Fibrinolitik lumbrokinaz enziminin filamentli mantar Aspergillus oryzae'de üretimi ve saflaştırılması
Production and purification if fibrinolitic lumbokinase enzyme in filamentous fungus Aspergillus oryzae
- Tez No: 807152
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ SERDAR UYSAL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Mikrobiyoloji, Biotechnology, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Bezm-i Alem Vakıf Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyoteknoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 88
Özet
Bu çalışmada lumbrokinaz enziminin Aspergillus oryzae'de yüksek verimde üretilmesi ve saflaştırılması hedeflenmektedir. Bu enzim fibrinolitik etkiye sahip olduğundan dolayı birçok hastalığın tedavisinde kullanılmaktadır. Homolog üretim kaynağı lumbrokinaz için Lumbricus bimastus (283 aa)'dır. Homolog olarak üretimlerinin kısıtlı, zaman alıcı ve pahalı olması sebebiyle araştırmacılar bu enzimin heterolog çalışmalarına yönelmiştir. Fakat farklı ekspresyon sistemlerinde üretilme çalışmalarına rağmen yeterli ve istenilen verimde üretimi sağlanamamıştır. A. oryzae, amilolitik ve proteolitik enzimler gibi büyük miktarlarda hidrolitik enzim üretme yeteneğine sahiptir. Bu özellik sayesinde A. oryzae homolog ve heterolog enzim üretimi için önemli bir kaynak oluşturmaktadır. A. oryzae'nin güçlü protein salgılama, hızlı büyüme, kolay kültüre ve optimize edilebilme özelliklerinden dolayı bu çalışmada ekspresyon sistemi olarak seçilmiştir. C-terminaline 6X His-tag etiketlenmiş ve Aspergillus oryzae'ye kodon optimize şekilde tasarlanmış lumbrokinaz enzimi, pUC19 plazmid vektörüne ligasyon yapılarak sentezlettirilecektir. Gelen vektörün önce Escherichia coli TOP10 hücrelerine transformasyonu, daha sonra protoplast yöntemi ile A. oryzae'ye transformasyonu yapılacaktır. Daha sonra, CD Agar plaklarına ekimi yapılarak koloni seçilecek ve seçilen koloniler daha spesifik koloniler ve protein salınımları için DPY besiyerine ekilecektir. SDS PAGE ile kontroller sağlanacak ve bir koloni seçilerek ekspresyon başlatılacaktır. Proteinlerin saflaştırılması için IMAC (İmmobilize Metal Afinite Kromatografisi) metodu kullanılacaktır.
Özet (Çeviri)
In this study, it is aimed to produce and purify the lumbrokinase enzyme in high yield in Aspergillus oryzae. Since this enzyme has a fibrinolytic effect, it is used in the treatment of many diseases. The homologous production source for lumbrokinase is Lumbricus bimastus (283 aa). Since homologous production is limited, time-consuming and expensive, researchers have turned to heterologous studies of this enzyme. However, despite the efforts to be produced in different expression systems, sufficient and desired yield could not be produced. A. oryzae is capable of producing large amounts of hydrolytic enzymes such as amylolytic and proteolytic enzymes. Thanks to this feature, A. oryzae constitutes an important source for homologous and heterologous enzyme production. A. oryzae was chosen as the expression system in this study due to its strong protein secretion, rapid growth, easy culture and optimizability. The lumbrokinase enzyme tagged 6X His-tag to the C-terminus and codon-optimized designed to Aspergillus oryzae will be synthesized by ligation into the pUC19 plasmid vector. The incoming vector will be transformed into Escherichia coli TOP10 cells first and then into A. oryzae by protoplast method. Next, the colony will be selected by seeding on CD Agar plates and the selected colonies will be seeded on DPY medium for more specific colonies and protein releases. Controls will be provided by SDS PAGE and expression will be initiated by selecting a colony. IMAC (Immobilized Metal Affinity Chromatography) method will be used for purification of proteins.
Benzer Tezler
- Fibrinolitik sistem elemanları, ürokinaz tip plazminojen aktivatör (UPA) ve reseptörünün (UPAR) over kanserinde prognoza etkilerinin araştırılması
The Investigation of the influences of the elements of the fibrinolytic systems, urokinase-type plasminogen (UPA) and its receptor (UPAR) on the prognosis of ovarian cancer
COŞKUN TECİMER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1999
OnkolojiMarmara Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MAHMUT BAYIK
- Plazminojen Aktivatör İnhibitör-1 (PAI-1) ve Vitronektinin çocukluk çağı akut lenfoblastik lösemi risk faktörleriyle ilişkisi
Plasma levels of total Plasminogen Activator Inhibitor-1 (PAI-1) and vitronectin in children with akute lymphoblastic leukemia and their relationship with risk factors
SEMRA AYDURAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
Hematolojiİstanbul ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖMER DEVECİOĞLU
- Yeni tanı alan multipl myelom hastalarında fibrinolitik sistemin araştırılması
Investigating the fibrinolytic system in newly diagnosed multipl myeloma patients
MERYEM ZÜMBÜL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2011
HematolojiZonguldak Karaelmas Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. AYLA GÖKMEN
- Fibrinolitik tedavisi verilen ST yükselmeli myokard infarktüsü olgularında fibrinojen ve D-dimer düzeyleri ile fibrinolitik tedavi başarısızlığı arasındaki ilişki
STEMI patients who fibrinolytic treatment value of D-dimer and fibrinogen levels in the manner of determining fibrinolysis failure.
VELİ KALA
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2008
KardiyolojiDokuz Eylül ÜniversitesiKardiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖMER KOZAN
- Fibrinolitik enzim üretimi
Fibrinolytic enzyme production
BETÜL DÜZLEME
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
BiyomühendislikFırat ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUHAMMET ŞABAN TANYILDIZI