Metisilin dirençli Staphylococcus aureus izolatlarında biyofilm oluşumunun genotipik ve fenotipik yöntemlerle araştırılması
Investigation of biofilm in methicillin resistant Staphylococcus aureus isolates by genotypic and phenotypic methods
- Tez No: 843220
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ DEMET GÜR VURAL
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 101
Özet
Amaç: Staphylococcus aureus klinik örneklerden sıklıkla izole edilen fırsatçı bir insan patojenidir. Antimikrobiyallere direnç ve biyofilm üretimi de patojenite faktörlerindendir. Bu çalışmada S. aureus izolatlarının biyofilm üretimi, genotipik ve fenotipik karakterlerinin araştırılması ve glikopeptid antibiyotiklerin biyofilm üreten suşlara etkisinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Çalışmaya Nisan 2020-Aralık 2022 tarihleri arasında Ondokuz Mayıs Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji Bölümü'ne gönderilen örneklerden elde edilen 130 metisiline dirençli S. aureus (MRSA) izolatı dahil edilmiştir. Vankomisin ve teikoplanin için minimum inhibitör konsantrasyon (MİK) değerleri sıvı mikrodilüsyon yöntemiyle; biyofilm oluşumu mikrotitrasyon plağı yöntemiyle belirlenmiştir. Güçlü biyofilm üreten izolatlar için vankomisin ve teikoplaninin biyofilm inhibitör konsantrasyonları (BİK) araştırılmıştır. Virulans ile ilişkili olan mecA, pvl, icaA, icaD ve bap genleri polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) yöntemi ile araştırılmıştır. Bulgular: Vankomisin ve teikoplanin MİK değerleri, vankomisin için 0,5-2 μg/ml, teikoplanin için 0,25-2 μg/ml arasında bulunmuştur. İzolatların %37,69'unda biyofilm üretimi negatif iken %23,07'sinde güçlü biyofilm üretimi belirlenmiştir. Güçlü biyofilm üreten izolatların vankomisin ve teikoplanin için BİK90 değerleri, MİK90 değerlerinin 512 katı olarak bulunmuştur. Ayrıca izolatların %96,15'inde mecA, %1,53'ünde pvl, %73,84'ünde icaA, %76,92'sinde icaD geni saptanırken, bap geni saptanmamıştır. Biyofilm üretimi ile icaA ve icaD gen pozitifliği arasındaki ilişki anlamlı bulunmuştur (p
Özet (Çeviri)
Objective: Staphylococcus aureus is an opportunistic human pathogen isolated from clinical specimens. Antimicrobial resistance and biofilm production are significant factors of pathogenicity. This study aimed to investigate the biofilm production, genotypic and phenotypic characteristics of S. aureus and to determine the effect of glycopeptide antibiotics on biofilm-producing strains. Materials and Methods: The study included 130 methicillin-resistant S. aureus (MRSA) isolated from clinical specimens sent to Ondokuz Mayıs University Medical Microbiology Department between April 2020 and December 2022. MIC values for vancomycin and teicoplanin was determined by broth microdilution method, biofilm formation by the microtitration plate method. Biofilm inhibitory concentration (BIC) was investigated for strong biofilm-producers. mecA, pvl, icaA, icaD and bap genes were examined using polymerase chain reaction (PCR). Results: Vancomycin and teicoplanin MIC values ranged from 0,5-2 μg/ml and 0,25-2 μg/ml, respectively. Biofilm production was negative in 37.69% and strong in 23.07% of the isolates. The BIC90 values for vancomycin and teicoplanin in strong biofilm-producing isolates were 512 times higher than the MIC90 values. While the mecA gene was detected in 96,15% of the isolates, pvl in 1,53%, icaA in 73,84%, and icaD in 76,92%, the bap gene wasn't detected. The relationship between biofilm and icaA and icaD gene was found to be significant (p
Benzer Tezler
- Kateter kaynaklı kan dolaşımı enfeksiyonu etkenlerinin belirlenmesi ve biyofilm oluşumunun fenotipik ve genotipik yöntemlerle araştırılması
Determination of etiologic agents of catheter related bloodstream infection and investigation of biofilm formation by phenotypic and genotypic methods
SİBEL GÜMÜŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2019
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıAkdeniz ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. METE EYİGÖR
- Kıyma ve köfte örneklerinden izole edilen Staphylococcus aureus izolatlarının antimikrobiyal direnç profilinin ve biyofilm oluşumunun fenotipik ve genotipik incelenmesi
Phenotypical and genotypical investigation of the antimicrobial resistance profile and biofilm formation of Staphylococcus aureus isolates from ground beef and meatballs
TUĞBA SARI
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyolojiAmasya ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ CEREN BAŞKAN
- Phenotypic and genotypic detection of clinical staphylococcus aureus isolates and their ability to form biofilm under different antibiotics
Klinik staphylococcus aureus izolatlarının fenotipik ve genotipik tespiti ve farklı antibiyotikler altında biyofilm oluşturabilme yetenekleri
YOUSIF JAHFER KHDHIR
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
BiyolojiHarran ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SEDAT ÇAM
DR. ÖĞR. ÜYESİ ROZHAHLAT K. JARJEES
- Molecular study of the biofilm formation associated with methicillin-resistance of Staphylococcus aureus isolated from clinical samples
Klinik örneklerden izole edilen Staphylococcus aureus'un metisiline direnci ile ilişkili biyofilm oluşumunun moleküler çalışması
MUSTAFA SAHIB ABS ABS
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. IRMAK POLAT
PROF. DR. HASANAİN KHALEEL IBRAHİM SHAREEF
- Çeşitli klinik izolatlara karşı tedavide kullanılan antimikrobiyaller ile uçucu yağ bileşenlerinin ın vitro sinerji ve antibiyofilm etkinliklerinin belirlenmesi
Determination of in vitro synergy and antibiofilm activities of antimicrobials and essential oil components used in the treatment against various clinical isolates
ABDULHAMİT ÇALI
Doktora
Türkçe
2024
MikrobiyolojiSivas Cumhuriyet ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CEM ÇELİK