Bakteriyofajlara dirençli yanık örneklerinden izole edilen Pseudomonas aeruginosa'da Crisper Cas geninin araştırılması
Investigation of Crisper Cas gene in Pseudomonas aeruginosaisolated from burn samples resistant to bacteriophage
- Tez No: 857685
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ CİHAN ÇİTİL, DR. ÖĞR. ÜYESİ ZAINAB RADHI ABDUL-HUSSEIN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 63
Özet
Yanıklar, termal, radyasyonel, kimyasal veya elektriksel temas sonucu deri veya diğer dokularda meydana gelen yaralanmalardır. Bu nedenle hasta, antibiyotiklere dirençli olduğu bilinen Pseudomonas aeruginosa bakterisi de dâhil olmak üzere birçok mikroorganizmaya maruz kalır. Bu çalışmanın amacı, yanık hastalarından Pseudomonas aeruginosa'nın izolasyonu, yanıklarından izole edilen bakterilerin bakteriyofaj direnci ile bu bakteriler için bazı Crispr-Cas geninin sıklığı arasındaki ilişkinin belirlenmesidir. Bu bağlamda, yanık hastalarından yaşları 5 ile 70 arasında değişen 25 erkek, 60 kadın ve 25 çocuk olmak üzere toplam 110 örnek alınmıştır. 60 (%54,55) hastada yanıkların birincil nedeni sıcak su iken, bunu 28 (%25,4) hastada ocak yanıkları, 15 (%13,64) hastada yağ yanıkları ve 5 (%4.55) hastada elektrik yanıkları izlemiştir. Mevcut çalışma örneklerinin tamamı MacConkey agar besiyerinde ve Cetrimide Agar'da kültüre edilmiştir. Üreyen izolatlar daha sonra çeşitli biyokimyasal testlere tabi tutulmuştur. 28 izolat Vitek-2 kompakt sistemi ile, geri kalanı ise Crispr-Cas genleri kullanılarak teşhis edilmiştir. Pseudomonas aeruginosa enfeksiyonundan en çok kadın hastalar etkilenmiştir. Pseudomonas aeruginosa türleri, Kolistin (%75) hariç tüm antibiyotiklere %100 dirençli bulunmuştur. Genomik DNA ekstraksiyonu, incelenen tüm örneklerde Cas5 varlığını göstermiştir. Bu durum antibiyotik direnci ile ilişkili olabilir
Özet (Çeviri)
Burns are injuries to the skin or other tissues caused by thermal, radiational, chemical or electrical contact. Therefore, the patient is exposed to many microorganisms, including the bacterium Pseudomonas aeruginosa, which is known to be resistant to antibiotics. The aim of this study was to isolate Pseudomonas aeruginosa from burn patients and to determine the relationship between bacteriophage resistance of bacteria isolated from burns and the frequency of some Crispr-Cas genes for these bacteria. In this context, a total of 110 samples were taken from burn patients, including 25 men, 60 women and 25 children aged between 5 and 70 years. In 60 (54.55%) patients, the primary cause of burns was hot water, followed by hearth burns in 28 (25.4%) patients, oil burns in 15 (13.64%) patients and electrical burns in 5 (4.55%) patients. All of the present study samples were cultured on MacConkey agar medium and Cetrimide Agar. The cultured isolates were then subjected to various biochemical tests. 28 isolates were identified using Vitek-2 compact system and the rest were identified using Crispr-Cas genes. Female patients were mostly affected by Pseudomonas aeruginosa infection. Pseudomonas aeruginosa strains were found to be 100% resistant to all antibiotics except Colistin (75%). Genomic DNA extraction showed the presence of Cas5 in all samples analysed. It is thought that this may be related to antibiotic resistance
Benzer Tezler
- Pseudomonas aeruginosa bakteriyofaj kokteyli hazırlanması ve fare yanık yara enfeksiyon modelinde tedavideki etkinliğinin değerlendirilmesi
Preparation of pseudomonas aeruginosa bacteriophage cocktail and evaluation of therapeutic efficacy in mouse burn wound infection model
ILGIN ATA VURAL
Doktora
Türkçe
2024
MikrobiyolojiBaşkent ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYLİN ÜSKÜDAR GÜÇLÜ
- Çevresel örneklerden Escherichia coli DH10B suşuna karşı litik bakteriyofaj izolasyonu ve klinik Escherichia coli suşlarına karşı etkinliklerinin belirlenmesi
Çevresel örneklerden Escherichia coli DH10B suşuna karşı litik bakteriyofaj izolasyonu ve klinik Escherichia coli suşlarına karşı etkinliklerinin belirlenmesi
ABDULKERİM KARAYNİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıAydın Adnan Menderes ÜniversitesiMoleküler Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BÜLENT BOZDOĞAN
- Çoklu antibiyotik dirençli klebsiella pneumoniae suşlarının direnç genlerinin belirlenmesi ve bu suşlara etkili bakteriyofaj izolasyonu ve karakterizasyonu
Isolati̇on and characteri̇zati̇on of bacteri̇ophages agai̇nst multi̇ple-anti̇bi̇oti̇c-resi̇stant klebsiella pneumonia strai̇ns and determi̇nati̇on of resi̇stance genes
BURCU ALTUNAY
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıAydın Adnan Menderes ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ GÜLİZ UYAR GÜLEÇ
- Antibiyotik dirençli Pseudomonas aeruginosa suşlarına spesifik litik bakteriyofaj izolasyonu ve izole edilen bakteriyofajların litik spektrumlarının belirlenmesi
Isolation of lytic bacteriophages against multidrug resistant Pseudomonas aeruginosa isolates and determine their lytic spectrums
ERGÜN AKTÜRK
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıŞifa ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HALİL İBRAHİM ATABAY
PROF. DR. SİNEM AKÇALI
- Salmonella spp. ve Escherichia coli'ye etkili bakteriyofajların karakterizasyonu ve gıda uygulamaları
Characterization and food application of phages effective against Salmonella spp. and Escherichia coli
ESRA EKİZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Gıda MühendisliğiHacettepe ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İSMAİL HAKKI BOYACI