Yüzey zenginleştirilmiş raman spektroskopisi (SERS) ve haritalama tekniği kullanılarak farklı tipte hücrelerde apoptoz ile nekroz düzeylerinin belirlenmesi
Determination of apoptosis and necrosis level in various cell types via surface-enhanced raman spectroscopy (SERS) approach and mapping technique
- Tez No: 843202
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MEHMET YILMAZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Kimya, Mühendislik Bilimleri, Biotechnology, Chemistry, Engineering Sciences
- Anahtar Kelimeler: Yüzey Zenginleştirilmiş Raman Spektroskopisi (SERS), Apoptoz, Nekroz, Hücre Tanısı, Kemometrik Analizler, Altın Nanoçubuk Dizinler, Surface Enhanced Raman Spectroscopy (SERS), Apoptoz, Necrosis, Cell Diagnosis, Chemometric Analysis, Gold Nanorod Arrays
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Atatürk Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Nanobilim ve Nanomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 104
Özet
Amaç: Bu tez çalışmasında kanserli (A549) ve sağlıklı (MRC5) akciğer fibroblast hücreleri ile kanserli (MCF7) ve sağlıklı (MCF10A) meme epitel hücreleri farklı dozlarda apoptotik ve nekrotik ajanlara maruz bırakılarak altın nanoçubuk dizinler (gold nanorod array, GNA) ile kombine edilmiştir. Daha sonra bu sistemden alınan SERS sinyalleri ile farklı hücrelerde apoptoz ve nekrozun ayırt edilebilmesi amaçlanmıştır. Yöntem: GNA yüzeyler PVD (fiziksel buhar biriktirme) tekniği ve eğik açı biriktirme (oblique angle deposition, OAD) yöntemiyle üretilmiştir. Hücreler uygun besiyeri ve inkübasyon koşulları altında büyütülüp apoptotik ajan olarak staurosporine ve düşük doz hidrojen peroksit, nekrotik ajan olarak yüksek doz hidrojen peroksit kullanılmıştır. Uygulama yapılmış hücrelerden SERS spektrumları toplanarak kemometrik analizler gerçekleştirilmiştir. Bulgular: PVD tekniği ve OAD yaklaşımı ile anizotropik yapıya sahip GNA yüzeyler başarıyla sentezlenmiştir. Hücrelere uygulanan ajanların apoptotik ve nekrotik etkiler gösterdiği MTT ve akış sitometrisi teknikleriyle doğrulanmıştır. GNA yüzeyler ile kombine edilen hücrelerden yüksek kaliteli SERS spektrumu toplanmıştır. Sonuç: Toplanan SERS spektrumları uygun kemometrik yöntemler ile işlenmiştir. Farklı dozlarda apoptotik nekrotik ajanlar uygulanmış hücre grupları sadece kontrol gurubundan ayrılmakla kalmamış aynı ajanın farklı dozlarında da ayrım görülmüştür.
Özet (Çeviri)
Objective: In this thesis, cancerous (A549) and healthy (MRC5) lung fibroblast cells and cancerous (MCF7) and healthy (MCF10A) breast epithelial cells were exposed to different doses of apoptotic and necrotic agents and combined with gold nanorod arrays (GNA). Later, it was aimed to distinguish apoptoz and necrosis in different cells with the SERS signals received from this system. Method: GNA surfaces were fabricated by PVD (pyhsical vapor deposition) technique and oblique angle deposition (OAD) method. Cells were grown under appropriate media and incubation conditions, and staurosporine and low-dose hydrogen peroxide were used as apoptotic agents, and high-dose hydrogen peroxide was used as necrotic agents. SERS spectra were collected from the treated cells and chemometric analyzes were performed. Results: GNA surfaces with anisotropic structure were successfully fabricated by PVD technique and OAD approach. Apoptotic and necrotic effects of agents applied to cells were confirmed by MTT and flow cytometry techniques. High quality SERS spectra were collected from cells combined with GNA surfaces. Conclusion: Collected SERS spectra were processed with appropriate chemometric methods. Cell groups treated with different doses of apoptotic necrotic agents not only separated from the control group, but also showed differentiation at different doses of the same agent.
Benzer Tezler
- Yüzey zenginleştirilmiş raman spektroskopisi (SERS) yaklaşımı ile farklı hücre tiplerinin tanımlanması
Detection of different cell types through surface enhanced raman spectroscopy (SERS) approach
SEDA TARHAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Kimya MühendisliğiAtatürk ÜniversitesiProses ve Reaktör Tasarımı Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MEHMET YILMAZ
- Saf Karakovan balı ve katkılandırılmış balların yüzey zenginleştirilmiş Raman spektroskopisi (SERS) ve kemometrikanalizler ile incelenmesi
Examination of pure Karakovan honey and additive honey by surface-enhanced Raman spectroscopy (SERS) and chemometric analyses
YUNUS EMRE GEYLANİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
BiyoteknolojiAtatürk ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ASLI YILMAZ
DOÇ. DR. MEHMET YILMAZ
- Tükürükte eroin ve metabolitlerinin toksikolojik analizinde yeni bir analitik gereç olarak yüzey zenginleştirilmiş raman spektroskopi
Surface enhanced raman spectroscopy as a novel analytical tool in toxicological analysis of heroin and metabolites in saliva
RAMAZAN AKÇAN
Doktora
Türkçe
2021
Adli TıpHacettepe ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NECDET SAĞLAM
PROF. DR. UĞUR TAMER
- Yüzey zenginleştırilmiş raman spektroskopisi (SERS) için nano-yaklaşım temelli platformların geliştırilmesi ve tanı amaçlı uygulanması
Development of nano-approach based platforms for surface enhanced raman spectroscopy (SERS) and their use for detection
MEHMET YILMAZ
Doktora
Türkçe
2014
BiyomühendislikHacettepe ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERHAN BİŞKİN
- Farklı pasaj numaralarındaki hücre hatlarında farklılaşmanın yüzey zenginleştirilmiş Raman spektroskopisi(SERS) yaklaşımı ile araştırılması
The investigation of differentiation in cell lines of different passage numbers with surface enhanced Raman spectroscopy (SERS) approach
NAZLI ÖNCER
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyoteknolojiAtatürk ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ASLI YILMAZ
DOÇ. DR. MEHMET YILMAZ