Senesent mezenkimal kök hücre sekretomu ile kültüre edilmiş lenfositlerin meme kanseri hücre hattı üzerine etkisinin proteomik yaklaşımlarla değerlendirilmesi
Investigating the effect of lymphocytes interacted with senescent mesenchymal stem cell secretome on breast cancer cell line by proteomic approaches
- Tez No: 824071
- Danışmanlar: PROF. DR. SERVET ÖZCAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Moleküler Tıp, Molecular Medicine
- Anahtar Kelimeler: SASP, DLI, Meme Kanseri, Yaşlanmış Mezenkimal Kök Hücre Sekretom, Kütle spektrometresi, SASP, DLI, Breast Cancer, Aged Mesenchymal Stem Cell Secretome, Mass spectrometry
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Erciyes Üniversitesi
- Enstitü: Gevher Nesibe Genom ve Kök Hücre Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 98
Özet
SENESENT MEZENKİMAL KÖK HÜCRE SEKRETOMU İLE KÜLTÜRE EDİLMİŞ LENFOSİTLERİN MEME KANSERİ HÜCRE HATTI ÜZERİNE ETKİSİNİN PROTEOMİK YAKLAŞIMLARLA DEĞERLENDİRİLMESİ Melis GÜZEL Erciyes Üniversitesi, Gevher Nesibe Genom ve Kök Hücre Enstitüsü Yüksek Lisans Tezi, Temmuz 2023 Danışman: Prof. Dr. Servet ÖZCAN ÖZET Meme kanseri kadınlarda en sık görülen kanser türüdür ve yaşlanma ile kanser riski artmaktadır. Mezenkimal Kök Hücreler (MKH) yüksek rejeneratif potansiyellerini yaşlanma ile birlikte kademeli olarak kaybederler ve buna eşlik eden hücresel işlev bozukluklarında da kademeli bir artış olur. Yaşlanan MKH'lar yakın çevresindeki hücreleri ve uzakta olan hücrelerle haberleşme/etkileşme amaçlı (otokrin/parakrin mekanizmalar aracılığıyla) yaşlanmayla ilişkili salgı fenotipi (SASP) gösterirler. Bu çalışmamızda, SASP'ın bağışıklık sistemi hücrelerini manipüle ederek kanser hücrelerinin daha fazla büyümesini ve bağışıklık sisteminin eliminasyonundan kaçmalarını destekleyebileceği düşünülmüştür. SASP ile birlikte kültüre edilen (koşullandırılan) Donör Lenfosit İnfizyon (DLI) hücre uygulaması sonrası, meme kanseri hücre hattında (MBA-MB-231) kanser hücrelerinde meydana gelen değişiklikler proteomik yaklaşımla incelenmiştir. İlk olarak, kanser hücre hatları yaşlanmış mezenkimal kök hücre sekretomuyla (MDA-OLD) kültüre edildi. Diğer bir deney setinde kanser hücreleri DLI ile birlikte kültüre edildi (MDA-DLI). Son olarak, kanser hücreleri DLI + Senesent MKH sekretomu (OLD) ile kültüre edildi (MDA-DLI-OLD). Birlikte kültür sonrası, tüm grupların sekretomları toplandı ve kütle spektrometresi (LC-MS/MS) ile proteomik analizleri gerçekleştirildi. MDA-DLI-OLD grubunun gen ontoloji analizinde; immun sistemin negatif regülasyonu, anjiyogenez, MAPK kaskadının pozitif düzenlenmesi, laktat biyosentetik süreci, apoptozun negatif düzenlemesi gibi kanser gelişiminde önemli rol oynayan biyolojik süreçleri gözlemledik. Tüm gruplarda MDA-DLI-OLD grubuna özgün 63 protein tanımladık. Tanımlanan 63 proteinin gen ontoloji bulguları immun sistemin negatif düzenlenmesi ile ilişkiliydi. Tez kapsamında yapılan kantitatif analizler sonucunda, SASP'ın etkisiyle kanser kötü prognozu ile örtüşen proteinlerin (SERPINH1, HSPA5, YWHAZ, LOX) yüksek ifadesini gözlemledik. Sonuç olarak, SASP'ın immün sistemi baskılayarak kanser ilerlemesiyle doğrudan ilintili olduğunu gözlemledik. Meme kanseri tanısında HSPA5 ve YWHAZ proteinlerinin biyo-belirteç olma potansiyelinin değerlendirilmesi için detaylı çalışmaların yapılması gerektiğini önermekteyiz.
Özet (Çeviri)
INVESTIGATING THE EFFECT OF LYMPHOCYTES INTERACTED WITH SENESCENT MESENCHYMAL STEM CELL SECRETOME ON BREAST CANCER CELL LINE BY PROTEOMIC APPROACHES Melis GÜZEL Erciyes University, Gevher Nesibe Genome and Stem Cell Institute Master Thesis, July 2023 Advisor: Dr. Servet ÖZCAN ABSTRACT Breast cancer is the most prevalent cancer in women, and cancer risk rises with age. Mesenchymal Stem Cells (MSCs) gradually lose their regenerative potential and experience increasing cellular dysfunctions as they age. Aging MSCs exhibit an aging-associated secretory phenotype (SASP) for communication/interaction through autocrine/paracrine mechanisms with neighboring and distant cells. In this study, it was hypothesized that SASP could facilitate cancer cell growth by influencing immune system cells and aiding their evasion from immune clearance. Changes in cancer cells from the breast cancer cell line (MBA-MB-231) were investigated after co-culturing with SASP-primed Donor Lymphocyte Infusion (DLI) cells using a proteomic approach. Firstly, cancer cell lines were cultured with senescent mesenchymal stem cell secretome (MDA-OLD). In another set of experiments, cancer cells were co-cultured with DLI (MDA-DLI). Finally, cancer cells were cultured with DLI + Senesent MSC secretome (OLD) (MDA-DLI-OLD). Following co-culture, secretomes were collected and proteomic analyses were conducted via mass spectrometry (LC-MS/MS). Gene ontology analysis of the MDA-DLI-OLD group revealed vital roles in cancer development, including immune system regulation, angiogenesis, positive regulation of the MAPK cascade, lactate biosynthesis, and negative regulation of apoptosis. We identified 63 proteins specific to the MDA-DLI-OLD group. The gene ontology findings of these 63 proteins were linked to negative immune system regulation. Quantitative analyses in the thesis indicated the elevated expression of proteins (SERPINH1, HSPA5, YWHAZ, LOX) that overlap with the detrimental cancer prognosis due to SASP effect. In conclusion, we observed SASP's direct association with cancer progression by immune system suppression. We propose in-depth studies to evaluate HSPA5 and YWHAZ proteins' potential as breast cancer diagnosis biomarkers.
Benzer Tezler
- Genç ve senesent mezenkimal kök hücre sekretomlarının kanser hücre hatlarına etkilerinin incelenmesi
Investigation of young and senescent mesenchymal stem cell secretome effects on cancer cell lines
MUSTAFA BURAK ACAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
BiyolojiErciyes ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SERVET ÖZCAN
PROF. DR. UMBERTO GALDERISI
- Senesent mezenkimal kök hücre sekretomunun (SAPS) meme kanseri hücre hattı emt mekanizması üzerine etkisinin değerlendirilmesi
Investigation of the effects of senesent mesenchymal stem cell secretome (SAPS) on breast cancer cell line emt mechanism
SELİN KÜBRA YILDIR
- Rock inhibitörü'nün mezenkimal kök hücre senesensi üzerine etkisinin incelenmesi
Investigation of the effect of rock inhibitor on meseenchymal stem cell senescence
MUSTAFA BURAK ACAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
GenetikErciyes ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SERVET ÖZCAN
- TGF-B1 gen terapisi yapılmış insan adipoz kaynaklı mezenkimal kök hücrelerden elde edilen koşullu besiyerinin meme kanser hücrelerinde cd44 inhibitör ve tümör baskılayıcı etkisinin araştırılması: In vitro çalışma
Investigation of CD44 inhibitory and tumor suppressive effect in breast cancer cells of conditioned medium obtained from TGF-B1 transfected human adipose-derived mesenchymal stem cells: In vitro study
HASAN SALKIN
Doktora
Türkçe
2020
Histoloji ve EmbriyolojiErciyes ÜniversitesiHistoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BİRKAN YAKAN
PROF. DR. SAİM ÖZDAMAR
- Metformin uygulamasının replikatif senesent insan mezenkimal kök hücrelere etkisinin gen ifadesi düzeyinde incelenmesi
Investigation of effect of metformin treatment on replicative senesent human mesenchymal stem cells at genetic expression level.
EDA MERT GÖKDUMAN