Bazı sülfa ilaçlarının moleküler doking çalışmaları ve adme özellikleri
Moleculer doking studies and adme properties of some sulfa drugs
- Tez No: 810574
- Danışmanlar: PROF. DR. SALİHA ALYAR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyokimya, Kimya, Biochemistry, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: İnorganik Kimya Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 87
Özet
Bu çalışmada, 117Z749 nolu TUBİTAK projesi kapsamında daha önce sentezlenen ve antikanser aktiviteleri incelenen; 3,5-di-t-bütil-2-hidroksibenzaldehit Sülfametoksazol (L1), 3,5-di-t-bütil-2-hidroksibenzaldehit Sülfisoksazol (L2), 2,4-dihidroksibenzaldehit Sülfisoksazol (L3), 2,4-dihidroksibenzaldehit Sülfametoksazol (L4), 2-hidroksi-5-metilbenzaldehit Sülfametoksazol (L5) ve 2-Hidroksi 5-metilbenzaldehit Sülfisoksazol (L6) bileşiklerinin yapıları DFT/B3LYP/6-31G** (d, p) metoduyla optimize edilerek en düşük enerjili yapıları elde edilmiştir. Optimize edilen bileşiklerin MDM2 proteininin (4JSC) aktif bölgesine bağlanma özelliklerini araştırmak için, Molegro Virtual Docker MVD 2019.7.0 programı ve EADock DSS algoritması kullanılarak moleküler doking çalışmaları yapılmıştır. Moleküler doking sonuçlarına göre ligantların antikanser aktivitesi sıralamasıyla bağlanma enerjileri ve MolDock skorları arasında bir paralellik olduğu gözlenmiştir. Yine optimize edilmiş geometrik parametreler kullanılarak bileşiklerin DFT yöntemiyle bileşiklerin elektrostatik potansiyel (MEP) haritaları, HOMO-LUMO moleküler orbital enerjileri ve kimyasal reaktivite tanımlayıcıları incelenmiştir. HOMO-LUMO enerji farkları ligandların proteinlerle etkileşimlerine katkı sağlayabilmesi amacıyla hesaplanmıştır. Son olarak bileşiklerin ADME (Absorpsiyon, Dağılım, Metabolizma ve Atılım) özellikleri hesaplanarak ilaç olarak kullanılma potansiyelleri değerlendirilmiştir.
Özet (Çeviri)
In this study; 3,5-di-t-butyl-2-hydroxybenzaldehyde Sulfamethoxazole (L1), 3,5-di-t-butyl-2-hydroxybenzaldehyde Sulfisoxazole (L2), 2,4-dihydroxybenzaldehyde Sulfisoxazole (L3), 2,4- The structures of dihydroxybenzaldehyde Sulfamethoxazole (L4), 2-hydroxy-5-methylbenzaldehyde Sulphamethoxazole (L5) and 2-Hydroxy 5-methylbenzaldehyde Sulfisoxazole (L6) compounds were optimized by the DFT/B3LYP/6-31G** (d, p) method, with the lowest energy structures were obtained. To investigate the binding properties of the optimized compounds to the active site of the MDM2 protein (4JSC), molecular docking studies were performed using the Molegro Virtual Docker MVD 2019.7.0 program and the EADock DSS algorithm. According to the molecular docking results, it was observed that there was a parallelism between the order of the anticancer activity of the ligands and the binding energies and MolDock scores. Electrostatic potential (MEP) maps of compounds, HOMO-LUMO molecular orbital energies and chemical reactivity descriptors were investigated by DFT method of compounds using optimized geometric parameters. The HOMO-LUMO energy differences have been calculated so that the ligands can contribute to their interaction with the proteins. Finally, the ADME (Absorption, Distribution, Metabolism and Excretion) properties of the compounds were calculated and their potential for use as drugs was evaluated.
Benzer Tezler
- The inhibition effects investigation of metal complexes of schiff bases of some sulfa drugs on alpha-glucosidase activity
Bazı sulfa ilaçlarının schıff bazlarının metal komplekslerinin alfa-glukozidaz aktivitesi üzerindeki ingiltme etkilerinin incelenmesi
DUNYA ABDULWAHHAB ABDULJABBAR ALTAIE
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
BiyokimyaÇankırı Karatekin ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ŞEVKİ ADEM
- The effects investigation of metal complexes of Schiff bases of some sulfa drugs on alpha-amylases activity
Bazı sulfa ilaçlarının Schiff bazlarının metal komplekslerinin alfa-amilaz faaliyetleri üzerine etkilerinin incelenmesi
MOHAMMED ABDULKAREEM HUSSEIN HUSSEIN
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
KimyaÇankırı Karatekin ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ŞEVKİ ADEM
- Bazı sülfa ilaçlarının sentezi, karakterizasyonu, ADME özelliklerinin incelenmesi
Synthesis, characterization, investigation of ADME propertiesof some sulfa drugs
YUSUF BARIŞ KESLER
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
KimyaÇankırı Karatekin ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SALİHA ALYAR
- Biyolojik aktiviteye sahip sülfa bileşiklerinin yapılarının DFT metoduyla aydınlatılması, ADME özelliklerinin incelenmesi
Illumination of the structure of sulfa compounds with biological activity by DFT method, investigation of ADME properties
CEMİL ORHAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
KimyaÇankırı Karatekin ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SALİHA ALYAR
- Octylphenol ethoxylate treatment with zero-valent aluminum based advanced oxidation process
Oktilfenol etoksilatın sıfır değerlikli alüminyum bazlı ileri oksidasyon prosesleri ile arıtımı
SHIVA KHOEI
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
Çevre Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiÇevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. TUĞBA ÖLMEZ HANCI