Identification of potential atherogenic miRNA markers in exosomes formed in an in vitro vascular smooth muscle cell and endothelial cell culture models
In vitro vasküler düz kas hücresi ve endotel hücre kültür modellerinde oluşturulan eksozomlarda potansiyel aterojenik miRNA belirteçlerinin tanımlanması
- Tez No: 852511
- Danışmanlar: PROF. DR. KEMAL BAYSAL, DR. ZELAL ADIGÜZEL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Moleküler Tıp, Molecular Medicine
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Koç Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Hücresel ve Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Hücresel ve Moleküler Tıp Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 107
Özet
Tüm dünyadaki ölümlerin yaklaşık %20'si kardiyovasküler hastalıklara atfedilebilir ve ateroskleroz bu ölümlerin önde gelen nedenidir. Ateroskleroz, kan damarında lipid birikimine, endotel ve damar düz kas hücrelerinde moleküler değişikliklere yol açan, yağlı çizgi oluşumuna ve plak büyümesi ile damar daralmasına neden olan enflamatuar bir hastalıktır. Aterosklerozda lezyon damar duvarında yavaşça gelişir ve yırtılması ani bir kalp krizi veya felce neden olabilir. Bu komplikasyonları önlemek için erken tanı şarttır. Hücreler arası iletişim kardiyovasküler hastalıkların erken evrelerinde önemlidir ve eksozomlar bu tür iletişimde çok önemli bir rol oynar. Eksozomlar, proteinleri ve genetik materyali; mRNA, küçük RNA (miRNA ve lncRNA), protein ve DNA'yı donör hücreden hedef hücrelere taşıyan hücreler tarafından üretilen ve çeşitli etkilere sahip oldukları bildirilen veziküllerdir. Eksozom aracılı hücreden hücreye iletişimin ateroskleroz gelişimini etkilediği gösterilmiştir; bu nedenle, bu hastalıkta tanı ve tedavi uygulamalarına sahip olabilecek eksozom aracılı hücreler arası çapraz iletişim mekanizmasının araştırılması önemlidir. Bu tez, vasküler düz kas hücreleri (VSMC) ve endotel hücrelerinin (EC) farklı ko-kültür modellerinde etkileşime girmesiyle oluşan eksozomları karakterize etmeyi amaçlamaktadır. Bu tür modellerde oluşan eksozomlardaki yeni miRNA'lar, aterosklerozun erken teşhisi için yeni biyobelirteçler olarak umut vaat etmektedir. Çalışmamızda üç kültür modeli kullanılmıştır: doğrudan bir birlikte kültür modeli, dolaylı bir kültür ve izole bir ekzozom tedavi modeli. Eksozomları nanopartikül izleme analizi (NTA) ve Western blot deneyleri kullanarak karakterize ettik. Daha sonra bu eksozomlardan miRNA izole ettik ve potansiyel miRNA belirteçlerini tanımlamak için RNA'larını sıraladık. Sonuçlar potansiyel bir aday olarak hsa-miR-335-5p'ye işaret etti. Aterosklerozda hsa-miR-335-5p'nin işlevsel rolünü keşfetmek için daha fazla araştırma planlıyoruz.
Özet (Çeviri)
Approximately 20% of all deaths worldwide may be attributed to cardiovascular disease, and atherosclerosis is the leading cause of these deaths. Atherosclerosis is an inflammatory disease that leads to lipid accumulation in the blood vessel, and molecular changes in the endothelial and vascular smooth muscle cells, leading to fatty streak formation and vessel narrowing by the plaque growth. In atherosclerosis, the lesion develops slowly in the vessel wall and its rupture may cause a sudden heart attack or stroke. Early diagnosis is essential to prevent these complications. Intercellular communication is important in the early stages of cardiovascular diseases, and exosomes play a crucial role in this type of communication. Exosomes are vesicles produced by cells that carry proteins and genetic material; mRNA, small RNA (miRNA and lncRNA), protein, and DNA, from the donor cell to the destination cells, where they have been reported to have diverse effects. Exosome-mediated cell-to-cell communication has been shown to influence the development of atherosclerosis; therefore, it is essential to investigate the mechanism of exosome-mediated intercellular crosstalk in this disease, which may have diagnostic and therapeutic applications. This thesis aims to characterize exosomes formed by the interacting of vascular smooth muscle cells (VSMC) and endothelial cells (EC) in different co-culture models. Novel miRNAs in exosomes formed in such models hold promise as new biomarkers for the early detection of atherosclerosis. Our study utilized three culture models: a direct co-culture model, an indirect culture, and an isolated exosome treatment model. We characterized the exosomes using nanoparticle tracking analysis (NTA) and Western blot experiments. Then we isolated miRNA, from these exosomes and sequenced their RNA to identify potential miRNA markers. The results pointed to hsa-miR-335-5p as a potential candidate. We plan further research to explore the functional role of hsa-miR-335-5p in atherosclerosis.
Benzer Tezler
- Ailesel hiperkolesterolemi tanılı çocuk hastalarda atorvastatin tedavisinin kan lipidomik parametreleri üzerine etkisi
The effect of atorvastatin therapy on blood lipidomic parameters in pediatric patients with familial hypercholesterolemia
YUNUS EMRE BÜLBÜL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıAnkara ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ENGİN KÖSE
- Primer hiperparatiroidizmde paratiroidektominin inflamatuar ve kardiyovasküler risk parametreleri üzerindeki etkilerinin retrospektif analizi
Retrospective analysis of the effects of parathyroidectomy on inflammatory and cardiovascular risk parameters in primary hyperparathyroidism
İDİL YÖRÜK DOĞAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
Endokrinoloji ve Metabolizma HastalıklarıSağlık Bilimleri Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FEYZA YENER ÖZTÜRK
- Kanser tedavisi için potansiyel polo-benzeri kinaz 1 (plk1) inhibitörlerinin hesaplamalı yaklaşımlar ile belirlenmesi ve plk1 protein hedefinin biyomoleküler etkileşimleri
Identification of potential polo-like kinase 1 (plk1) inhibitors for cancer therapy by computational approaches, and biomolecular interactions of polo-like kinase 1 (plk1) protein target
GÜLCE DAVUTLAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
BiyofizikÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiTıbbi Sistem Biyolojisi Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ FERAH CÖMERT ÖNDER
- Identification of potential target genes in human by miRNAs of cacao: A cross-kingdom in silico approach
Kakao miRNA'ları ile insandaki potansiyel hedef genlerin tanımlanması: Alemler arası bir in siliko yaklaşım
RÜMEYSA KARAİSMAİLOĞLU
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
Bilim ve TeknolojiYıldız Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SEVGİ MARAKLI
- Ege bölgesi koşullarında üretilen organik hayvan yemlerinde farklı münavebe sistemlerinde oluşan potansiyel mikotoksijenik küflerin tanılanması
Identification of potential mycotoxigenic molds in composed different alternation systems and produced organic feeds in Ege region conditions
RASOOL ASNAASHARI