Geri Dön

Identification and characterization of two intronic transcripts in MCF7 cells

MCF7 hücrelerinde iki adet intronik transkriptin tanımlanması ve karakterize edilmesi

PDF İndir

  1. Tez No: 825229
  2. Yazar: İREM CEMİLE EROĞLU
  3. Danışmanlar: PROF. DR. AYŞE ELİF ERSON BENSAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Biyoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 105

Özet

Alternatif poliadenilasyon (APA), mRNA işleme sırasında 3'UTR poliadenilasyon sinyallerinin uzunluğunun değiştirilmesidir. Bu işlem sonucunda elde edilen farklı mRNA izoformlarının 3'UTR uzunlukları, belirli bir mRNA'dan çevrilen protein miktarı gibi farklı mRNA özelliklerini etkiler. APA ayrıca 3'UTR yerine intronic bölgelerde de gerçekleşebilir ve bu sürece intronik poliadenilasyon (IPA) denir. IPA, genlerden ifade edilen proteinlerin düzeylerinde ve yapılarında değişikliklere neden olur. Bu tezde, MCF7 meme kanseri hücrelerinde RNA 3'-uç dizileme yöntemi kullanılarak tanımlanmış iki bağımsız IPA olayını incelendi ve karakterize edildi. Bu yöntem, farklı izoformların 3'-uçları hakkında bilgi sağlamış ve geleneksel deneysel yaklaşımlarla birlikte kullanılmıştır. Tümör Protein D52 Benzeri 1 (TPD52L1) ve Tümör Protein 53 (TP53) intronic transkriptleri incelenmiş, ekspresyonları onaylanmış, klonlanmış ve 3' uçları doğrulanmıştır. Ayrıca, bu transkriptlere yönelik önemli işlevsel kanıtlar sunulmuştur. Bu sonuçlar, kanser transkriptomlarındaki kompleks izoformların yeterince tespit edilemediğini göstererek bu transkriptlerin rollerinin daha iyi anlaşılması için daha fazla çalışmanın yolunu açmaktadır.

Özet (Çeviri)

Alternative polyadenylation (APA) is the alteration of the length of the 3'UTR polyadenylation signals during mRNA processing. This resulting change in 3'UTR lengths of mRNA isoforms affects different mRNA properties like its stability, localization, and the protein quantity translated from a specific mRNA. APA can also occur in intronic sites rather than 3'UTR, and this process is called the intronic polyadenylation (IPA). IPA causes changes in the levels and structures of the proteins translated from the genes. In this thesis, I identified and characterized two independent IPA events in MCF7 breast cancer cells using RNA 3'-end sequencing which provides information on different 3'-ends of isoforms and conventional experimental approaches. I studied the intronic transcripts of Tumor Protein D52 like 1 (TPD52L1) and Tumor Protein 53 (TP53), confirmed their expression, cloned and verified their 3' ends. I also provide preliminary functional evidence on the transcripts. These results are an indication of the underdetection of the complex isoforms of cancer transcriptomes and pave the way of further work to better understand the roles of these transcripts.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    335861

    Identification and characterization of meiothermus ruber thiolase and clostridium acetobutylicum thiolase

    Clostridium acetobutylicum tiyolaz ve meiothermus ruber tiyolaz enzimlerinin tanımlanması ve karakterizasyonu

    MELTEM KUTLU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    Biyokimyaİstanbul Teknik Üniversitesi

    Kimya Bölümü

    PROF. DR. OYA ATICI

    PROF. DR. THOMAS BRÜCK

  2. Tez No

    486561

    Spontane fermente et ürünleri: Laktik asit bakterilerinin muhtemel starter kültür olarak izolasyonu ve karakterizasyonu

    Spontaneously fermented meats: Isolation and characterization of lactic acid bacteria as possible starter cultures

    MERVE ECE ARABACI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Gıda Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZEYNEP DİLEK HEPERKAN

  3. Tez No

    672692

    Farklı başkalaşım yaşam döngüsüne sahip böceklerin mitogenomunda mikrorna' ların transkripsiyondaki olası rolünün araştırılması

    Investigation of the possible role of micrornas in mitochondrial transcription of insects with different life cycles

    HABEŞ BİLAL AYDEMİR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    BiyolojiSivas Cumhuriyet Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ERTAN MAHİR KORKMAZ

  4. Tez No

    238144

    Yüzeyde zenginleştirilmiş raman saçılmasına dayalı mikroorganizma tanısı için yeni nanoyapılı yüzeylerin geliştirilmesi

    Development of novel nanostructured surface enhanced raman scattering substrates for whole microorganism identification

    MÜNEVVER MÜGE YAZICI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    BiyoteknolojiYıldız Teknik Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MUSTAFA ÇULHA

    PROF. DR. ADİL ALLAHVERDİYEV

  5. Tez No

    517917

    Çukurova bölgesinde domates sarı yaprak kıvırcıklık virüsü (Tomato yellow leaf curl virus, TYLCV)nün ırklarının araştırılması

    Investigation of strains of Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV) in Cukurova region

    ERAY ATALAY

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    ZiraatÇukurova Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ MUHARREM ARAP KAMBEROĞLU

Geri Dön