Geri Dön

Molecular study of biofilm formation related to antibiotic resistance of uropathogenic escherichia coli isolated from Urinary Tract Infection (UTI)

İdrar yolu enfeksiyonundan (İYE) izole edilen üropatojenik Escherichia coli'nin antibiyotik direnci ile ilgili biyofilm oluşumunun moleküler çalışması

PDF İndir

  1. Tez No: 825046
  2. Yazar: HIND ISSA IBRAHIM IBRAHIM
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ SERDAL TARHANE
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Biyoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 94

Özet

Bu çalışmada, 10/06/2022-10/09/2022 tarihleri arasında Babil Valiliğindeki hastanelerin (İmam Al-Sadiq Eğitim Hastanesi ve Mirjan Eğitim Hastanesi) idrar yolu enfeksiyonu şikâyeti olan hastalarından 121 klinik numune toplanmıştır. Bakteriyel izolatlar geleneksel yöntemlerle ve Vitek-2 Compact sistemiyle teşhis edilmiş, daha sonra polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) aracılığıyla 16SrRNA geni kullanılarak moleküler bir yöntemle teşhisleri doğrulanmış ve E. coli'ye ait 34 klinik izolat elde edilmiştir. Disk difüzyon yöntemiyle yapılan antibiyotik duyarlılık testinin sonuçları Üropatojenik E. coli'nin çoklu ilaca dirençli (ÇİD) olduğunu göstermiştir. İzolatların 34'ü (%100) Sefepim, Sefaleksin ve Nitrofurantoin antibiyotiklerine, 31'i (%91,17) Doksisiklin, Nalidiksik asit ve Tetrasikline, 29'u (%85,29) Amikasine, 26'sı (%76,47) Gentamisine, 20'si (%58,82) Sefiksime, 17'si (%50) Norfloksasine ve 6'sı (%17,64) İmipeneme direnç göstermiştir. Sonuçlar, 34 (%100) bakteri izolatının farklı derecelerde biyofilm oluşturduğunu göstermiş, 3 (%8,82) bakteri izolatının güçlü, 31 (%91,17) bakteri izolatının ise orta düzeyde biyofilm ürettiği gözlemlenmiştir. Ayrıca fimH, luxs, mqsR ve papAH genlerinin moleküler tespiti PCR teknolojisi kullanılarak gerçekleştirilmiş, sonuçlar sırasıyla %67,64, %100, %100 ve %0 olarak tespit edilmiştir.

Özet (Çeviri)

In this study, 121 clinical samples were collected from patients suffering from urinary tract infections from hospitals in Babil Governorate, including (Imam Al-Sadiq Teaching Hospital and Mirjan Teaching Hospital) for the period from 10/06/2022 to 10/09/2022. Bacterial isolates were identified by conventional methods and Vitek-2 Compact system, then their diagnosis was confirmed by a molecular method using 16SrRNA gene via polymerase chain reaction (PCR), and 34 clinical isolates of E. coli were obtained. The results of antibiotic susceptibility testing by disk diffusion method showed that uropathogenic E. coli was multidrug resistant (MDR). Among the isolates, 34 (100%) were resistant to Cefepime, Cephalexin and Nitrofurantoin, 31 (91.17%) to Doxycycline, Nalidixic acid and Tetracycline, 29 (85.29%) to Amikacin, 26 (76.47%) to Gentamicin, 20 (58.82%) to Cefixime, 17 (50%) to Norfloxacin and 6 (17.64%) to Imipenem. The results showed that 34 (100%) bacterial isolates formed different degrees of biofilm, 3 (8.82%) bacterial isolates produced strong biofilm and 31 (91.17%) bacterial isolates produced moderate biofilm. In addition, molecular detection of fimH, luxs, mqsR and papAH genes was performed using PCR technology and the results were 67.64%, 100%, 100% and 0%, respectively.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    544302

    Klinik stenotrophomonas maltophilia kökenlerinin antibiyotik duyarlılıkları, genotipik profilleri ve biyofilm oluşturma yetenekleri

    Antibiotic susceptibilities, genotype profiles and biofilm forming abilities of clinical stenotrophomonas maltophilia strains

    SERHAT YALÇINKAYA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Eczacılık ve FarmakolojiEge Üniversitesi

    Farmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FETHİYE FERDA YILMAZ

  2. Tez No

    604163

    Deniz suyundan izole edilen enterokok suşlarının virulans faktörlerinin incelenmesi

    Investigation of virulence factors of enterococci strains isolated from sewater

    İPEK ADA

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Biyolojiİstanbul Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYTEN KİMİRAN

  3. Tez No

    688560

    İdrar yolu enfeksiyonu olan hastalardan izole edilen klebsiella pneumoniae ve escherichia coli bakterilerinin antibiyotik direncinin moleküler açıdan değerlendirilmesi

    The molecular study for evaluation of antibiotic resistance of klebsiella pneumoniae and escherichia coli bacteria isolated from patients with urinary tract infection

    WASAN JASIM MOHAMMED AL-MAHFOODH

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ FİLİZ SARIKAYA PEKACAR

  4. Tez No

    529243

    Burkholderia türlerinin moleküler yöntemlerle tiplendirilmesi, türler arasında biyofilm oluşumu ve antibiyotik direnç farklılığının belirlenmesi

    Multilocus sequence analysis, biofilm production, antibiotic susceptibility and synergy tests of burkholderia species in patients with and without cystic fibrosis

    HAVVA ÖZLEM ALTAY AKIŞOĞLU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    MikrobiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞE GÜLŞEN HASÇELİK

  5. Tez No

    899293

    Kentsel su döngüsünde mikrobiyal kontaminantların sürveyanı: Fırsatçı patojenlerin moleküler karakterizasyonu ve antimikrobiyal direnç profilinin araştırılması

    Microbial contaminants surveillence in the urban water cycle: Molecular characterization of oppurtunistic pathogens and antimicrobial resistance profile

    BİNNUR KIRATLI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    BiyolojiSakarya Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HÜSEYİN AKSOY

Geri Dön