Geri Dön

HIf-1α ve KDM3A gen ekspresyonunun kolorektal karsinom ile ilişkisinin araştırılması

Investigation of the relationship between HIF-1α and KDM3A gene expression and colorectal carcinoma

  1. Tez No: 849221
  2. Yazar: DERYA POLAT
  3. Danışmanlar: PROF. DR. FİLİZ ÖZBAŞ GERÇEKER, DOÇ. DR. ELİF ONUR
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Gaziantep Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 88

Özet

Kolorektal kanser (KRK) yaygın kanserlerden biridir ve artan mortaliteyle ilişkilidir. HIF-1α'nın önemi, insanlarda hipoksi ile KRK arasındaki ilişkiyi ortaya koyan bazı çalışmalarda fark edilmiştir. HIF-1α ekspresyonu KDM3A ile düzenlenebilir. Bu çalışmada HIF-1α, KDM3A ve epitelyal-mezenkimal geçiş (EMT) gen ekspresyonları ile kolorektal karsinom arasındaki ilişkinin araştırılması amaçlanmıştır. Kolorektal kanserli 50 hasta ve 50 sağlıklı kontrolde HIF-1α, KDM3A ve EMT genlerinin ekspresyon düzeyini tespit etmek için qRT-PCR yöntemi uygulanmıştır. HIF-1α, KDM3A, Slug ve ZEB-1 gen ekspresyon seviyeleri, kontrollere kıyasla KRK grubunda önemli ölçüde daha yüksek bulunmuştur. ROC analizinde 0,664 AUC elde edilmiştir. Test ayrıca KDM3A ekspresyon düzeylerini kullanarak KRK hastalarını sağlıklı kontrollerden ayırma konusunda %85,4 özgüllük ve %54 duyarlılık göstermiştir. Bu çalışma, kolorektal kanser ile KDM3A gen ekspresyon seviyesi arasındaki ilişkiyi insan periferal lökosit örneklerinde gösteren ilk çalışmadır. Çalışma sonuçları, KDM3A' nın kolorektal kanser tanı ve tedavisinde önemli bir belirteç gen olabileceğini düşündürmektedir.

Özet (Çeviri)

Colorectal cancer is one of the common cancers and associated with increased mortality. The importance of HIF-1α has been recognized in some studies revealing the relationship between hypoxia and CRC in humans. HIF-1α expression can be regulated by KDM3A. The aim of this study was to investigate the relationship between HIF-1α, KDM3A and epithelial-mesenchymal transition (EMT) gene expressions and colorectal carcinoma. qRT-PCR was performed to detect the expression level of HIF-1α, KDM3A, and EMT genes in 50 patients with colorectal cancer and 50 healthy controls. HIF-1α, KDM3A, Slug and ZEB-1 expression levels were significantly higher in the CRC group compared to the controls. In ROC analysis 0.664 AUC was acquired. The test was also showed 85.4% specificity and 54% sensitivity for separating CRC patients from healthy controls by using the KDM3A expression levels. This is the first study to show the relationship between colorectal cancer and KDM3A gene expression level in human peripheral leukocyte samples. Results of the study suggested that KDM3A might be an important marker gene in the diagnosis and treatment of colorectal cancer.

Benzer Tezler

  1. Kolorektal kanser riski ile hipoksiyle indüklenen faktör-1alfa (HIF-1α) ve von hippel lindau (VHL) gen polimorfizmleri arasındaki ilişki

    Colorectal cancer risk in relation to hypoxia inducible factor-1α (HIF-1α) and von hippel-lindau (VHL) gene polymorphisms

    HASAN SAYGIN DEMİREL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Tıbbi BiyolojiNecmettin Erbakan Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. AHMET BÜLENT TURHAN

  2. Kolorektal karsinomlarda ekstraselüler matriks düzenlenmesi ile ilişkili HIF-1 αlfa/LOX/ITGA5 protein ekspresyonunun prognostik ve moleküler özellikler ile ilişkisi

    Relationship of HIF-1α/LOX/ITGA5 protein expression associated with extracellular matrix regulation with prognostic and molecular features in colorectal carcinomas

    HAYRİYE TATLI DOĞAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    PatolojiAnkara Yıldırım Beyazıt Üniversitesi

    Tıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FAZLI ERDOĞAN

  3. Deneysel hipoksik iskemik rat modelinde HİF 1 alfa düzeyi, askorbik asit ve eritropoietinin nöroprotektif etkisi

    HIF 1 alpha in the experimental hypoxic ischemic rat model level of ascorbic acid and erythropoietin neurroprotective effect

    MEHMET AKİF GÜMÜŞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıFırat Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ERDAL TAŞKIN

  4. Preeklampsi gelişiminde HIF-1α, TİE-2 ve CD95' in hastalığın patogenezi ile ilişkisi

    The relationship of development of preeclampsia with HİF-1α, TİE-2, and CD95 in the pathogenesis of the disease

    FATMA ÖZÇELİK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    BiyokimyaCumhuriyet Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. ENVER SANCAKDAR

  5. AZF delesyonu olan infertil erkeklerde HIF-1α sinyal yolağının aktivitesinin araştırılması

    Investigation of the activity of the HIF-1α signaling pathway in infertile men with AZF deletion

    DİLBESTE DEMİR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    BiyolojiNecmettin Erbakan Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ EMİNE NEDİME KORUCU