda Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 100

Özet

Amaç: Bu çalışmada, besi sığırlarında ve kesimhane ortamında ExPEC varlığının, filogenetik gruplarının, antimikrobiyal direnç fenotiplerinin ve bunların klonal ilişkilerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Toplam 447 besi sığırı örneği [rektum (n:133), deri (n:133), karkas (n:133)], çevre örnekleri [padok (n:12), bıçak (n:18), su (n:6)] ve personel eli örneklerinde [(n:12)] klasik mikrobiyolojik yöntemler ve multipleks PCR (papA, papC, iutA, kpsMTII ve fimH virülans genleri) kullanılarak ExPEC varlığı analiz edildi. Filogenetik grupları triplex PCR ile (TspE4.C2 klonu, chuA ve yjaA genleri), ERIC-PCR ile klonal ilişkileri test edildi ve EUCAST standartlarına göre antibiyotik duyarlılığı tarandı. Bulgular: Analiz edilen 447 numuneden 36'sının (% 8,80) ExPEC ile kontamine olduğu tespit edildi. Karakterize edilen 36 ExPEC izolatı arasında, D (14/36, % 38,88), B2 (9/36, % 25), B1 (9/36, %25) ve A (2/36, % 5,55 ) olmak üzere dört filogenetik grup tanımlanmıştır. İzolatların % 61,11'inin (22/36) en az iki antibiyotiğe dirençli olduğu ve en yüksek direncin % 61,11 ile ampisiline karşı olduğu belirlendi. ERIC-PCR sonuçları, 100 ile 1500 bp arasında değişen çok sayıda bandın (1-5 bant) çoğaldığını gösterdi. Ayrıca, ERIC-PCR paternleri 19 kümede sınıflandırıldı. Sonuç: Bu çalışma sonuçları, besi sığırı ve kesimhane ortamlarının genetik olarak benzer antibiyotiğe dirençli ExPEC'ler için potansiyel bir kontaminasyon kaynağı olabileceğini göstermektedir. Bu bağlamda, besi sığırlarında ExPEC'in düzenli olarak izlenmesi ve Tek Sağlık yaklaşımı içinde ele alınması önemli olacaktır.

Özet (Çeviri)

Aim: In this study, it was aimed to determine ExPEC presence, phylogenetic groups, antimicrobial-resistant phenotypes, and their clonal relatedness in beef cattle and slaughterhouse environment. Materials and Methods: A total of 447 beef cattle samples [rectum (n:133), hides (n: 133), carcass (n:133)], environment samples [paddock (n:12), knife (n:18), water (n:6)], and workers hand samples [(n:12)] were analyzed for the presence of ExPEC using classic microbiological methods and multiplex PCR (papA, papC, iutA, kpsMTII and fimH virulence genes). Phylogenetic groups were tested by triplex PCR (TspE4.C2 clone, chuA and yjaA genes), and clonal relatedness was tested by ERIC-PCR, and screened for antibiotic susceptibility according to the EUCAST standards. Results: 36 (8,80%) out of the 447 samples analyzed were contaminated with ExPEC. Among the 36 ExPEC isolates characterized, four phylogenetic groups were identified including D (14/36, 38,88%), B2 (9/36, 25%), B1 (9/36, 25%) and A (2/36, 5,55%). It was determined that 61,11 % (22/36) of the isolates were resistant to at least two antibiotics and the highest resistance was found against ampicillin with 61,11 %. The ERIC-PCR results showed that proliferated numerous bands (1-5 bands), ranging from 100 to 1500 bp. Moreover, the ERIC-PCR patterns were classified into 19 clusters. Conclusion: The results of this study show that beef cattle and slaughterhouse environments can be a potential contamination source of genetically similar antibiotic-resistant ExPECs. In this context, it will be important to monitor ExPEC regularly in beef cattle, and to deal with it within the framework of One Health approach.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    311401

    Kayseri ilindeki bir kesimhanede sığır kesim hattının haccp planının mikrobiyolojik indikatörler yönünden değerlendirilmesi

    Evaluation of microbiological indicators for haccp slaughterhouse line in Kayseri business operator

    MUSTAFA BACAK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    Veteriner HekimliğiErciyes Üniversitesi

    Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ZAFER GÖNÜLALAN

  2. Tez No

    553204

    Sığır dışkı ve karkaslarından clostrıdıoıdes dıffıcıle'nin izolasyonu ve elde edilen izolatların moleküler karakterizasyonu

    Isolation of clostridioides difficile from cattle faeces and carcasses and molecular characterization of the isolates recovered

    EMRAL FEVZİ AHMED

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Veteriner HekimliğiErciyes Üniversitesi

    Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SEÇİL ABAY

  3. Tez No

    894318

    Sığır karkaslarından izole edilen gıda kaynaklı patojen bakterilerin, fizyolojik ve biyokimyasal özelliklerinde mevsimsel değişimlerin etkisi

    The effect of seasonal changes on the physiological and biochemical properties of foodborne pathogenic bacteria isolated from beef carcass-es

    SİNEM GÜREN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiAfyon Kocatepe Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GÖKHAN AKARCA

  4. Tez No

    429047

    Kahramanmaraş ilindeki bir kesimhanede escherichia coli o157:h7 varlığının IMS PZR teknikleri ile araştırılması

    Investigation of escherichia coli O157:H7 by IMS-PZR tecniques in slaughtered cattle in kahramanmaraş province

    SABRI DATLI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Veteriner HekimliğiErciyes Üniversitesi

    Veteriner Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim dalı

    DOÇ. DR. NURHAN ERTAŞ ONMAZ

  5. Tez No

    225931

    Sığır karkaslarında Escherichia coli O157 ve O157:H7 prevelansı ile Stx1 ve Stx2 genlerinin belirlenmesi

    The prevalance of Escherichia coli O157 and O157:H7 in cattle carcass with determination of Stx1 and Stx2 genes

    GÖKHAN İNAT

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    Besin Hijyeni ve TeknolojisiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BELGİN SIRIKEN

Geri Dön