Kronik miyeloid lösemi hücre hatlarında dna metiltransferaz-3a'nın fonksiyonunun düzenlenmesinde rol alan moleküllerinincelenmesi
Investigation of molecules involved in the regulationof dna methyltransferase-3a function in chronicmyeloid leukemia cell lines
- Tez No: 859413
- Danışmanlar: PROF. DR. HAKKI OGÜN SERCAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Moleküler Tıp, Tıbbi Biyoloji, Molecular Medicine, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 122
Özet
Kronik miyeloid lösemi (KML) patogenezinde Wnt sinyal ileti yolağının etkisi (özellikle aşırı uyarılması) bilinmektedir. Wnt sinyal ileti yolağının baskılanmasında rol alan sFRP1 geni, promotör hipermetilasyonu ile epigenetik olarak sessizleştirilmiştir. Bu sessizleşmede temel oyuncu DNMT3A'dır. Buna ek olarak genlerin ifade düzeylerinin ve dolayısıyla fonksiyonlarının düzenlenmesinde miRNA'ların da etkileri bilinmektedir. Araştırmamız, miR-144-3p, miR-105-3p, miR-767-5p miRNA'lar ile EZH2, TET1, TET2 ve TET3 genlerinin ifade düzeylerindeki değişimlerin model hücre sistemi ile araştırılmasını kapsamaktadır. Bu doğrultuda gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu ile DNMT3A ve miRNA ifadeleri karşılaştırılmıştır. Ardından EZH2, TET1, TET2 ve TET3 genlerinin protein seviyesinde ifadeleri Western Blot analizi ile gösterilmiştir. Elde edilen veriler istatistiksel olarak değerlendirilmiştir. sFRP1 ifade eden K562S hücrelerinde protein seviyesinde DNMT3A ve TET1 ifadeleri azalırken EZH2 ve TET2 ifadeleri artmaktadır. Fakat TET3 ifadesinde anlamlı bir farklılık görülmemiştir. Ayrıca miR-144-3p ve miR-767-5p ifadelerinin K562S hücrelerinde azaldığı görülmüştür. Bu sonuçlar doğrultusunda DNMT3A ifadesinin sFRP1 varlığında post-transkripsiyonel olarak BCR/ABL1-TET2-EZH2 ekseninde düzenleniyor olabileceği yönünde veriler elde edilmiştir. TET2'nin, sFRP1 ifadesi ile bağlantılı olarak azalan BCR/ABL1 aktivitesi sonucu hücredeki miktarında artış olabileceği ve bununla birlikte artan EZH2'nin de aynı zamanda TET2'nin negatif regülatörü olarak bilinen CXXC4'ü hedef alarak bu artışa katkı sağladığı öngörülmektedir. Ayrıca miR-144-3p ve miR-767-5p'nin sırasıyla EZH2 ve TET2 ifadesinin kontrolünde potansiyel regülatörler olabileceği gösterilmiştir.
Özet (Çeviri)
The effect (especially overstimulation) of Wnt signaling pathway is known in the pathogenesis of chronic myeloid leukemia (CML). The sFRP1 gene, which is involved in the suppression of the Wnt signal transduction pathway, is epigenetically silenced by promoter hypermethylation. DNMT3A is the key player in this suppression. In addition, the effects of miRNAs in the regulation of the expression levels of genes and their functions are undeniable facts. Our research includes investigating the changes in the expression levels of miR-144-3p, miR-105-3p, miR-767-5p miRNAs and EZH2, TET1, TET2 and TET3 genes with a model cell system. DNMT3A and miRNA expression changes were compared via real-time polymerase chain reaction. Then, expression of EZH2, TET1, TET2 and TET3 genes at protein level was demonstrated by Western blot analysis. The obtained data were statistically evaluated. In sFRP1 expressing K562S cells, DNMT3A and TET1 expression at the protein level decreases while EZH2 and TET2 expressions are increased. However, no significant difference was observed in TET3 expression. In addition, miR-144-3p and miR-767-5p expressions were decreased in K562S cells. In line with these results, data were obtained that DNMT3A expression may be regulated post-transcriptionally in the BCR/ABL1-TET2-EZH2 axis in the presence of sFRP1. It is predicted that there may be an increase in the amount of TET2 in the cell as a result of decreased BCR/ABL1 activity associated with sFRP1 expression, and that increased EZH2 expression also contributes to this increase by targeting CXXC4, which is also known as the negative regulator of TET2. It has also been shown that miR-144-3p and miR-767-5p may be potential regulators of EZH2 and TET2 expression, respectively.
Benzer Tezler
- Imatinib mesilat dirençli K562 hücre soyu ile duyarli K562 hücre soylarinda DNA Metiltransferaz 1 enziminin ifade düzeyinin karşılaştırılması
Comparison of the expression levels of DNA Methyltransferase 1 enzyme in imatinib mesylate resistant K562 cell line and sensitive K562 cell line
PARIA NOJAVAN TALATAPEH
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Genetikİstinye ÜniversitesiTıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. VEYSEL SABRİ HANÇER
- Üçüncü nesil tirozin kinaz inhibitörü ponatinib' e duyarlı ve dirençli KML hücrelerine stat5 inhibitörü pimozid uygulamasının lösemik hücre yanıtı üzerine etkilerinin araştırılması
The investigation of effects on leukemic cell response of stat5 inhibitor pimozide applied on CML cell which is sensitive and resistant to third generation tyrosine kinase inhibitor ponatinib
NURCAN GÜMÜŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
Tıbbi BiyolojiEge ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BURÇİN KAYMAZ
- Nek6'nın k-562 ve mcf-7 hücre hatlarında çoklu ilaç dirençliliği ve apoptozdaki işlevleri
The role of nek6 gene expression in multidrug resistance and apoptosis in mcf-7 and k-562 cell lines
AYÇA NABİOĞLU
Yüksek Lisans
İngilizce
2015
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. UFUK GÜNDÜZ
DOÇ. DR. PELİN MUTLU
- İzole edilen ALCAP moleküllerinin kronik myeloid lösemi hücre hattı-K562'de DNA hasarı ve onarımına olan etkilerinin incelenmesi
Effects of some novel ALCAP molecules on DNA damage and repair mechanisms in chronic myeloid leukemia cell line-K562
NURAY BÖĞÜRCÜ
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
BiyomühendislikEge ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. KEMAL SAMİ KORKMAZ
- Imatinib mesilat-dirençli ve dirençsiz kronik myeloid lösemi hücre hatlarında bim ve bid proapoptotik genlerinin polikomb grup proteinleri tarafından epigenetik regülasyonu
Epigenetic regulation of bim and bid proapoptotic genes by polycomb group proteins in imatinib mesylate resistant and non-resistant chronic myeloid leukemia cell lines
SÜREYYA BOZKURT
Doktora
Türkçe
2010
Tıbbi BiyolojiAnkara ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ASUMAN SUNGUROĞLU