Geri Dön

Enfeksiyon hastlarından izole edilen Salmonella spp.nın virlaülans faktörü antibiyotik direnci ve biyoflim çalışması Irak Bağdat Eğitim Hastanesi

Study of virulence factor antibiotic resistance and biofilm of salmonella spp. isolated from infection patients Iraq Baghdad Education Hospital

PDF İndir

  1. Tez No: 828484
  2. Yazar: ZAID ALI HUSSEIN AL-JANABI
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ORAL DÜZDEMİR
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Salmonella, Virulence factor, Antibiotic resistance, PCR
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Biyoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 101

Özet

Enterobacteriaceae familyasının bir cinsi olan Salmonella, dünya çapında binlerce ölüme yol açan gıda kaynaklı enfeksiyonların önemli bir kaynağıdır. S enterica ser'in ana nedeni. Typhi enfeksiyonu, tüketildikten sonra kontamine olmuş yiyecek veya içeceklerdir. S. enterica serovar bağırsaktan dalak, safra kesesi, karaciğer ve pankreas gibi diğer organlara yayılarak sistemik bir enfeksiyon haline gelebilir. Çalışma Salmonella spp.'yi tanımlamayı ve karakterize etmeyi amaçladı. Iraklı hastalarda gen belirteçlerini kullanarak virülansı değerlendirin ve disk difüzyon ve antibiyotik direnç genlerini kullanarak antimikrobiyal direnç profillerini belgeleyin. Medical City/Bağdat Eğitim Hastanesi'nden yüz kan örneği, Aerobic BacT/ALERT® Kültür Ortamı kullanılarak ilk teşhis için derhal merkez laboratuvara gönderildi. Her Salmonella typhi izolatı için antibiyotik duyarlılığını belirlemek, test etmek ve biyofilm büyümesini analiz etmek için VITEK-2 Sistemini kullandık. Tüm numunelerden genomik DNA, genleri değerlendirmek için geleneksel PCR kullanılarak ifade edildi. Bu çalışmada kan kültürü pozitifliğine güvenilerek; Salmonella typhi'nin yaygınlık oranı 100 örnekten 30'unda (%30); bunların 17'si (%56,7) kadın, 13'ü (%43,3) erkekti. Ayrıca Salmonella ‎typhi izolatlarının 30'unun (%100) biyofilm ürettiği; oldukça ılımlı biyofilm üreticisi S. typhi (20/30) %66,7 oranında tespit edilirken, zayıf biyofilm üreticisi (10/30) %33,3 oranında tespit edildi. Salmonella typhi, Ciprofloxacin'e karşı yüksek düzeyde (%93) duyarlılık gösterdi, ardından izole edilenler (%90) Amikacin ve Gentamicin'e duyarlıyken, Piperasilin ve Sefoksitin için sırasıyla (%70) ve (%76,3) duyarlıydı. İmipeneme duyarlılık (%63,3), Trimetoprim (%76,7) olarak belirlendi. İmipeneme duyarlılık %63,3 ve Trimetoprim'e %76,7 olarak belirlendi. Çalışmada virülans genleri (PrgH ve SiiD) ile biyofilm oluşumu arasında anlamlı bir korelasyon bulunamadı. Salmonella typhi'de biyofilm oluşumu ile antibiyotik direnci arasındaki ilişki. PrgH ve SiiD genlerinin dizilimi, bunların çeşitli doğasını ortaya koymaktadır. 2023, 88 sayfa ANAHTAR KELİMELER: Salmonella, Virülans faktör, Antibiyotik direnci, PCR

Özet (Çeviri)

Salmonella, a genus of the Enterobacteriaceae family, is a significant source of foodborne infections that have led to thousands of fatalities globally. The major cause of S enterica ser. Typhi infection is contaminated food or drink after consumption. S. enterica serovar may spread from the gut to other organs such as the spleen, gallbladder, liver, and pancreas, making it a systemic infection. ‎The study aimed to identify and characterize Salmonella spp. in Iraqi patients, assess virulence using gene markers, and document antimicrobial resistance profiles using disk diffusion and antibiotic resistance genes. One hundred blood samples from Medical City/Baghdad Teaching Hospital were promptly sent to the central laboratory for initial diagnosis using Aerobic BacT/ALERT® Culture Media. We employed VITEK-2 System to identify, test antibiotic susceptibility, and analyze biofilm growth for each Salmonella typhi isolate. Genomic DNA from all samples was expressed using conventional PCR to evaluate genes. By relying on the blood culture positivity in the current study; the prevalence ‎rate of Salmonella typhi was 30 (30%) out of 100 samples ; of them 17 (56.7%) were ‎female while the 13 (43.3%) male. Furthermore, there were 30 (100%) of Salmonella ‎typhi isolates were biofilm producers; considerably moderate biofilm producers S. typhi ‎was detected (20/30) 66.7% while weakly biofilm producer was (10/30) 33.3% a part ‎from that. Salmonella typhi demonstrated high sensitivity level (93%) to Ciprofloxacin ‎followed by (90%) of isolated were sensitive to each of Amikacin and Gentamicin ‎while for Piperacillin and Cefoxitin were (70%) and (76.3%) respectively. The ‎sensitivity to Imipenem was (63.3%), Trimethoprim (76.7%).‎ The sensitivity to Imipenem was 63.3% and Trimethoprim was 76.7%.The study found no significant correlation between virulence genes (PrgH and SiiD) and biofilm formation, nor between biofilm formation and antibiotic resistance in Salmonella typhi.The sequencing of PrgH and SiiD genes reveals their varied nature. 2023, 88 pages

Benzer Tezler

  1. Tez No

    473083

    Isolation of bacterial pathogens from patients with urinary tract infection in Erbil city and determination of their antibiotic susceptibility patterns

    Erbil şehri idrar yolu enfeksiyonu hastalarından bakteriyal patojenlerin izolasyonu ve antibiyotik dirençlerinin belirlenmesi

    MAY ALI SALEH AL-HAMADANI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2017

    MikrobiyolojiKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Biyomühendislik ve Bilimleri Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. SABAHATTİN CÖMERTPAY

  2. Tez No

    754036

    Detection of Klebsiella pneumoniae virulence genes isolated from urinary tract infection patients in Tikrit city, Iraq

    Irak, Tikrit şehrindeki idrar yolu enfeksiyon hastalarından izole edilen Kklebsiella pneumoniae virülans genlerinin tespiti

    MOHAMMED MUNEF SAAB SAAB

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ YAŞAR KEMAL YAZGAN

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ANAS YASEEN MAHMOOD AL-HAYAWI

  3. Tez No

    157979

    Enfeksiyon etkeni olarak izole edilen Candida albicans suşları ile kolonize suşlar arasındaki genotipik farklılıkların pulsed field gel electrophoresis ve arbitrarily primed PCR yöntemi ile araştırılması

    The investigation of genotyping differences between infecting and colonizing Candida albicans strains by pulsed field gel electrophoresis and arbitrarily primed PCR methods

    BARIŞ OTLU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    MikrobiyolojiGazi Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. SEMRA KUŞTİMUR

  4. Tez No

    440058

    Solunum yollarından izole edilen pseudomonas, aspergillus ve candida suşlarının virülans faktörlerinin araştırılması

    İnvestigation of the virulence factors of pseudomonas, aspergillus and candida strains i̇solated from respiratory tract

    BEDRİYE NAZLI GENÇ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıMarmara Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞEGÜL KARAHASAN

  5. Tez No

    782443

    Yoğun bakım hastalarından izole edilen çoklu ilaca dirençli pseudomonas aeruginosa izolatlarında amikasin, tigesiklin ve meropenemin seftolozan/tazobaktam ile kombinasyonlarının in vitro etkinliğinin araştırılması

    Investigation of in vitro efficacy of combinations of amikacin, tigecycline and meropenem with ceftolozane/tazobactam in multidrug-resistant pseudomonas aeruginosa strains isolated from intensive care patients

    ESRA YARTAŞI

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BEDİA DİNÇ

Geri Dön