Enfeksiyon hastlarından izole edilen Salmonella spp.nın virlaülans faktörü antibiyotik direnci ve biyoflim çalışması Irak Bağdat Eğitim Hastanesi
Study of virulence factor antibiotic resistance and biofilm of salmonella spp. isolated from infection patients Iraq Baghdad Education Hospital
- Tez No: 828484
- Danışmanlar: PROF. DR. ORAL DÜZDEMİR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Salmonella, Virulence factor, Antibiotic resistance, PCR
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 101
Özet
Enterobacteriaceae familyasının bir cinsi olan Salmonella, dünya çapında binlerce ölüme yol açan gıda kaynaklı enfeksiyonların önemli bir kaynağıdır. S enterica ser'in ana nedeni. Typhi enfeksiyonu, tüketildikten sonra kontamine olmuş yiyecek veya içeceklerdir. S. enterica serovar bağırsaktan dalak, safra kesesi, karaciğer ve pankreas gibi diğer organlara yayılarak sistemik bir enfeksiyon haline gelebilir. Çalışma Salmonella spp.'yi tanımlamayı ve karakterize etmeyi amaçladı. Iraklı hastalarda gen belirteçlerini kullanarak virülansı değerlendirin ve disk difüzyon ve antibiyotik direnç genlerini kullanarak antimikrobiyal direnç profillerini belgeleyin. Medical City/Bağdat Eğitim Hastanesi'nden yüz kan örneği, Aerobic BacT/ALERT® Kültür Ortamı kullanılarak ilk teşhis için derhal merkez laboratuvara gönderildi. Her Salmonella typhi izolatı için antibiyotik duyarlılığını belirlemek, test etmek ve biyofilm büyümesini analiz etmek için VITEK-2 Sistemini kullandık. Tüm numunelerden genomik DNA, genleri değerlendirmek için geleneksel PCR kullanılarak ifade edildi. Bu çalışmada kan kültürü pozitifliğine güvenilerek; Salmonella typhi'nin yaygınlık oranı 100 örnekten 30'unda (%30); bunların 17'si (%56,7) kadın, 13'ü (%43,3) erkekti. Ayrıca Salmonella typhi izolatlarının 30'unun (%100) biyofilm ürettiği; oldukça ılımlı biyofilm üreticisi S. typhi (20/30) %66,7 oranında tespit edilirken, zayıf biyofilm üreticisi (10/30) %33,3 oranında tespit edildi. Salmonella typhi, Ciprofloxacin'e karşı yüksek düzeyde (%93) duyarlılık gösterdi, ardından izole edilenler (%90) Amikacin ve Gentamicin'e duyarlıyken, Piperasilin ve Sefoksitin için sırasıyla (%70) ve (%76,3) duyarlıydı. İmipeneme duyarlılık (%63,3), Trimetoprim (%76,7) olarak belirlendi. İmipeneme duyarlılık %63,3 ve Trimetoprim'e %76,7 olarak belirlendi. Çalışmada virülans genleri (PrgH ve SiiD) ile biyofilm oluşumu arasında anlamlı bir korelasyon bulunamadı. Salmonella typhi'de biyofilm oluşumu ile antibiyotik direnci arasındaki ilişki. PrgH ve SiiD genlerinin dizilimi, bunların çeşitli doğasını ortaya koymaktadır. 2023, 88 sayfa ANAHTAR KELİMELER: Salmonella, Virülans faktör, Antibiyotik direnci, PCR
Özet (Çeviri)
Salmonella, a genus of the Enterobacteriaceae family, is a significant source of foodborne infections that have led to thousands of fatalities globally. The major cause of S enterica ser. Typhi infection is contaminated food or drink after consumption. S. enterica serovar may spread from the gut to other organs such as the spleen, gallbladder, liver, and pancreas, making it a systemic infection. The study aimed to identify and characterize Salmonella spp. in Iraqi patients, assess virulence using gene markers, and document antimicrobial resistance profiles using disk diffusion and antibiotic resistance genes. One hundred blood samples from Medical City/Baghdad Teaching Hospital were promptly sent to the central laboratory for initial diagnosis using Aerobic BacT/ALERT® Culture Media. We employed VITEK-2 System to identify, test antibiotic susceptibility, and analyze biofilm growth for each Salmonella typhi isolate. Genomic DNA from all samples was expressed using conventional PCR to evaluate genes. By relying on the blood culture positivity in the current study; the prevalence rate of Salmonella typhi was 30 (30%) out of 100 samples ; of them 17 (56.7%) were female while the 13 (43.3%) male. Furthermore, there were 30 (100%) of Salmonella typhi isolates were biofilm producers; considerably moderate biofilm producers S. typhi was detected (20/30) 66.7% while weakly biofilm producer was (10/30) 33.3% a part from that. Salmonella typhi demonstrated high sensitivity level (93%) to Ciprofloxacin followed by (90%) of isolated were sensitive to each of Amikacin and Gentamicin while for Piperacillin and Cefoxitin were (70%) and (76.3%) respectively. The sensitivity to Imipenem was (63.3%), Trimethoprim (76.7%). The sensitivity to Imipenem was 63.3% and Trimethoprim was 76.7%.The study found no significant correlation between virulence genes (PrgH and SiiD) and biofilm formation, nor between biofilm formation and antibiotic resistance in Salmonella typhi.The sequencing of PrgH and SiiD genes reveals their varied nature. 2023, 88 pages
Benzer Tezler
- Isolation of bacterial pathogens from patients with urinary tract infection in Erbil city and determination of their antibiotic susceptibility patterns
Erbil şehri idrar yolu enfeksiyonu hastalarından bakteriyal patojenlerin izolasyonu ve antibiyotik dirençlerinin belirlenmesi
MAY ALI SALEH AL-HAMADANI
Yüksek Lisans
İngilizce
2017
MikrobiyolojiKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiBiyomühendislik ve Bilimleri Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. SABAHATTİN CÖMERTPAY
- Detection of Klebsiella pneumoniae virulence genes isolated from urinary tract infection patients in Tikrit city, Iraq
Irak, Tikrit şehrindeki idrar yolu enfeksiyon hastalarından izole edilen Kklebsiella pneumoniae virülans genlerinin tespiti
MOHAMMED MUNEF SAAB SAAB
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ YAŞAR KEMAL YAZGAN
DR. ÖĞR. ÜYESİ ANAS YASEEN MAHMOOD AL-HAYAWI
- Enfeksiyon etkeni olarak izole edilen Candida albicans suşları ile kolonize suşlar arasındaki genotipik farklılıkların pulsed field gel electrophoresis ve arbitrarily primed PCR yöntemi ile araştırılması
The investigation of genotyping differences between infecting and colonizing Candida albicans strains by pulsed field gel electrophoresis and arbitrarily primed PCR methods
BARIŞ OTLU
Doktora
Türkçe
2004
MikrobiyolojiGazi ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. SEMRA KUŞTİMUR
- Solunum yollarından izole edilen pseudomonas, aspergillus ve candida suşlarının virülans faktörlerinin araştırılması
İnvestigation of the virulence factors of pseudomonas, aspergillus and candida strains i̇solated from respiratory tract
BEDRİYE NAZLI GENÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıMarmara ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞEGÜL KARAHASAN
- Yoğun bakım hastalarından izole edilen çoklu ilaca dirençli pseudomonas aeruginosa izolatlarında amikasin, tigesiklin ve meropenemin seftolozan/tazobaktam ile kombinasyonlarının in vitro etkinliğinin araştırılması
Investigation of in vitro efficacy of combinations of amikacin, tigecycline and meropenem with ceftolozane/tazobactam in multidrug-resistant pseudomonas aeruginosa strains isolated from intensive care patients
ESRA YARTAŞI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
MikrobiyolojiSağlık Bilimleri ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BEDİA DİNÇ