Geri Dön

Yeni nesil dizileme yaklaşımı ile NRP-1 ve SCOS-1 gen polimorfizmleri ve COVID-19 hastalık seyri arasındaki olası ilişkinin araştırılması

Investigation of possible association between next generation sequencing approach and NRP-1 and SCOS-1 gene polymorphisms and COVID-19 disease

  1. Tez No: 858028
  2. Yazar: MAYA AHMADOVA
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ERTAN MAHİR KORKMAZ, PROF. DR. ERGÜN PINARBAŞI
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Genetik, Halk Sağlığı, Biology, Genetics, Public Health
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Sivas Cumhuriyet Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 138

Özet

COVID-19, küresel bir endişe kaynağı oluşturarak 2020 yılında Dünya Sağlık Örgütü (DSÖ) tarafından pandemi ilan edilmiştir. Bu virüs, yakın temas yoluyla hızlı bir şekilde yayılma potansiyeline sahip olup, semptomlar genellikle hafif seyretse de, şiddetli durumlar da gözlemlenebilmektedir. Enfekte olan bireylerde görülen kuru öksürük, ateş ve yorgunluk gibi yaygın semptomlarla birlikte, ölümcül ARDS ve septik şok gibi ciddi klinik sonuçlar ortaya çıkabilmektedir. Virüsün S glikoproteini, konak reseptörlerine bağlanma ve membran füzyonu süreçlerinde kilit bir rol oynamaktadır. COVID-19 enfeksiyonunun yaş, diyabet, obezite, kardiyovasküler ve serebrovasküler hastalıklar gibi faktörlerle ilişkilendirilerek enfeksiyon riskini arttırabildiği bilinmektedir. Bu hastalığın patojenik mekanizması genellikle sitokin fırtınası olarak adlandırılan aşırı inflamasyon ve doku hasarı ile bağlantılıdır. Son dönemde yapılan araştırmalar, genetik faktörlerin COVID-19 enfeksiyonunun ciddiyetini ve sonuçlarını etkileyebileceğini göstermektedir. Bu bağlamda, Nöropilin-1 (NRP-1) ve Sitokin Sinyali Baskılayıcısı (SOCS-1) proteinlerinin ifade seviyelerinin önemli bir rol oynadığı belirlenmiştir. Bu tez, daha önce NRP-1 ve SOCS-1 genlerinde tanımlanmış olan rs2228638, rs10080 ve -1478CA>del polimorfizmleri ile COVID-19 arasında potansiyel risk faktörleri olup olmadığını araştırmayı amaçlamıştır. Yapılan araştırmada, özellikle NRP-1 genine ait olan rs1044210, rs10827206, rs10080 ve SOCS-1 gen bölgesine ait olan -1478CA>del polimorfizmleri arasında gruplar arasında anlamlı istatistiksel farklılıklar tespit edilmiş ve bu bulgular titiz bir şekilde değerlendirilmiştir. Bu anlamlı farklılıkların, söz konusu genetik varyasyonların COVID-19 enfeksiyonunun şiddeti ve seyri üzerinde potansiyel bir etkiye sahip olabileceğini düşündürmektedir. Özellikle, bu polimorfizmlerin bireylerin enfeksiyon duyarlılığı, hastalık süreci ve sonuçları üzerindeki etkileri konusundaki bulgular, genetik faktörlerin hastalık heterojenliği üzerindeki rolünü daha iyi anlamamıza yardımcı olabilir. Bu önemli bulgular, genetik temelli tedavi ve müdahale stratejilerinin geliştirilmesine yönelik gelecekteki çalışmaların kapılarını aralamaktadır.

Özet (Çeviri)

COVID-19 was declared a pandemic by the World Health Organization (WHO) in 2020, creating a global concern. This virus has the potential to spread quickly through close contact, although symptoms are usually mild, severe conditions can also be observed. Along with common symptoms such as dry cough, fever and fatigue seen in infected individuals, serious clinical consequences such as fatal ARDS and septic shock can occur. The S glycoprotein of the virus plays a key role in the processes of binding to host receptors and membrane fusion. COVID-19 infection is known to increase the risk of infection by being associated with factors such as age, diabetes, obesity, cardiovascular and cerebrovascular diseases. The pathogenic mechanism of this disease is often linked to excessive inflammation and tissue damage, called cytokine storms. Recent research shows that genetic factors can influence the severity and consequences of COVID-19 infection. In this context, it has been determined that the expression levels of the Neuropilin-1 (NRP-1) and Cytokine Signal Suppressor (SOCS-1) proteins play an important role. This thesis aims to investigate whether there are potential risk factors between rs2228638, rs10080 and -1478CA>del polymorphisms and COVID-19, which have previously been identified in the NRP-1 and SOCS-1 genes. In the study, rs1044210, rs10827206, which belongs to the NRP-1 gene in particular, significant statistical differences between the rs10080 and SOCS-1 gene region-1478CA>del polymorphisms were identified and these findings were evaluated meticulously. These significant differences suggest that the genetic variations in question may have a potential impact on the severity and course of COVID-19 infection. In particular, findings on the effects of these polymorphisms on individuals' susceptibility to infection, disease process and outcomes may help us better understand the role of genetic factors in disease heterogeneity. These important findings open the door to future studies for the development of genetic-based treatment and intervention strategies.

Benzer Tezler

  1. Ninova eyaletindeki Iraklı kadınlarda BRCA1 ve BRCA2 genleri için genetik varvasyonun tespiti ile meme kanserinin erken teşhisi

    Early diagnosis of breast cancer by detection of genetic variation for BRCA1 AND BRCA2 genes in the women's of Nineveh province

    NADA SAAD OMAR AL-TAEE

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ FİLİZ SARIKAYA PEKACAR

  2. Lösemilerdeki füzyon genlerinin taranmasına yönelik yeni nesil dizileme panellerinin geliştirilmesi

    Development of next generation sequencing panels for screening fusion genes in leukemia

    SADIK ÇİĞDEM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    GenetikAnkara Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. EMRE KESKİN

  3. Mutation analysis of the TERT gene in ovarian cancer patients of turkish population by next generation sequencing method

    Türk popülasyonunda over kanseri hastalarinda TERT geninin yeni nesil dizileme yöntemiyle mutasyon analizi

    BETÜL ÇAPAR GORALI

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    Moleküler TıpYeditepe Üniversitesi

    Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TURGAY İSBİR

  4. Nadir mutasyonların taramasına yönelik derin dizileme çalışmaları için çok boyutlu havuzlama yaklaşımının geliştirilmesi ve familyal hiperkolesterolemi hasta grubunda uygulanması

    Development of a multi-dimensional pooling approach for scanning rare mutations in deep sequencing experiments and application on familial hypercholesterolemia patient group

    HALDUN DOĞAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyoteknolojiAnkara Üniversitesi

    Temel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HİLAL ÖZDAĞ SEVGİLİ

  5. Evolutionary engineering of polyphenol resistance in lactic acid bacteria

    Laktik asit bakterilerinin polifenol direncinin evrimsel mühendislik ile geliştirilmesi

    TARIK ÖZTÜRK

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZEYNEP PETEK ÇAKAR