Pasteurella multocida ve Mannhemia haemolytica suşlarının virulens özelliklerinin moleküler olarak incelenmesi
Molecular investigation of virulence characteristics of Pasteurella multocida and Mannhemia haemolytica strains
- Tez No: 848287
- Danışmanlar: DOÇ. DR. SEYDA CENGİZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Veteriner Hekimliği, Veterinary Medicine
- Anahtar Kelimeler: Gen, M.haemolytica, P. multocida, PCR, virülens, Gene, M.haemolytica, P.multocida, PCR, virulence
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Atatürk Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 83
Özet
Amaç: Bu çalışma da Pasteurella multocida ve Mannheimia haemolytica suşlarının PCR ile serotiplendirilmesi ve virulens özelliklerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Materyal ve Metot: Çalışma kapsamında sığır ve koyunlardan izole edilen 36 adet P. multocida ve 30 adet M. haemolytica suşu kanlı agar ve MacConkey besiyerlerinde pasajlandıktan sonra tüm suşlara kaynatma yöntemi ile DNA ekstraksiyonu yapıldı. Ekstraksiyon sonrasında serotiplendirilmesi ve virulens özelliklerinin belirlenmesi amacıyla PCR işlemleri gerçekleştirildi. Elektroforez ile PCR sonuçları değerlendirildikten sonra UV görüntüleme sisteminde sonuçlar görüntülendi. Bulgular: PCR sonuçlarına göre 36 adet P. multocida izolatından 30 (%83,3) adet izolatın serotip A da yer aldığı, 6 (%16.7) adet izolatın serotip B de yer aldığı tespit edildi. İzolatlar içinde D, E ve F serotipleri tespit edilemedi. PCR sonuçlarına göre 30 adet M. haemolytica izolatı içinde 19 (%63.4) adet izolatın serotip A1 da yer aldığı, 3 (%10) adet izolatın serotip A2 de yer aldığı, 3 (%10) izolatın serotip A6 yer aldığı ve 5 (%16.6) adet izolatın ise bu serotiplarda yer almadığı tespit edildi. PCR sonuçlarına göre 36 adet P. multocida izolatı içinde 6 (%16.7) adet izolatta ompA geni, 32 (%88.9) adet izolatta oma87 geni, 32 (%88.9) adet izolatta nanB geni, 33 (%91.7) adet izolatta ptfA geni, 33 (%91.7) adet izolatta tbpA geni, 23 (%63.9) adet izolatta ompH geni, 28 (%63.9) adet izolatta pfhA geni ve 5 (%13.9) adet izolatta ise toxA geni tespit edildi. PCR sonuçlarına göre 30 adet M. haemolytica izolatından 29 (%96.7) adet izolatta pomA geni, 26 (%86.7) adet izolatta irp geni, 26 (%86.7) adet izolatta lpsA geni ve 15 (%50) adet izolatta ise hf geni tespit edildi. Sonuçlar: Çalışma sonuçlarına göre VITEK 2 Compact sistemi ile identifikasyon ve tür spesifik primerlerin kullanıldığı PCR işlemi ile elde edilen sonuçların tamamen uyumlu olduğu görülmüştür. P. multocida için serotip A ve M. haemolytica için serotip A1'ın yaygın olduğunu gösterdi. M. haemolytica (irp, pom A, lpsA ve hf) ve P. multocida (ompA, oma87, nanB, ptfA, tbpA, ompH, pfhA ve toxA) suşlarında birden fazla virülans geni tespit edildi. Solunum sistemi infeksiyonlarında önemli patojenler olan P. multocida ve M. haemolytica'nın sahip oldukları virulens genleri ve ait oldukları serotiplerin bilinmesi bu infeksiyonların epidemiyolojisi hakkında daha ayrıntılı bilgiler vermesinin yanında uygulanması gereken aşılarda hangi suşların kullanılması gerektiğini de göstermektedir. Etkili kontrol stratejilerinin oluşturulması için daha fazla moleküler epidemiyolojiye yönelik çalışmaların yapılması da gereklidir.
Özet (Çeviri)
Aim: The aim of this study was to determine the serotyping and virulence characteristics of Pasteurella multocida and Mannheimia haemolytica strains by PCR. Method: Thirty-six P. multocida and 30 M. haemolytica strains isolated from cattle and sheep were passaged on blood and MacConkey agar then DNA extraction was performed by boiling method. After DNA extraction, PCR procedures were performed to determine serotyping and virulence factors of strains. PCR products were visualized in agarose gel electrophoresis using a UV imaging system. Findings: PCR results showed that 30 (83.3%) of 36 P. multocida isolates were in serogroup A and 6 (16.7%) isolates were in serogroup B. Serogroups D, E and F were not detected among the isolates. In addition, among 30 M. haemolytica isolates, 19 (63.4%) isolates were in serogroup A1, 3 (10%) isolates were in serogroup A2, 3 (10%) isolates were in serogroup A6 and 5 (16.6%) isolates were not in these serogroups. The virulence gene results demonstrated that among 36 P. multocida isolates, 6 (16.7%) isolates had ompA gene, 32 (88.9%) isolates had oma87 gene, 32 (88.9%) isolates had nanB gene, 33 (91.7%) isolates had ptfA gene, 33 (91.7%) isolates had tbpA gene, 23 (63.9%) isolates had ompH gene, 28 (63.9%) isolates had pfhA gene and 5 (13.9%) isolates had toxA gene. On the other hand, pomA gene was detected in 29 (96.7%) isolates, irp gene in 26 (86.7%) isolates, lpsA gene in 26 (86.7%) isolates and hf gene in 15 (50%) isolates among 30 M. haemolytica isolates. Conclusions: According to the results of the study, the results obtained by identification with the VITEK 2 Compact system and PCR using species-specific primers were completely compatible. It showed that serogroup A for P. multocida and serogroup A1 for M. haemolytica were prevalent. Multiple virulence genes were detected in M. haemolytica (irp, pom A, lpsA, and hf) and P. multocida (ompA, oma87, nanB, ptfA, tbpA, ompH, pfhA, and toxA) strains. Knowing the virulence genes and serotypes of P. multocida and M. haemolytica, which are important pathogens in respiratory system infections, not only provides more detailed information about the epidemiology of these infections, but also indicates which strains should be used in vaccines. It is also necessary to conduct more molecular epidemiology studies to establish effective control strategies.
Benzer Tezler
- Erzurum yöresinde sığır ve koyun pneumonili akciğerlerinden Pasteurella multocida ve Manheimia haemolytica etkenlerinin izolasyonu, identifikasyonu, antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi ve olası direnç genlerinin analizi
Isolation, identification, determination of antibiotic susceptibility, analysis of possible resistance genes of Pasteurella multocida and Mannheimia haemolytica from pneumonia lungs of cattle and sheep in the Erzurum region
ELİF KARADENİZ PÜTÜR
Doktora
Türkçe
2023
Veteriner HekimliğiKafkas ÜniversitesiMikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FATİH BÜYÜK
- Koyun ve keçi akciğerlerinden bakteri izolasyonları ve izole pasteurella'ların polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ile saptanması
Isolation of bacterial agents from the lungs of sheep and goats and detection of pateurella spp by polymerase chain rection (PCR)
GÖKBEN ÖZBEY
Doktora
Türkçe
2003
Veteriner HekimliğiFırat ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. ADİLE MUZ
- Pnömonili sığır akciğerlerinden bakteri izalosyanları ve izole pastörella'ların polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ile saptanması
Isolation of bacterial agents from the lungs of cattle with pneumonia and detection of pasteurella spp. by polymerase chain reaction (PCR)
AYŞE KILIÇ
- Endotoksemik koyunlarda meloksikam uygulamasının sefkuinomun farmakokinetiği ve farmakokinetik/farmakodinamik ilişkisi üzerine etkisi
Effect of meloxicam administration on cefquinome pharmacokinetics and pharmacokinetic/pharmacodynamic relationship in endotoxemic sheep
MUHİTTİN USLU
Doktora
Türkçe
2024
Veteriner HekimliğiSelçuk ÜniversitesiFarmakoloji ve Toksikoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ENVER YAZAR
- Development of recombinant vaccine candidates composed of LtkA from Mannheimia haemolytica A1 and PlpEC-OmpH from Pasteurella multocida A:3 against bovine respiratory disease
Mannheimia haemolytica A1'e ait LtkA ile Pasteurella multocida A:3'e ait PlpEC ve OmpH'den oluşan rekombinant aşı adaylarının geliştirilmesi
AYÇA ÇIRÇIR
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜLAY ÖZCENGİZ