Geri Dön

Diagnosis and statistical evaluation of klebsiella pneumoniae using molecular methods from some hospitals in Dhi-Qar governorate (Iraq)

Dhi-Qar vilayetindeki (Irak) bazı hastanelerden klebsiella pneumoniae'nin moleküler yöntemlerle teşhisi ve istatistiksel değerlendirmesi

  1. Tez No: 823057
  2. Yazar: AZHAR ABDULADHEEM KAMIL KAMIL
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. TOLGA ZAMAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 95

Özet

Bu çalışmada Temmuz ve Eylül 2022 tarihleri arasında yaşları 10-60 arasında olan Dhi-Qar (Irak) hastanelerinden 386 numune toplandı. Örnekler belirlendi; 69 Klebsiella spp. Diğerleri Escheirechia coli, Staphylococus aureus, Pseudomonas spp. ve Proteus, S. epidermidis ve Enterobacter spp. Biyokimyasal testlerin tanımlanmasında API 20E ve VITEK 2 sistemi kullanıldı. Disk difüzyon yöntemi, Kleibsila pnömoni örneklerinin idrar yolu enfeksiyonuyla kullanılan 15 antibiyotiğe karşı antibiyotik duyarlılığını değerlendirdi. Sonuçlara göre, gözlenen DNA konsantrasyonları spektrumunun yanı sıra genetik materyalin bütünlüğü (1.6-2.0) 47.4 ila 123.8 ng/L arasında değişmektedir. Polimeraz zincir reaksiyonu, 16S r-RNA, rmp-A, buna bağlı serogrupların (kfu genleri) dağıtım yolu enfeksiyonunu ve Kleibsila pnömoni numunelerinin moleküler tespitini incelemek için kullanıldı.Örneklerin 29'u (%60,4) K-1 serotipindedir ve 1283 bp boyutunda bir bant verir ve 14'ü (%29,2) K-2 serotipindedir ve 543 bp boyutunda bir bant verir. Bu çalışmanın bulguları, magA ve k-2A genotipinin, Kleibsila pnömonisinin K-1 ve K-2 serogruplarını tanımlamak için iyi bir biyobelirteç olabileceğini göstermektedir, çünkü bu serogruplar, K-1/K- olmayanlara göre önemli ölçüde daha fazladır. 2 serotip (K-1/K-2 olmayan; 5 sürüntü, %10,4). Bu çalışmada 366 klinik sürüntüden oluşan bir veri seti kullanıldı. Veri seti, hastanın tanımlayıcıları, yaşı, cinsiyeti, önceden var olan tıbbi durumları, antimikrobiyal direnci, yerleşim yeri, eğitim düzeyi ve sigara içme alışkanlıkları dahil olmak üzere çeşitli parametreleri kapsıyordu. Hastaların K. pneumoniae enfeksiyonuna yatkınlığını değerlendirmek için yukarıda bahsedilen değişkenlerin her biri için toplanan veriler üzerinde istatistiksel bir inceleme yapılmıştır.İncelenen değişkenler arasında istatistiksel olarak anlamlı bir ilişkinin olup olmadığı Ki-Kare testi ile test edilmiştir. Ki-Kare testine göre sigara-antibiyotik direnci, konut-antibiyotik direnci ve eğitim-antibiyotik direnci değişkenleri arasında 0,05 anlamlılık düzeyinde istatistiksel olarak anlamlı bir ilişki bulunmuştur.

Özet (Çeviri)

In this study 386 samples were collected from hospitals in Dhi-Qar (Iraq)with ages 10-60 years old between July and September 2022. The samples were identified; 69 withKlebsiella spp. The others were Escheirechia coli, Staphylococus aureus,Pseudomonas spp. and Proteus, S. epidermidis, and Enterobacter spp. The API 20E and VITEK 2 system were used to identify the biochemical tests. The disc-diffusion method assessed the antibiotic sensitivity of Kleibsila pneumoniesamples against 15 rourenary tract infeictionnely used antibiotics. According to the results, the observed spectrum of DNA concentrations ranged from 47.4 to 123.8 ng/L, as well as the integrity of the genetic material (1.6-2.0).Polymerase chain reaction was used to study distribution pathway infection of 16S r-RNA, rmp-A, serogroups to it (kfu genes) and molecular detection of Kleibsila pneumonia samples.29 (60.4%) of the samples are of the K-1serotyp, yielding a band of 1283 bp in size, and 14 (29.2%) are of the K-2serotyp, yielding a band of 543 bp in size. The findings of this study indicate that the magA and k-2A genotype may be a good biomarker for identifying K-1 and K-2serogroups of Kleibsila pneumonie, as these serogroups were significantly extraabundant than the non-K-1/K-2serotyps (Non-K-1/K-2; 5 swabs, 10.4%). The present study employed a dataset comprising 366 clinical swabs. The dataset encompassed diverse parameters, including patient's identifiers, age, gender, pre-existing medical conditions, antimicrobial resistance, residential locality, educational attainment, and smoking patterns. A statistical examination was conducted on the collected data for each of the aforementioned variables to evaluate the predisposition of patients to K. pneumoniae infection.Whether there is a statistically significant relationship between the variables considered was tested with the Chi-Square test. According to the Chi-Square test, a statistically significant relationship was found at 0.05 significance level between smoking-antibiotics resistance, housing-antibiotics resistance, and education-antibiotics resistance variables.

Benzer Tezler

  1. İdrar yolu enfeksiyonu geçiren çocuklarda başvuru şikayetlerinin yapay zeka verisi olma yeterliliğinin değerlendirilmesi

    Evaluation of the sufficiency of presenting complaints to be artificial intelligence data in children with urinary tract infection

    ZEHRA BURCU YILMAZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NİDA DİNÇEL

  2. İdrar yolu enfeksiyonu tanısıyla yatan hastaların klinik ve laboratuvar bulgularının değerlendirilmesi, üropatojenlerin dağılımı ve antibiyotik direncinin araştırılması

    Patients diagnosed with urinary tract infections clinical and laboratory findings evaluation, distribution of uropathogens and investigation of antibiotic resistance

    ABDIAZİZ YUSUF ABDI

    Tıpta Yan Dal Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AYŞE ŞAHİN

  3. Ankara Bilkent Şehir Hastanesi evde sağlık hizmetleri birimine kayıtlı 65 yaş ve üzeri hastaların idrar yolu enfeksiyonlarının değerlendirilmesi

    Evaluation of urinary tract infections in patients aged 65 and over registered in ankara Bilkent city Hospital home care services unit

    TEBAREK BEGÜM ERCAN DÜZGÜN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Aile HekimliğiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Aile Hekimliği Ana Bilim Dalı

    UZMAN İREP KARATAŞ ERAY

  4. Çocuk yoğun bakım ünitesinde yatan hastalarda sağlık bakımı ilişkili enfeksiyonların incelenmesi: Beş yıllık sürveyans çalışması

    Evaluation of healthcare service-associated infections in patients admitted to pediatric intensive care unit: A 5-years surveillance study

    AYŞEGÜL ŞAHİN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıErciyes Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ BENHUR ŞİRVAN ÇETİN

  5. Toplum kökenli pnömoni tanısıyla yatırılmış hastaların balgam kültür sonuçlarının değerlendirilmesi ve üreyen etkenlerin yatış süresi ile ilişkisi

    Evaluation of sputum culture results of patients hospitalized with the diagnosis of community-acquired pneumonia and the relationship between the growth factors and length of hospitalization

    MUHAMMET MUSA BEKİR ALTUNDAL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Göğüs HastalıklarıDüzce Üniversitesi

    Göğüs Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. EGE GÜLEÇ BALBAY