Kolon kanseri farklılaşmasında kanser kök hücrelerinin araştırılması
Investigation of cancer stem cells in colon cancer differentiation
- Tez No: 828401
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ ASLI SADE MEMİŞOĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 68
Özet
Kolorektal kanser, dünyadaki en yaygın malign tümörlerden biri olup genellikle tedavi edilebilen bir kanser türüdür ancak kanser metastazları hastalığın ilerlemesini olumsuz etkiler. Karsinomada, farklılaşma-geri farklılaşma plastisitesi ile fenotipik plastisitenin sağlandığı ve bu özelliğe sahip hücrelerde kanser kök hücreleri (CSC) ve kanser kök hücresi olmayan durumlar arasında ileri geri geçiş yapıldığı gösterilmektedir. Daha az farklılaşmış olan kanser kök hücreleri, tümör popülasyonu içindeki orta ve iyi düzeyde farklılaşmış olan hücrelerden geri çevrilebilen bir farklılaşma ile oluşmaktadırlar. Bu süreci aydınlatmak metastazın ve ilaç direncinin aydınlatılması için önemli bir adımdır. Çalışmanın amacı, hücresel açıdan heterojen olan bir hücre hattında farklılaşmış ya da farklılaşmamış hücre popülasyonlarındaki dönüşüm mekanizması ile kanser kök hücreleri arasındaki ilişkiyi belirlemektir. Bu amaçla, kültür koşullarında farklılaşma-geri farklılaşma yapabilen bir hücre hattı modeli kullanılmış ve farklılaşma süreci adımlarından elde edilen kanser kök hücre popülasyonlarının miktarı, hücre çoğalması, ilaç direnci, in vitro metastaz kapasitesi ve tümör oluşturma kapasitesi karşılaştırılmıştır. Sonuçlara göre, kullanılan hücre modelinde iki farklı kök hücre alt popülasyonu bulunmakta çeşitli karakteristik özellikler açısından farklılık göstermektedirler. CD44+ kök hücre popülasyonları içinde CD133+ olan alt popülasyon daha fazla hücre çoğalması ve metastaz özelliği gösterirken, CD133- olan popülasyon daha yüksek ilaç direnci ve tümör oluşturma kapasitesi sergilemiştir. Genel olarak, burada sunulan veriler, aynı hücre hattından köken alsa dahi, CD44 ve CD133 için geniş bir ifade aralığına sahip olduğunu göstermiştir. Dolayısı ile CSC'lerin tüm kolon kanseri hücreleri için tek belirteç veya aynı işaret seti ile karakterize edilmesi olası değildir.
Özet (Çeviri)
Colorectal cancer, one of the most common malignant tumors worldwide, is generally curable, but metastasis of cancer negatively affects the course of the disease. Plasticity of differentiation and reverse differentiation as well as phenotypic plasticity has been shown to be achieved in carcinomas, and cells with this property switch between cancer stem cells (CSC) and non-CSC. Less differentiated CSCs arise by reversible differentiation from moderately to well differentiated cells of the tumor population. Clarification of this process is an important step in elucidating metastasis. The aim of this study is to determine the relationship between CSCs and the mechanism of transformation in differentiated or undifferentiated cancer populations in a heterogeneous tumor. For this purpose, a cell line model capable of differentiation- redifferentiation under culture conditions was used, and the quantity, cell proliferation, drug resistance, and tumorigenicity of the CSC populations obtained from the differentiation process steps were compared. According to the results, there are two different subpopulations of stem cells in the cell model used and they differ in various characteristics. Among CD44+ stem cell populations, the CD133+ subpopulation showed greater cell proliferation and metastasis, while the CD133- population showed higher drug resistance and tumorigenicity. Overall, the data presented here showed that it has a wide expression range for CD44 and CD133, even if they originate from the same cell line. Thus, it is unlikely that CSCs can be characterized by a single marker or the same set of markers for all colon cancer cells.
Benzer Tezler
- Investigation of NFİB function and regulation of its putative target genes in human neural stem cell and SH-SY5Y neuroblastoma cell lines
İnsan sinir kök hücre ve SH-SY5Y nöroblastom hücre hatlarında NFIB işlevinin ve potansiyel hedef genlerinin regülasyonunun incelenmesi
BETÜL ULUCA
Doktora
İngilizce
2023
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ASLI KUMBASAR
- Spektroskopik yöntemlerle bazı karayosunu etanol ekstraktlarının HCT116 kolorektal kanser hücre canlılığı üzerindeki etkisinin ve moleküler düzey değişikliklerinin incelenmesi
Investigation of the effect of some bryophyte ethanol extracts on HCT116 colorectal cancer cell viability and molecular level changes by spectroscopic methods
HİLAL ZENGİN KÖKSAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
BiyolojiKastamonu ÜniversitesiGenetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ DİLŞAD ÖZERKAN
- Determining novel target genes in WNT/𝛽-catenin signaling pathway using machine learning
WNT/beta-catenin sinyal yolağında makine öğrenmesi ile hedef genler belirlenmesi
CEMRE KEFELİ
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Genetikİstanbul ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ANDRES OCTAVIO ARAVENA DUARTE
- The productıon and pegylatıon of recombinant human granulocyte colony-stımulatıng factor produced ın e. coli
Rekombinant insan granulosit koloni stimülan faktörünün e. coli'de üretimi ve pegilasyonu
NAZLI DİLARA ERDOĞDU
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
Biyokimyaİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY
- Suppression of NFIb expression by gene targeting strategies
NFIb ifadesinin gen hedefleme stratejileriyle baskılanması
İBRAHİM OGUZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
Genetikİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ASLI KUMBASAR