Geri Dön

Investigation of the potential of post-translational modifications as biomarkers and therapeutic targets for amyotrophic lateral sclerosis disease

Amiyotrofik lateral skleroz hastalığı için translasyon sonrası modifikasyonların biyobelirteç potansiyelinin ve terapötik hedeflerinin incelenmesi

PDF İndir

  1. Tez No: 820444
  2. Yazar: MELİS KALKAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. FİKRETTİN ŞAHİN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Yeditepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 105

Özet

Amyotrofik lateral skleroz (ALS), beyin sapı, korteks ve omurilik bölgelerindeki motor nöronlara zarar vererek üst ve alt motor nöronları etkileyen ölümcül nörodejeneratif bir hastalıktır. ALS, felce yol açan atrofi sonrası ağrısız ve ilerleyici kas güçsüzlüğü ve solunum yetmezliği nedeniyle ölümle sonuçlanır. Bir dizi genetik ve moleküler patolojik çalışmada ALS hakkında artan bir bilgi birikimine rağmen, çok sayıda ALS vakasının sebebi hala bilinmemektedir. Çeşitli sistemleri etkileyen bir hastalık olarak tanımlanan ALS'nin çeşitli faktörlerden kaynaklandığına inanılmaktadır. ALS tanısı hastanın öyküsü ve klinik bulguları ile konur. Bu tanı yöntemleri uzun zaman alabilir ve oldukça maliyetli olabilir. Bu nedenle, ALS için yeni biyobelirteçlerin tanımlanması teşhis için esastır. Son zamanlarda yapılan bazı çalışmalar, biyobelirteç olarak adlandırılan bir dizi proteinin post-translasyonel modifikasyonların, nörodejeneratif hastalıkların seyrinde etkili olabileceğini göstermiştir. Bu çalışmada, B6SJL-Tg (SOD1G93A)1Gur /J) ALS transgenic fare modeli merkezi sinir sistemindeki (MSS) proteinlerin, translasyon sonrası modifikasyonlarının, ubikuitinasyon ve Sumolasyon II/III, biyobelirteç potansiyelinin araştırılması amaçlanmıştır. In vivo bulguları in vitro modelle karşılaştırmak için NSC-34 hücreleri, nöral farklılaşmadan sonra SOD1G93A mutasyonunaa uğratıldı. 2D-PAGE ile protein profilleme sonucunda, 105 günlük transgenik fare beyinlerinden ve vahşi tip fare beyinlerinden alınan proteinler arasında belirli bir fark oluşturan protein lekeleri tespit edildi ve LC-MS/MS analizlerinin sonunda, bu proteinin Rho ilişkili GTP proteini (Rhob) olduğu saptanmıştır. In vivo ve in vitro modelden elde edilen proteinlerin translasyon sonrası modifikasyonları, Simple Wes yöntemiyle analiz edilmiş ve hedef protein göre belirlenen aralıkta ubiquitination ve sumoylation II/III modifikasyonlarına sahip olmadığı bulunmuştur.

Özet (Çeviri)

Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) is a neurodegenerative and fatal disease that affects upper and lower motor neurons with damage to the motor neurons in the cortex, brainstem, and spinal cord regions. ALS results in death due to painless and progressive muscle weakness and respiratory failure after progression to paralysis from atrophy. Although there is an increased knowledge about ALS generated in a series of genetic and molecular pathological researches, the aetiology of many ALS cases is still unknown. The diagnosis of ALS is established through a comprehensive evaluation of the patient's medical history and clinical symptoms. These diagnostic methods can take a long time and be quite costly. Thus, the discovery of new biomarkers for the diagnosis of ALS is needed. Some recent studies have shown that post-translational modifications in several proteins may be indicative as biomarkers in the course of neurodegenerative diseases. This study aimed to investigate the post-translational modifications, such as ubiquitination and sumoylation II/III, of the proteins in the central nervous system (CNS) of B6SJL-Tg (SOD1G93A)1Gur /J) transgenic mouse model of ALS, as candidate biomarkers for the diagnosis of ALS. To compare the in vivo findings with the in vitro model, NSC-34 cells were mutated into SOD1G93A after neural differentiation. Proteome profiling via the 2D-PAGE method showed that there was a significant difference between proteins from 105-day-old transgenic mouse brains and wild-type mouse brains. As a result of LC-MS/MS analysis, this protein was determined to be a Rho-related GTP protein (Rhob). Post-translational modifications of proteins obtained from the in vivo and in vitro models were analyzed by the Simple Wes method and were found to have no ubiquitination and sumoylation II/III modifications within the range determined according to the target protein.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    826761

    Investigation of the role of neddylation pathway in the process of hepatocarcinogenesis

    Nedilasyon yolağının hepatokarsinogenez sürecindeki rolünün araştırılması

    IŞIL KILIÇGÜN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    BiyoistatistikDokuz Eylül Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GÖKHAN KARAKÜLAH

    PROF. DR. SAFİYE NEŞE ATABEY

  2. Tez No

    731268

    Investigation of the effects of ochratoxin-a on global protein sumoylation

    Okratoksin-a'nın global protein sumoyilasyonuna etkisinin incelenmesi

    İREM DENİZLİ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    BiyokimyaBoğaziçi Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. İBRAHİM YAMAN

    DOÇ. DR. ALİ RİZA UMUT ŞAHİN

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ZELAL ADIGÜZEL

  3. Tez No

    603039

    Investigation of the pathogenic basis of NEK1-linked amyotrophic lateral sclerosis and discovery of a potential treatment that prevents protein aggregation through targeted destruction

    NEK1 bağlantılı amyotrofik lateral sklerozun patojenik temelinin araştırılması ve hedefli yıkım yoluyla protein kümelenmesini önleyen potansiyel bir tedavinin keşfi

    HARUN ÖZTÜRK

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    Moleküler TıpBoğaziçi Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ALİ RİZA UMUT ŞAHİN

  4. Tez No

    456440

    EIF2 alfa fosforilasyonu üzerinden gerçekleşen ökaryotik translasyonel kontrol mekanizmasına yeni ilaç etken maddelerinin etkisinin proteom ebadında araştırılması

    Investigation of new pharmaceutical active molecules on eukaryotic translational control mechanisms through EIF2 alpha phosphorylation by proteomic tools

    SELEN PEKER

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    BiyoteknolojiAnkara Üniversitesi

    Temel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FATMA DUYGU ÖZEL DEMİRALP

  5. Tez No

    652866

    İlaç yeniden konumlandırma yaklaşımı ile alfa tübülin asetilasyonunu arttırabilecek bileşiklerin araştırılması

    Investigation of compounds inducing alpha tubulin acetylation by drug repurposing approach

    ÖZGE ÇETİN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Tıbbi BiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GAMZE BORA

Geri Dön