Geri Dön

Broyler tavuklardan elde edilen salmonella ınfantis izolatlarının integron, antimikrobiyal direnç ve virülens gen profillerinin incelenmesi

Investigation of integron, antimicrobial resistance and virulence gene profiles of salmonella infantis isolated from broyler chickens

PDF İndir

  1. Tez No: 849906
  2. Yazar: MELİKE BEKÖZ YARAR
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SÜHEYLA TÜRKYILMAZ
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Veteriner Hekimliği, Microbiology, Veterinary Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Çoklu antibiyotik direnci, İntegron, Salmonella Infantis, Virülens gen, Integron, Multidrug antimicrobial resistance, Salmonella Infantis, Virulence gene
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Aydın Adnan Menderes Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 107

Özet

Amaç: Broyler tavuklardan elde edilen Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis izolatlarında integron, antimikrobiyal direnç ve virülens gen profillerinin araştırılmasıdır. Gereç ve Yöntem: Broyler tavuklardan elde edilen toplam 255 Salmonella izolatı kullanıldı. Salmonella izolasyonu, TS EN ISO 6579-1:2017 standardına göre yapıldı. İzolatların cins (invA) ve tür (serovar Enteritidis için sefA, serovar Typhimurium için spy, serovar Infantis için fljB) düzeyinde doğrulanması, integron (int1, int2) ve virülens gen (sopB, pipD, sopE, sifA, stn, spaN, spvC, slyA, hilA, spvR) profillerinin belirlenmesi için polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) kullanıldı. İzolatların sekiz antimikrobiyal aileye ait sekiz antibiyotiğe karşı direnç profilleri disk difüzyon yöntemi ile incelendi. İzolatların çoklu antibiyotik direnç (MDR) durumları ile integron ve virülens genlerinin varlığı arasındaki ilişki; ayrıca, integron genlerinin varlığı ile virülens genlerinin varlığı ve antimikrobiyal direnç arasındaki ilişki Pearson Ki-Kare (χ2) testi kullanılarak incelendi. Bulgular: Tür spesifik PZR sonuçlarına göre izolatların %62,3'ü S. Infantis olarak identifiye edildi. S. Infantis izolatları arasında en yüksek direnç trimetoprim/sülfametoksazol, tetrasiklin (%89,3) ve amoksisilin/klavulanik aside (%62,9) karşı belirlenirken en etkili antibiyotikler ampisilin ve gentamisin olarak belirlendi. S. Infantis izolatlarının %61,0'i MDR'ye sahip iken %96,8'i integron geni taşıyordu. İzolatların, bazı virülens genlerini (sopB, pipD, sifA, stn, spaN, slyA, hilA) yüksek (%93,7-%96,8) yüksek, bazı virülens genlerini ise (sopE, spvC, spvR) daha düşük oranlarda (%11,9-%3,1) taşıdıkları tespit edildi. Yapılan istatistiksel analiz sonrasında, integron genlerinin varlığı ile bazı antibiyotiklere (gentamisin ve ampisilin) karşı direnç ve belirli virülens genlerinin (sopB, pipD, spaN, spvC, slyA, hilA, spvR) varlığı arasında anlamlı bir ilişki saptandı. Sonuç: Broyler tavuklardan elde edilen MDR'ye sahip S. Infantis izolatlarında yüksek düzeyde integron ve virülens genlerinin belirlenmesi; bu patojenin ilaç direncini ve hastalık yapma potansiyelini anlamak için önemlidir ve etkili tedavi stratejilerinin geliştirilmesine yardımcı olabilir.

Özet (Çeviri)

Objective: The aim of the study was to investigate integron, antimicrobial resistance and virulence gene profiles in Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis isolates obtained from broiler chickens. Materials and Methods: Two hundred fifty five Salmonella isolates obtained from broiler chickens were used in the study. Salmonella isolation was carried out according to the TS EN ISO 6579-1:2017 standard. Polymerase chain reaction (PCR) was used for the confirmation of the isolates at the genus level (invA) and species level (sefA for serovar Enteritidis, spy for serovar Typhimurium, fljB for serovar Infantis), determination of integron (int1, int2) and virulence gene (sopB, pipD, sopE, sifA, stn, spaN, spvC, slyA, hilA, spvR) profiles. The isolates' resistance profiles against eight antibiotics belonging to eight antimicrobial families were examined using the disk diffusion method. The relationship between multiple antibiotic resistance (MDR) status the presence of integron genes and virulence genes; in addition, the relationship between the presence of integron genes and the presence of virulence genes and antimicrobial resistance was examined using the Pearson Chi-Square (χ2) test. Results: According to the species-specific PCR results, 62,3% of the isolates were identified as S. Infantis. The highest resistance among S. Infantis isolates was observed against trimethoprim sulfamethoxazole, tetracycline (89,3%), and amoxicillin clavulanic acid (62,9%), while the most effective antibiotics were ampicillin and gentamicin. While 61,0% of S. Infantis isolates were MDR; 96,8% carried the integron gene. The isolates carried some virulence genes (sopB, pipD, sifA, stn, spaN, slyA, hilA) at high rates (93,7%-96,8%) and some virulence genes (sopE, spvC, spvR) at lower rates (11,9%-3,1%). After the statistical analysis a significant relationship was found between the presence of integron genes and resistance to some xvi antibiotics (gentamicin and ampicillin) and the presence of certain virulence genes (sopB, pipD, spaN, spvC, slyA, hilA, spvR). Conclusion: The high level of integron genes and virulence genes identified in MDR S. Infantis isolates obtained from broilers is important for understanding the drug resistance and disease potential of this pathogen and can aid in the development of effective treatment strategies.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    44607

    Broyler ve yumurtacı tavuk serumlarında Salmonella Enteritidis ve Salmonella Typhimurium antikorlarının serolojik testlerle araştırılması ve deneysel infeksiyon çalışmaları

    Başlık çevirisi yok

    NURİ TURAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1995

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    PROF.DR. ATİLLA ILGAZ

  2. Tez No

    578031

    Tavuk dışkılarından izole edilen escherichia coli'lerde plazmit aracılı kolistin direnci sağlayan MCR--1 geninin araştırılması

    Investigation of the plasmid mediated colistin resistance gene MCR-1 in escherichia coli isolates from chicken feces

    NİLÜFER ERZAİM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa

    Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SERKAN İKİZ

  3. Tez No

    192741

    İn vitro hipoksik ve hiperozmotik koşullarda matriks metalloproteinaz aktivitelerinin et ve yumurta tipi tavuklarda incelenmesi

    Investigation of the activities of matrix metalloproteinases in hypoxic and hyperosmotic conditions in broiler and layer type chickens in vitro

    AHMET AKKOÇ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    Veteriner HekimliğiUludağ Üniversitesi

    Patoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. M. MÜFİT KAHRAMAN

  4. Tez No

    387695

    Tavuklardan izole edilen Avibacterium paragallinarum suşlarının moleküler tanısı ve tiplendirilmesi

    Molecular diagnosis and typing of Avibacterium paragallinarum strains isolated from chickens

    SİBEL GÜNGÖRDÜ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    Veteriner HekimliğiAnkara Üniversitesi

    Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. MEHMET AKAN

  5. Tez No

    305980

    Tavuk orjinli termofilik campylobacter türlerinin biofilm özellikleri ve antibiyotik duyarlılıkları

    Bıofılm features and antımıcrobıal susceptabılıty of chıcken orıgınated ? thermophılıc campylobacter straıns

    ÖZGÜN ÖZKAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    Veteriner HekimliğiErciyes Üniversitesi

    Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FUAT AYDIN

Geri Dön