Ankara keçilerinde tiftik gelişimini etkileyen genlerin RNA dizileme yöntemiyle belirlenmesi
Determination of the genes affecting mohair development in angora goats by RNA sequencing
- Tez No: 842930
- Danışmanlar: PROF. DR. REYHAN ÇOLAK, DOÇ. DR. ÖZGE ÖZMEN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 264
Özet
Ankara keçisinden önemli bir lif kaynağı olan tiftik elde edilmektedir. Geçmiş yıllarda tiftik üretiminde dünyada birinci sırada olan ülkemiz günümüzde bu özelliğini yitirmiş durumdadır. Yapılan bazı çalışmalarda tiftik verimi özelliği bakımından da Ankara keçisi Lalahan ve Eskişehir varyetesinin birbirinden farklı olduğu belirtilmektedir. Tiftiğin ekonomik değerini belirleyen en önemli özellikler tiftiğin lif çapı ve miktarıdır. Tiftik üretimi yapılan ülkelerde bu özelliklerin iyileştirilmesine çalışılmaktadır. Hayvansal lifleri oluşturan kıl folikülü özelliklerinin ve/veya genetik düzenleme mekanizmalarının lif üretimini ve kalitesini doğrudan etkilediği belirtilmektedir. Yapılan bu çalışmayla Ankara keçisine ait iki varyetede tiftik gelişimine etki eden genlerin ve bu genlere etki eden moleküler mekanizmaların belirlenmesi hedeflenmiştir. Tiftik- mikroçevre arasında meydana gelen olayların incelenmesinin kaliteyi artırmada yol gösterici olabileceği düşünülerek anagen (Eylül ayı), katagen (Ocak ayı) ve telogen (Mart ayı) fazında omuz bölgesinden biyopsi örneği alınmıştır. Bu biyopsi örneklerinin RNA izolasyonu yapılmış ve RNA dizileme yöntemi kullanılarak farklı eksprese edilen genler ve bu genlerin etkili olduğu yolaklar belirlenmiştir / analiz edilmiştir. Dişi Eskişehir varyetesinde katagen ve telogen fazının karşılaştırıldığı grupta KRTAP8-1, KRTAP16.4 ve KRTAP21-1 genlerinin ekspresyonunun oldukça yüksek olduğu görülmüştür. İlginç olarak KRTAP21-1 geninin dört farklı protein izoformu halinde eksprese edildiği belirlenmiştir. Eskişehir varyetesinde Lalahan varyetesinin aksine erkeklerde anagen-katagen karşılaştırılmasında belirlenen DEG'lerin keratinizasyon yolağında önemli ölçüde fonksiyonel olduğu ve bu genlerin düşük ekspresyon seviyesine sahip olduğu belirlenmiştir. Elde edilen sonuçlar, KRT ve KRTAP genlerinin oldukça fonksiyonel olduğunu, dişiler ve erkekler arasında farklı ekspresyon modellerine sahip olduğunu, ayrıca Eskişehir ve Lalahan varyeteleri arasında farklı olduğunu göstermiştir.
Özet (Çeviri)
Mohair, an important source of fiber, is obtained from Angora goats. Our country, which ranked first in the world in mohair production in the past years, has lost this feature today. In some studies, it is stated that Lalahan and Eskisehir varieties of Angora goats are different from each other in terms of mohair yield as well as some other characteristics. The important characteristics that determine the economic value of mohair are fiber diameter and quantity. In countries where mohair is produced, efforts are made to improve these characteristics. It is stated that hair follicle characteristics and/or genetic regulations mechanisms that form animal fibers directly affect fiber production and quality. In this study, it was aimed to determine the genes affecting mohair development in two varieties of Angora goat and the molecular mechanisms affecting these genes. Biopsy samples were taken from the shoulder region anagen (September), catagen (January) and telogen (March) phases, considering that examining that the events occurring between lint and the microenvironment may be instructive in improving quality. RNA was isolated from these biopsy samples and differentially expressed genes and the pathways affected by these genes were evaluated using RNA sequencing method. It has been observed that the expression of KRTAP8-1, KRTAP16.4 and KRTAP21-1 genes was quite high in the group which catagen and telogen phases were compared in Eskisehir variety females. Interestingly, KRTAP21-1 gene was found to be expressed in four different protein isoforms. In Eskisehir variety, unlike Lalahan variety, DEGs identified in anagen-catagen comparison in males were significantly enriched in the Reactome mediated keratinization pathway and these genes were down regulated. The results showed that KRT and KRTAP genes are highly functional and have different expression patterns between males and females in addition to being different between Eskisehir and Lalahan varieties.
Benzer Tezler
- Türkiye ve Amerika Birleşik Devletleri orijinli Ankara Keçisi hatları arasındaki birleştirmelerden elde edilen çeşitli genotip gruplarının önemli verim özellikleri yönünden karşılaştırılması
Başlık çevirisi yok
HALİL GÜNEŞ
Doktora
Türkçe
1992
Veteriner Hekimliğiİstanbul ÜniversitesiZootekni Ana Bilim Dalı
PROF.DR. MEHMET EVRİM
- Ankara yöresi tiftik keçilerinde sindirim sistemi helmintleri
Başlık çevirisi yok
ŞİNASİ UMUR
Doktora
Türkçe
1991
Veteriner HekimliğiAnkara ÜniversitesiPatoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF.DR. YILMAZ TİĞİN
- Genç Ankara keçilerinde bazı tiftik kalite özellikleri
Some mohair qualities of young Angora goats
AYŞE ŞEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
ZiraatNamık Kemal ÜniversitesiZootekni Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUHİTTİN ÖZDER
- Halk elinde hayvan ıslahı ülkesel projesi kapsamında Ankara keçilerinde bazı tiftik verim ve kalite özelliklerinin fenotipik ve genetik parametreleri
Phenotypic and genetic parameters of some mohair yield and quality traits in angora goats in the scope of the national animal breeding in public project
NURGÜL ERDAL
- Farklı tanen kaynakları kullanılarak hazırlanan rasyonların tiftik keçilerinde yem tüketimi. canlı ağırlık artışı, tiftik verimi ve kalitesi üzerine etkisi
Başlık çevirisi yok
HALİT İMİK
Doktora
Türkçe
1997
Veteriner HekimliğiSelçuk ÜniversitesiHayvan Besleme ve Beslenme Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ERDOĞAN ŞEKER