Geri Dön

İshalli köpeklerden elde edilen escherıchıa colıizolatlarının patotipik ve filogenetik özelliklerininincelenmesi

Investigation of pathotypic and phylogenetic characteristicsof escherichia coli isolates obtained from dogs with diarrhea

PDF İndir

  1. Tez No: 849931
  2. Yazar: ABDULLAH SERBEST
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SÜHEYLA TÜRKYILMAZ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Aydın Adnan Menderes Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 88

Özet

Amaç: Bu çalışmada evcil köpeklerden elde edilen intestinal patojenik Escherichia coli (DEC) izolatlarının patotiplerinin, filotiplerinin ve antimikrobiyal direnç durumlarının değerlendirilemesi ve arasındaki ilişkilerinin analiz edilmesi amaçlandı. Gereç ve Yöntem: Bu çalışmada, 40 ishal ve 40 ishal olmayan evcil köpekten alınan rektal sürüntü örneklerinden elde edilen 200 E. coli izolatı materyal olarak kullanıldı. E. coli izolasyonları klasik konvansiyonel yöntemler ile gerçekleştirildikten sonra identifikasyonlar BD Phoenix 100 sistemi kullanılarak yapıldı. Genotipik olarak da polimeraz zindir reaksiyonu (PZR) ile doğrulandı. İzolatların patotipleri grupları multipleks PZR ile belirlendi. Antibiyotik duyarlılık testlerinde BD Phoenix 100 otomatize sistem kullanıldı. Bulgular: Patotiplendirme çalışmaları tüm E. coli izolatlarının EHEC (%47,2), EPEC (%34,5), ETEC (%12,8), EIEC (%5,5) patotiplerinde bulunduğunu; filotiplendirme çalışmaları ise izolatların filogrup B2 ve C (%23,7), D (%20,0), B1 (%12,7), E (%9,0), F (%3,6) ve A (%1,8) filotiplerinde yer aldığını gösterdi. Antibiyotik duyarlılık test sonuçları izolatların tüm %78,2'sinin çoklu antibiyotik direncine (MDR) sahip olduğunu ortaya koydu. Köpeklerin klinik durumu ile ampisilin, amoksisilin klavulonat, siprofloksasin ve tigesiklin direnci arasında anlamlı bir istatistiksel ilişki tespit edilirken; izolatların çoklu antibiyotik direnç durumları, patotipleri ve filotipleri arasında anlamlı bir istatistiksel ilişki saptanmadı. Sonuç: Köpek izolatlarında DEC patotiplerine özgü virülans genlerinin varlığı ishal olan köpekler kadar sağlıklı görünümlü evcil köpeklerin insan enfeksiyonlarının potansiyel bir kaynağı olabileceğini ve çok farklı filogrupların varlığı E. coli popülasyon çeşitliliğini ortaya koyarken; çoklu antibiyotik direnci taşıyan izolatların yüksek oranı enfeksiyonların tedavisi ve kontrolü için antibiyotik seçiminin özenle yapılması gerekliliğini belirtmektedir

Özet (Çeviri)

Objective: This study aimed to evaluate the pathotypes, phylogroups, and antimicrobial resistance profiles of intestinal pathogenic Escherichia coli (DEC) isolates obtained from pet dogs and analyze their relationships. Material and Methods: In this study, 200 E. coli isolates obtained from rectal swab samples taken from 40 diarrheal and 40 non-diarrheal domestic dogs were used as material. After E. coli isolations were carried out using classical conventional methods, identifications were made using the BD Phoenix 100 system. It was confirmed genotypically by polymerase chain reaction (PCR). The pathotype groups of the isolates were determined by multiplex PCR. BD Phoenix 100 automated system was used in antibiotic susceptibility tests. Results: The pathotyping studies revealed that all E. coli isolates were found to be in EHEC (47.2%), EPEC (34.5%), ETEC (12.8%), and EIEC (5.5%) pathotypes, while the phylogenetic studies showed that the isolates belonged to phylogroups B2 and C (23.7%), D (20.0%), B1 (12.7%), E (9.0%), F (3.6%), and A (1.8%). Antimicrobial susceptibility testing results indicated that 78.2% of the all isolates exhibited multidrug resistance (MDR). Significant statistical associations were found between the clinical status of dogs and resistance to ampicillin, amoxicillin-clavulanate, ciprofloxacin, and tigecycline. However, no significant statistical relationships were observed between the isolates' MDR, pathotypes, phylogroups. Conclusion: The presence of virulence genes specific to DEC pathotypes in canine isolates suggests that not only diarrheic dogs but also apparently healthy domestic dogs could potentially serve as a source of human infections. Additionally, the existence of various phylogroups highlights the diversity within the E. coli population, and the high prevalence of isolates carrying multiple antibiotic resistances underscores the necessity for careful antibiotic selection in the treatment and control of these infections.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    462484

    Canine parvovirus enfeksiyonlarının teşhisinde PCR, elısa ve hızlı testin karşılaştırılması

    Comparative diagnosis of canine parvovirus with methods of PCR, elisa and rapid test

    IRMAK DİK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Veteriner HekimliğiSelçuk Üniversitesi

    Viroloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ATİLLA ŞİMŞEK

  2. Tez No

    755060

    Van ilinde bulunan enteritli köpeklerde canine coronavirus ve canine parvovirus insidansının serolojik olarak araştırılması

    Serological investigation of canine coronavirus and canine parvovirus in dogs with enteritis in Van province

    FERHAT ÜRGEN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Veteriner HekimliğiVan Yüzüncü Yıl Üniversitesi

    İç Hastalıkları (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YAKUP AKGÜL

  3. Tez No

    767732

    Erzurum ilindeki kedi ve köpek dışkılarında campylobacter türlerinin prevalansının araştırılması

    Investigation of the prevalence of campylobacter species from cat and dog feces in Erzurum province

    MUSTAFA YILDIZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiAtatürk Üniversitesi

    Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MEHMET CEMAL ADIGÜZEL

  4. Tez No

    785118

    Köpeklerde gastroenteritise neden olan bazı enfeksiyöz ve non-enfeksiyöz hastalıklarda serum ve fekal zonulin seviyelerinin tespiti

    Determination of serum and fecal zonulin levels in gastroenteritis of dogs caused by some infectious and NON-infectious diseases

    DENİZ ŞARDAĞ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    GastroenterolojiAydın Adnan Menderes Üniversitesi

    İç Hastalıkları (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KEREM URAL

  5. Tez No

    11080

    Köpeklerin deneysel campylobacteriosisinde klinik, hematolojik ve patolojik değişiklikler

    Clinical, haematological and pathological findings in experimental campylobacter infection of dogs

    ŞEYDA DİKER

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1990

    Veteriner HekimliğiAnkara Üniversitesi

    İç Hastalıkları (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HİKMET ÜNSÜREN

Geri Dön