Geri Dön

The virulence genes algL and algD in Pseudomonas aeruginosa isolated form skin burn and wound specimens of Iraqi patients

Iraklı hastaların deri yanık ve yara örneklerinden izole edilen Pseudomonas aeruginosa'da algL ve algD virülans genleri

PDF İndir

  1. Tez No: 832323
  2. Yazar: ABBAS HASAN GHLAIM AL-BAYATI
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ EMİN BOZKURT, DR. ÖĞR. ÜYESİ SHAİMAA YOUSİF ABDULFATTAH
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 84

Özet

Pseudomonas aeruginosa, bağışıklığı baskılanmış kişilerde ve ağır hastalarda nozokomiyal enfeksiyonlara neden olabilen agresif bir bakteridir. İlaca dirençli izolatların ısrarlı gelişiminin bir sonucu olarak, bunlar artık çevrede, özellikle sağlık kuruluşlarında yaygın olarak yayılmakta ve insanların refahı için önemli bir risk oluşturmaktadır. Bu çalışmanın amacı, yara ve yanıklardan mustarip hastalardan izole edilen bakterilerde direnç genlerinin (algD ve algL) prevalansını ve risk faktörlerini araştırmaktır. Bu çalışmada Irak, Bağdat'taki Al-Yarmouk Eğitim Hastanesindeki hastalardan 150 sürüntü örneği toplanmıştır. Bakterilerin izolasyonu ve tanımlanması, kültür ve biyokimyasal testler dahil olmak üzere geleneksel laboratuvar yöntemleri kullanılarak yapılmıştır. Doğrulayıcı teşhis ve antibiyotik direnç profili, otomatik VITEK-2 kompakt sistemi kullanılarak yapılmıştır. Bu genler, DNA ekstraksiyonundan sonra PCR kullanılarak tespit edilmiştir. Bu çalışmada hastaların yaşları 24-47 arasında değişmekteydi ve cinsiyet dağılımına göre erkek sayısı kadın sayısından fazlaydı. Ayrıca 150 sürüntü örneğinden sadece 20 örnekte P. aeruginosa tespit edilmiştir. algD ve algL genlerinin frekansları bakteri izolatlarının sırasıyla %75 ve %65'inde pozitiftir. Genlerin enfeksiyon bölgesine göre dağılımına göre ise algD geni yanıklarda %80 ve yaralarda %70, algL geni ise yanıklarda %80 ve yaralarda %50 pozitiftir. Diğer antibiyotiklerle karşılaştırıldığında, imipenem (%50), sefepim (%50), seftazidin (%50), tikarasilin-klavulanik asit (%50), piperasilin (%50) ve tikarasilin (%50) yüksek antibiyotik direnci ile ilişkilendirilmiştir. Bu antibiyotikler ayrıca aynı oranda dirençli ve hassas bakteri izolatlarıyla bağlantılıydı, ardından tobramisin (%40), gentamisin (%40), amikasin (%40) ve meropenem (%40) geliyordu. Buna karşılık, kolistin (%30) ve siprofloksasin (%20) en düşük antibiyotik direnci modeliyle ilişkilendirilmiştir. Sonuç olarak, bu genlerin bakteriyel izolatlar arasında daha yüksek bir prevalansa sahip olması, bu aljinat kodlayan genlerin P. aeruginosa'nın patogenezinde ve antibiyotik direncinde önemli bir rol oynayabileceğini ve bunun da tedavisini zorlaştırdığını göstermektedir.

Özet (Çeviri)

Pseudomonas aeruginosa is an aggressive bacterium that may cause nosocomial infections among immunocompromised patients and those who are gravely ill. As a result of the persistent development of drug-resistant strains, they are now widely spread throughout the environment, particularly in healthcare facilities, and pose a significant risk to the well-being of human beings. This study aim to investigate the prevalence and risk factors for the resistance genes (algD and algL) among bacterial isolates from patients suffering from wound and burns. In this study, 150 swab samples were collected from patients at the Al-Yarmouk Teaching Hospital in Baghdad, Iraq. The isolation and identification of bacteria were done using traditional laboratory methods, including culture and biochemical tests. The confirmatory diagnosis and antibiotic resistance profiling were done using the automated VITEK-2 compact system. These genes were detected using PCR after DNA extraction. During this study, the age of patients ranged from 24-47 years, and according to the sex distribution, the male count was higher than the female count. In addition, among 150 swab samples, only 20 samples were detected with P. aeruginosa. The frequencies of the algD and algL genes were positive in 75% and 65% of the bacterial isolates, respectively. And according to the distribution of genes concerning the site of infection, the algD gene was positive at 80% and 70% in burns and wounds, respectively, while the algL gene was positive in 80% and 50% of burns and wounds, respectively. When compared to other antibiotics, imipenem (50%), cefepime (50%), ceftazidine (50%), ticaracillin-clavulanic acid (50%), piperacillin (50%), and ticaracillin (50%) were linked to high antibiotic resistance. These antibiotics were also linked to the same percentage of resistant and sensitive bacterial isolates, followed by tobramycin (40%), gentamycin (40%), amikacin (40%), and meropenem (40%). In contrast, collistin (30%) and ciprofloxacin (20%) were associated with the lowest pattern of antibiotic resistance. In conclusion, these genes had a higher prevalence among bacterial isolates, indicating that these alginate-encoding genes may play an important role in the pathogenesis and antibiotic resistance of P. aeruginosa, which makes it more difficult to treat.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    757791

    Screening the virulence genes and protein expression profiles of clinical isolates of resistant salmonella typhi

    Dirençli salmonella typhi klinik izolatlarının virülans genlerinin ve protein ekspresyon profillerinin taranması

    HISHAM SAMIR ABDALFATAH ALMODARES

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    ZiraatErciyes Üniversitesi

    Tarım Bilimleri ve Teknolojileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEMİH YILMAZ

    DOÇ. DR. PINAR SAĞIROĞLU

  2. Tez No

    896106

    Staphylococcus aureus izolatlarında virulans genlerinin araştırılması

    Investigation of virulence genes in staphylococcus aureus isolates

    HÜSEYİN CAN SELVİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    MikrobiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İBRAHİM MEHMET ALİ ÖKTEM

  3. Tez No

    648390

    Kan ve idrar örneklerinden izole edilen escherichia coli izolatlarında virülans genlerinin araştırılması

    Investigation of virulence genes in escherichia coli isolated from blood and urine samples isolates

    LAMAN HASANLI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    MikrobiyolojiSelçuk Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HATİCE TÜRK DAĞI

  4. Tez No

    818556

    Study the correlation between genes for virulence factors and quorum-sensing in Pseudomonas aeruginosa isolated from clinical sources in Iraq

    Irak'ta klinik kaynaklardan izole edilen Pseudomonas aerugınosa'da virülans faktörleri genleri ile quorum-sensıng arasındaki ilişkiyi incelemek

    AMENAH HASHIM FERMAN AL JANABI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ OKAN ÜRKER

    DR. ÖĞR. ÜYESİ NUHA JOSEPH KANDALA

  5. Tez No

    815028

    Anbar vilayetinde idrar yolu enfeksiyonu ve doğurganlık problemi olan erkeklerden izole edilen E. coli'nin virülans faktör genlerinin karakterizasyonu

    Charecterization of the virulence factors genes of E. coli isolated from men suffering from urinary tract infection and fertility problems in Anbar province

    MOHAMMED NASRI HASAN AL-BAYATI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ AYŞENUR KAYABAŞ AVŞAR

Geri Dön