Geri Dön

Sirkadiyen ritmin aşı ile edinilen bağışıklık yanıtına etkisinin CRISPR/CAS9 tekniğiyle araştırılması

Investigation of the effect of circadian RHYTHM on vaccine-acquired immune response with CRİSPR/CAS9 technique

PDF İndir

  1. Tez No: 804543
  2. Yazar: AYBÜKE OKAY
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. SEMRA AYDIN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Tıbbi Biyoloji, Biotechnology, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Aşı Çalışmaları Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 126

Özet

Sirkadiyen ritimler, gen ekspresyonunun zaman içinde düzenlenmesiyle ortaya çıkan biyolojik süreçlerdir. Bu süreçler, uyku ve uyanıklık döngüsü, hormonal salım, metabolizma ve bağışıklık fonksiyonları gibi birçok biyolojik süreci etkiler. Bu nedenle sirkadiyen ritimler, genlerin düzenli bir şekilde ifade edilmesi ve vücudun uygun bir şekilde düzenlenmesi için önemlidir. Bir sirkadiyen gen olan TIMELESS, hücre döngüsü, DNA hasar yanıtı gibi çeşitli biyolojik süreçlerde de rol oynadığından, geniş bir araştırma alanı oluşturmaktadır. Bu tez çalışması kapsamında, TIMELESS sirkadiyen geninin bağışıklık sistemiyle ilişkisi araştırılmıştır. Bu amaçla, öncelikle in silico yöntemler kullanılarak TIMELESS'ın fizikokimyasal özellikleri, hücre içi lokalizasyonu ve 3 boyutlu protein yapısı incelenmiştir. Ardından filogenetik ağaç ve motif analizi yapılarak TIMELESS'ın evrimsel ilişkileri belirlenmiştir. Daha sonra in silico yollarla TIMELESS'ı hedefleyen 52 miRNA tespit edilmiştir. Bu miRNA'ların kanserle, bağışıklık ve enfeksiyonla ilişkili olduğu biyoinformatik yollarla belirlenmiştir. Ek olarak, CRISPR/Cas9 yöntemi kullanılarak, HEK293 hücrelerinde TIMELESS geni nakavt edilmiş ve BCG aşısı aracılığıyla innate ve adaptif 84 genin ekspresyon düzeyleri incelenmiştir. Edinilen bulgular sonucunda TIMELESS geninin bağışıklık sistemi fonksiyonlarıyla ilişkili olduğu tespit edilmiştir. Bu tez çalışması TIMELESS geni ve diğer sirkadiyen genlerin fonksiyonlarının daha iyi anlaşılması, sağlık ve hastalık üzerindeki sirkadiyen ritimlerin etkilerinin daha iyi araştırılması ve tedavi yaklaşımlarının geliştirilmesine yardımcı olabilir.

Özet (Çeviri)

Circadian rhythms are biological processes that occur through the regulation of gene expression over time. These processes influence many biological processes such as the sleep and wake cycle, hormonal release, metabolism and immune functions. Circadian rhythms are therefore important for the regular expression of genes and the proper regulation of the body. Since TIMELESS, a circadian gene, is also involved in various biological processes such as cell cycle and DNA damage response, it constitutes a broad research area. In this thesis, the relationship between the TIMELESS circadian gene and the immune system was investigated. For this purpose, firstly, the physicochemical properties, subcellular localization and 3D protein structure of TIMELESS were examined using in silico methods. Then, the evolutionary relationships of TIMELESS were determined by phylogenetic tree and motif analysis. Then, 52 miRNAs targeting TIMELESS were identified by in silico methods. These miRNAs were bioinformatically identified to be associated with cancer, immunity and infection. In addition, using the CRISPR/Cas9 method, the TIMELESS gene was knocked out in HEK293 cells and the expression levels of 84 innate and adaptive genes were examined by BCG vaccination. As a result of the findings, it was determined that the TIMELESS gene is associated with immune system functions. This thesis study may help to better understand the functions of the TIMELESS gene and other circadian genes, to better investigate the effects of circadian rhythms on health and disease, and to develop therapeutic approaches.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    79925

    Sirkadiyen ritmin anaerobik yüklenmelerde performansa olan etkisinin incelenmesi

    Investigation of the effect of circadian rhythm on anaerobic performance

    ALPAY GÜVENÇ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1999

    SporAkdeniz Üniversitesi

    Beden Eğitimi ve Spor Öğretimi Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ADNAN TURGUT

  2. Tez No

    686472

    Sirkadiyen ritmin sıçanlardaki mcfarlane flep yaşayabilirliği üzerine etkisi

    The effect of circadian RHYTHM on mcfarlane flap viability in rats

    KADİR ÇİÇEK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Plastik ve Rekonstrüktif CerrahiAdnan Menderes Üniversitesi

    Plastik Cerrahi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. OSMAN ENVER AYDIN

  3. Tez No

    502301

    Sirkadiyen ritmin beyin felci sonrası gelişen hasar üzerine etkisi

    Role of circadian rhythm on focal cerebral ischemia

    MUSTAFA ÇAĞLAR BEKER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    FizyolojiNecmettin Erbakan Üniversitesi

    Fizyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ZAFER ŞAHİN

  4. Tez No

    203514

    Sirkadiyen ritmin izofluran uygulanan yenidoğan ratlarda nörotoksisite üzerine etkisinin araştırılması

    Investigation of the effect of circadian rhythm on neurotoxic effect of isoflurane administration in newborn rats

    ALPER DOĞAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    Anestezi ve ReanimasyonDokuz Eylül Üniversitesi

    Anesteziyoloji ve Reanimasyon Ana Bilim Dalı

    PROF. ALİ GÜNERLİ

  5. Tez No

    666027

    Detection of the effects of circadian rhythm disruption due to chronic constant light on oocyte aging through MTOR signaling pathway

    Sirkadiyen ritmin ışık ile bozulmasının MTOR sinyal yolağı üzerinden oosit yaşlanmasına olan etkisinin belirlenmesi

    GİZEM BORA OCAK

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2020

    Histoloji ve EmbriyolojiYeditepe Üniversitesi

    Histoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AYLİN YABA UÇAR

Geri Dön