Saginae ve Bradyporinae (Orthoptera, Tettigoniidae) mitogenomu: Takım ve familya içinde karşılaştırmalı karakterizasyonu
Saginae and Bradypornae (Orthoptera, Tettigoniidae) mytogeno: Comparative characterization in team and family
- Tez No: 818344
- Danışmanlar: PROF. DR. BATTAL ÇIPLAK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Akdeniz Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 85
Özet
Mitokondri, ökaryotik hücrelerin enerji üretim merkezi olarak görev yapar ve ökaryotik organizmaların bir organel ve bir nükleer olmak üzere iki genomu bulunur. Animalia aleminde mitokondri genomu tek organel genomudur. Mitokondri genomları, özgün kalıtım özellikleri ve prokaryot tipi organizasyonlarıyla yapısal ve evrimsel olarak ilgi çekici bir araştırma konusudur. Bu tez çalışmasında, Orthoptera takımına ait mitogenomu bilinmeyen Saginae ve yetersiz olarak bilinen Bradyporinae altfamilyalarına (Ensifera, Tettigoniidae) ait birer türün mitokondriyal genomlarının üretilmesi, genomların annotasyonlarının yapılması ve özelliklerinin belirlenmesi hedeflenmiştir. Ayrıca, bu genomların diğer Tettigoniidae familyası mitogenomlarıyla filogenetik olarak değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Tez kapsamında Saginae altfamilyasına ait Saga natoliae türünün mitogenomunun toplam uzunluğu 15.806 bç olarak belirlenmiş olup, atasal pankrustase mitogenomuna göre minör gen düzenlemeleri ve trnR zincir değişiklikleri tespit edilmiştir. Aynı şekilde, Bradyoporini tribusuna ait Bradyporus latipes türünün toplam mitogenom uzunluğu 15.778 bç olarak değerlendirilmiştir. Oluşturulan Tettigoniidae mitogenom veri seti Bayes çıkarımı ve maksimum olasılık algoritmaları kullanılarak analiz edilmiş ve Tettigoniidae familyasının monofilisini desteklemiştir. BI ağacı Mecopodinae, Pseudophyllinae ve Phaneropterinae altfamilyalarını bir klad (faneropterid klad) ve Conocephalinae, Bradyporinae, Tettigoniinae, Listroscelidinae, Meconematinae ve Saginae altfamilyalarını düşük bir destek değeri ile ikinci klad (tettigoniid klad) olarak önermiştir. ML ağacı ise faneropterid kladını desteklerken, tettigoniid kladının monofilisini desteklememiştir. Tettigoniid kladı içinde Bradyporinae + Tettigoniinae monofilisi BI ve ML ağaçlarınca desteklenirken Saginae, Conocephalinae, Listroscelidinae ve Meconematinae bağımsız dallar olarak yer almaktadır.
Özet (Çeviri)
JUNE 2023; 67 pages Mitochondria serve as the energy production center of eukaryotic cells, and eukaryotic organisms have two genomes, one organelle and one nuclear. In the Animalia kingdom, the mitochondrial genome is the only organelle genome. Mitochondrial genomes are an interesting research topic, structurally and evolutionarily, with their unique inheritance characteristics and prokaryotic organization. In this thesis, it is aimed to produce mitochondrial genome of one species per Saginae and Bradyporinae, the subfamilies of Tettigoniidae (Orthoptera, Ensifera) mitogenome of which unknown, and to annotate and to determine their properties. Additionally, it is aimed to evaluate these mitogenomes phylogenetically, together with mitogenomes representing other subfamilies of Tettigoniidae. Within the scope of the thesis, the total length of the mitogenome of the Saga natoliae representing Saginae subfamily was determined as 15 806 bp and with minor gene rearrangements of tRNA compared to the ancestral pancrustacea mitogenome. Likewise, the total length of the mitogenome of Bradyporus latipes representing Bradyoporini tribe of Bradyporinae is 15 778 bp. The generated Tettigoniidae mitogenome dataset was analyzed using Bayesian inference (BI) and maximum likelihood (ML) phylogenetic algorithms. Obtained tree supported monophyly of the Tettigoniidae. The BI tree suggested two clades, the first including the subfamilies Mecopodinae, Pseudophyllinae and Phaneropterinae (phaneropterid clade) and the second the subfamilies Conocephalinae, Bradyporinae, Tettigoniinae, Listroscelidinae, Meconematinae and Saginae. The ML tree, on the other hand, supported monophyly of the phaneropterid clade, but not that of the second. Both of BI and ML trees supported Bradyporinae + Tettigoniinae, while Saginae, Conocephalinae, Listroscelidinae and Meconematinae are occured as independent branches.
Benzer Tezler
- Saga (Orthoptera, Tettigoniidae, Saginae) cinsi Ephippigera tür grubunun 16S rDNA filogenisi ve morfolojik tür hipotezlerinin moleküler verilerle sınanması
16S rDNA phylogeny and testing the morphospecies hypothesis with molecular data in the Ephippigera species group of genus Saga (Orthoptera, Tettigoniidae, Saginae)
BURCU BİNİCİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
BiyolojiHakkari ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MEHMET SAİT TAYLAN
- Süper lig kalecilerinin teknik performanslarının yansallık açısından analizi
Technical performance analysis of goalkeepers with respect to the sidedness in Turkish soccer super league
MEHMET MELİH KESİLMİŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
SporMersin ÜniversitesiBeden Eğitimi ve Spor Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET AKİF ZİYAGİL
- The connection between space and time in the human mind: The role of language
İnsan zihninde zaman ve uzamın bağlantısı: Dilin rolü
YİĞİTCAN EMİR AKBUĞA
- İstanbul Ermeni kiliseleri üzerine bir araştırma ve Narlıkapı Surp Hovhannes Ermeni Kilisesi (Eski Narlıkapı Ermeni Hastanesi)
Research on the Armenian churchs of İstanbul and Saint John Armenian Church of Narlıkapı (The Old Armenian Hospital of Narlıkapı)
TENİ BATAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2007
MimarlıkYıldız Teknik ÜniversitesiMimarlık Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEVZAT İLHAN
- Hasta kooperasyonu gerektirmeyen kemikiçi vida destekli molar distalizasyonu
Intraosseous screw supported non-compliance parallel molar distalization
RUHİ NALÇACI
Doktora
Türkçe
2008
Diş HekimliğiCumhuriyet ÜniversitesiOrtodonti Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ALİ ALTUĞ BIÇAKÇI
