Investigation of the role of DDX41 mutation and some immunological parameters for leukemia
DDX41 mutasyonunun rolünün ve lösemi için bazı immünolojik parametrelerin incelenmesi
- Tez No: 834867
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ PINAR ARSLAN, DR. SAAD H. ALBADRY
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 75
Özet
Lösemi, kemik iliği ve lenfatik sistem dahil olmak üzere vücudun kan oluşturan dokularının kanseridir. Lösemi genellikle güçlü enfeksiyon savaşçıları olan beyaz kan hücrelerini içerir. Lösemili kişilerde kemik iliği, düzgün çalışmayan aşırı miktarda anormal beyaz kan hücresi üretir. Genel olarak löseminin, bazı kan hücrelerinin DNA'larında mutasyonlar kazanmasıyla ortaya çıktığı düşünülmektedir. Bu çalışmada, sağlıklı bireylerde ve lösemili hastalarda DDX41 mutasyonunun değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Bunun için 78 lösemili hasta ve 30 sağlıklı birey olgusu değerlendirilmiştir. Tam kanın DNA'sı toplandı, ardından DNA dizilimi yapılmıştır. Daha sonra CBC, Ferritin ve IL-6 kullanılarak değerlendirilen çalışma, test edilen numunelerde yüksek oranda spesifik bir tek nükleotid polimorfizmi (SNP) oluşumunu göstermiştir. SNP, amplifiye edilmiş PCR fragmanlarının 338. pozisyonunda gözlendi ve bu, C nükleotidinin, 338C>G veya C338G olarak anılan G nükleotit ile yer değiştirmesiyle sonuçlanmıştır. SNP yaygın olarak CC ve CG olmak üzere iki farklı modelde tespit edilmiştir. Sıralama kromatogramları, bu sekansların PCR amplikonlarındaki pozisyonlarını göstermiştir. Çalışma, C nükleotidi için homozigot olan C/C durumunun hem vakalarda (24/78) hem de kontrollerde (18/30) baskın olduğunu bulmuştur. Ek olarak, heterozigot C/G paterni hem vakalarda (54/78) hem de kontrollerde (12/30) sıklıkla gözlenmiştir. Özellikle, homozigot TT paterni ve heterozigot CT, numune veya kontrol gruplarında tespit edilmemiştir. Çalışma sonuçları, incelenen popülasyondaki DDX41 C>G SNP dağılımının, 0,06'lık anlamlı olmayan bir p değeri ile Hardy-Weinberg dengesi (HWE) ile tutarlı olduğunu göstermektedir. Resesif ve baskın modeller altında, DDX41 SNP'nin lösemi ile ilişkisi istatistiksel olarak anlamlı değildir. Bununla birlikte resesif modelin (GG+GA) 2,6 olasılık oranı (OR) ile lösemi enfeksiyonuna karşı daha duyarlı olduğu gözlemlenmiştir. Ayrıca bu çalışmanın sonuçları lösemili hastalar ile sağlıklı kontrol arasında anlamlı bir fark olmadığını göstermiştir (P>0,05). Ancak hastaların WBC'si sağlıklı kontrolden daha yüksektir (lösemi hastalarında 10.42[10^9/L], sağlıklı kontrollerde 5.02[10^9/L], P0,05). Ayrıca bulgularımız lösemi hastalarında IL-6'nın 4,44± 1,54 pg/mL olduğunu, sağlıklı kontrolde ise bu değerin 1,75±0,19 pg/mL olduğunu göstermiştir (P
Özet (Çeviri)
Leukemia is a type of cancer that affects the blood-making tissues in the body, such as the bone marrow and the lymphatic system. It mainly involves the white blood cells, which typically help fight infections. People with leukemia have too many abnormal white blood cells that work poorly. Leukemia is believed to be caused by some changes in the DNA of some blood cells. This study aimed to evaluate DDX41 mutation in healthy subjects and patients with leukemia. For this purpose, 78 patients with leukemia and 30 healthy subjects were evaluated. The DNA of the whole blood was collected, followed by DNA sequencing. Then, the CBC, Ferritin, and IL-6 were assessed using the study demonstrated a high occurrence of a specific single nucleotide polymorphism (SNP) in the tested samples. The SNP was observed at position 338 of the amplified PCR fragments, resulting in the replacement of C nucleotide with G nucleotide, referred to as 338C>G or C338G. The SNP was commonly detected in two distinct patterns, CC and CG. The sequencing chromatograms displayed the positions of these sequences in the PCR amplicons. The study found that the C/C status, which is homozygous for the C nucleotide, was predominant in both cases (24/78) and controls (18/30). Additionally, the heterozygous C/G pattern was observed frequently in both cases (54/78) and controls (12/30). Notably, the homozygous TT pattern and heterozygous CT were not detected in either the sample or control groups. The study results indicate that DDX41 C>G SNP distribution in the studied population is consistent with Hardy-Weinberg equilibrium (HWE) with a non-significant p-value of 0.06. Under the recessive and dominant models, the association of DDX41 SNP with leukemia was not statistically significant. However, the recessive model (GG+GA) was observed to be more sensitive to leukemia infection, with an odds ratio (OR) of 2.6. In addition, the results of the present study showed that there was no significant difference between leukemia patients and healthy control (P>0.05). However, the WBC of patients was more than healthy control (10.42[10^9/L] in leukemia patients while 5.02[10^9/L] in healthy controls, P
Benzer Tezler
- Östrojenin antiosteoporotik etki mekanizmasında perisitlerin rolünün overektomili sıçanlarda araştırılması
Investigation of the role of pericytes in the antiosteoporotic effect mechanism of estrogen in ovarectomised rats
HAMZA HALICI
Doktora
Türkçe
2024
Eczacılık ve FarmakolojiAtatürk ÜniversitesiTıbbi Farmakoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ELİF ÇADIRCI
- Belirsizlik algısı ve anksiyete ilişkisinde temel psikolojik ihtiyaçların rolünün değer yönelimleri bağlamında incelenmesi
Investigation of the role of basic psychological needs in the relationship between perception of uncertainty and anxiety in the context of value orientations
AYBİKE ÇAVDAR
Doktora
Türkçe
2024
PsikolojiDokuz Eylül ÜniversitesiPsikoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İNCİ BOYACIOĞLU BAL
- Zekâ oyunlarının kavram yanılgılarını gidermedeki rolünün incelenmesi
Investigation of the role of intelligent games in removing misconceptions
ASLI NUR HODANCI
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Eğitim ve ÖğretimGiresun ÜniversitesiMatematik Eğitimi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MİHRİBAN HACISALİHOĞLU KARADENİZ
- Sıçanlarda deneysel gentamisin nefrotoksisitesinde oksidatif stresin rolünün ve olası oksidatif stres üzerine kafeik asit Fenetil Ester'in etkisinin araştırılması
Investigation of the role of oxidative stress in experimental gentamicin b induced nephrotoxixity and effect of caffeic acid phenethyl ester on possible oxidative stress in rats
FADİME ÖZGE AYGÜN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıSüleyman Demirel ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FÜSUN ZEYNEP AKÇAM
YRD. DOÇ. DR. ONUR KAYA
- Acil servise epileptik atak olarak başvuran hastalarda serum subfatin düzeyinin rolünün araştırılması
Investigation of the role of serum subfatin levels in patients presenting to the emergency department with epileptic seizures
MUSTAFA TOLGA ÖZDAL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
Acil TıpSağlık Bilimleri ÜniversitesiAcil Tıp Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HALİL KAYA