Geri Dön

Molecular characterisations of some virulence genes of Escherichia coli isolated from patients with urinary tract infection in the South of Iraq

Güney Irak'ta idrar yolları enfeksiyonu olan hastalardan izole edilen Escherichia coli 'nin bazı virülans genlerinin moleküler özellikleri

  1. Tez No: 836905
  2. Yazar: ZAINAB FAKHRI ABDULHASAN ALSURAIFI
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. IRMAK POLAT, DR. ÖĞR. ÜYESİ AHMED KHASSAF ATYA
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 70

Özet

Akut idrar yolu enfeksiyonu (İYE), dünya genelinde bireyleri etkileyen yaygın bir sağlık sorunudur. Etkili tedavi için zamanında ve doğru teşhis, İYE'nin ciddi komplikasyonlara yol açabileceği göz önünde bulundurulmalıdır. Bu çalışma, İYE hastalarında Escherichia coli (E. coli) yaygınlığını ve antibiyotik duyarlılık örüntülerini araştırmayı amaçlamaktadır. Ayrıca, E. coli izolatlarında antibiyotik direnci ile ilişkili belirli genlerin varlığı incelenmektedir. Ocak 2022 ile Haziran 2022 arasında Al-Hussein Öğretim Hastanesini ziyaret eden, İYE'nin klinik özelliklerini gösteren hastalardan toplam 80 idrar örneği toplandı. Kontrol grubu olarak 50 sağlıklı birey dahil edildi. İYE hastaları, disüri, sık idrara çıkma, aciliyet, ateş ve bel ağrısı gibi klinik kriterlere göre teşhis edildi. İYE hastalarının yaş ve cinsiyet dağılımı analiz edildi. İYE hastaları arasında, dişi hastalarda belirgin bir şekilde daha yüksek yaygınlık gözlendi; 49 kadın hasta (%61.25) ve 31 erkek hasta (%38.75). İYE vakalarının en yüksek yüzdesi, 60 yaşın üzerindeki kadınlarda (%15.0) ve 50-59 yaş aralığındaki kadınlarda (%13.75) görüldü, bu yaş gruplarında erkeklerde enfeksiyon oranı %8.75 olarak kaydedildi. E. coli, hastaların %35.0'ini oluşturan en yaygın bakteriyi temsil ediyordu, onu %15.0 ile Pseudomonas aeruginosa izliyordu. Tüm 28 E. coli izolatı, katalaz, metil kırmızı ve laktoz fermentasyon testlerinde pozitif sonuçlar verirken, oksidaz, sitrat ve vogas-proskauer testlerinde negatif sonuçlar verdiği standart gram-negatif kart özellikleriyle tanımlandı. Antibiyotik duyarlılık testi, E. coli'ye karşı 7 antibiyotiğin dirençli olduğunu, 2 antibiyotiğin duyarlı olduğunu ve 3 antibiyotiğin ılımlı dirence sahip olduğunu ortaya koydu. Ayrıca, E. coli izolatlarında antibiyotik direnci ile ilişkilendirilen üç genin (hlyA, vat ve mcr-1) yaygınlığı, Real Time PCR yöntemiyle incelendi ve sırasıyla %26.25, %23.75 ve %12.50 oranlarında pozitif saptandı. Bu çalışma, Al-Hussein Öğretim Hastanesi'ndeki İYE hastalarında E. coli izolatlarının yaygınlığı ve antibiyotik duyarlılığına dair değerli bilgiler sunmaktadır. Antibiyotik direnç genlerinin yüksek sıklığı, etkili bir şekilde İYE enfeksiyonlarıyla mücadele etmek için sürekli gözetim ve uygun antibiyotik yönetiminin önemini vurgulamaktadır.

Özet (Çeviri)

Acute urinary tract infection (UTI) is a common health concern affecting individuals worldwide. Prompt and accurate diagnosis is crucial for effective treatment, as UTIs can lead to severe complications if left untreated. This study aims to investigate the prevalence of Escherichia coli (E. coli) in UTI patients and assess their antibiotic susceptibility patterns. Additionally, the presence of specific genes associated with antibiotic resistance in E. coli isolates is examined. A total of 80 urine samples were collected from patients with clinical features indicative of UTI who visited Al-Hussein Teaching Hospital from January 2022 to June 2022. Fifty healthy individuals were included as the control group. UTI patients were diagnosed based on clinical criteria, such as dysuria, frequency, urgency, fever, and loin pain. The age and gender distribution of UTI patients was analyzed. Among the UTI patients, females exhibited a significantly higher prevalence, with 49 female patients (61.25%) compared to 31 male patients (38.75%). The percentage of UTI cases was highest in females above 60 years (15.0%) and in females aged 50-59 years (13.75%), while males in these age groups recorded 8.75% infection rate. E. coli was the most prevalent bacterium, accounting for 35.0% of the patient samples, followed by Pseudomonas aeruginosa at 15.0%. All 28 E. coli isolates were identified through standard gram-negative card characteristics, showing positive results for catalase, methyl red, and lactose fermentation tests, but negative results for oxidase, citrate, and vogas-proskauer tests. Antibiotic susceptibility testing revealed that 7 antibiotics displayed resistance to E. coli, 2 antibiotics were sensitive, and 3 antibiotics demonstrated moderate resistance. Furthermore, the prevalence of three genes (hlyA, vat, and mcr-1) associated with antibiotic resistance in E. coli isolates was investigated using Real Time PCR, with positive rates of 26.25%, 23.75%, and 12.50%, respectively. This study provides valuable insights into the prevalence and antibiotic susceptibility of E. coli isolates in UTI patients from Al-Hussein Teaching Hospital. The high occurrence of antibiotic resistance genes highlights the importance of continuous surveillance and appropriate antibiotic stewardship to combat UTI infections effectively.

Benzer Tezler

  1. Bazı gıdalardan izole edilen escherıchıa colı suşlarında ki antimikrobiyal direnç ve virülans faktör genlerinin yaygınlığı ve dağılımının moleküler karakterizasyonu

    Molecular characterization of prevalence and distribution of the antimicrobial resistance and virulence factor genes in escherichia coli strains isolated from some foods

    CANSU BAŞAK ÖZIŞIK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    BiyomühendislikKırıkkale Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYTEN ÇELEBİ KESKİN

  2. Biological, biochemical and moleculer characterization of Escherichia coli isolated from pregnant women infected with urinary tract infections

    İdrar yolu enfeksiyonu ile enfekte olan hamile kadınlardan izole edilen Escherichia coli'nin biyolojik, biyokimyasal ve moleküler karakterizasyonu

    TAMADHUR SHAKIR NAJI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    MikrobiyolojiGebze Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ SONAY ÖZKAN

  3. Lactococcus garvieae'de virulans genlerinin moleküler karakterizasyonu

    Molecular characterization of virulence genes in lactococcus garvieae

    TUĞBA TEKER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Genetikİstanbul Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜLRUH ALBAYRAK

    PROF. DR. TÜLAY AKAYLI

  4. Investigation of helicobacter pylori virulence genes and t-cell responses in pediatric gastritis patients

    Pediatrik gastrit hastalarında helikobakter pylori virülans genleri ve t-hücre cevaplarının araştırılması

    NİRAN ÖZDEMİR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    Allerji ve İmmünolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYÇA SAYI YAZGAN

    DR. ÖĞR. ÜYESİ SİNEM ÖKTEM OKULLU

  5. Study some virulence characteristics of multidrug resistant biofilm forming acinetobacter Baumannii isolated from clinical sites

    Çoklu ilaçlara dayanıklı biyofilm oluşturan asinetobakter Baumannıı'nin klinik sitelerden izol edilmiş bazı virülans özelliklerinin çalışması

    ZAINAB MOHAMMED MAHMOOD AL-MASHHADANI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ RAMAZAN SERDAR ESMER

    PROF. DR. SUHAD SAAD MAHMOOD