Uzun kodlamayan RNA ve mikro RNA'ların hepatoselüler karsinomunun erken tanısında önemi
The importance of long noncoding RNA and micrornas in the early diagnosis of hepatocellular carcinoma
- Tez No: 862174
- Danışmanlar: PROF. DR. FATİH EREN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Genetik, Moleküler Tıp, Onkoloji, Genetics, Molecular Medicine, Oncology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Marmara Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 155
Özet
Amaç: MikroRNA (miRNA/miR) ve uzun kodlamayan RNA (lncRNA), hepatosellüler karsinogenezde önemli bir rol oynar ve HCC için invaziv olmayan bir biyobelirteç olarak hizmet edebilir. Bu çalışma, Hepatit B virüsü (HBV) ile ilişkili HCC (HBV-HCC), HBV ile ilişkili Siroz (HBV-Siroz), Kronik Hepatit B hastaları (KHB) ve sağlıklı deneklerin serumunda miRNA-146b-5p, miRNA-4510 ve lncRNA-GAS5 ekspresyonunu değerlendirmeyi amaçlamıştır. Gereç ve Yöntem: Bu kesitsel çalışmada 15 HBV-HCC, 15 HBV-Siroz, 16 KHB ve 16 sağlıklı denekten alınan serum kullanılmıştır. Toplam RNA, serumdan izole edildi ve miRNA ve lncRNA'ların ekspresyonu, qRT-PCR ile ölçüldü ve 2-ΔΔCt yöntemleri kullanılarak hesaplandı. MiR-TV ve UALCAN veri tabanları kodlamayan RNA (ncRNA)'ların ekspresyonunu analiz etmek için kullanılmıştır. MIENTURNET ve Network Analyst miRNA-hedef etkileşimlerini tahmin etmek ve fonksiyonel zenginleştirme analizini görselleştirmek için kullanılmıştır. Bulgular: MiRNA-4510'in sadece kontrol grubunda bulunan üç bireyde ekspresyonu görülmüştür. MiRNA-146b-5p ekspresyonu en az HBV-HCC grubunda, en çok da kontrol grubunda bulunmuştur. MiR-146b-5p ekspresyonu için HBV-HCC grubu ile HBV-Siroz grubu ve HBV-HCC grubu ile kontrol grubu arasında güçlü bir ilişki saptandı sırasıyla p=0,006 ve p=0,005 olarak bulundu. LncRNA-GAS5 ekspresyonu en az KHB grubunda olmuştur, en çok da kontrol grubunda olmuştur. LncRNA-GAS5 için gruplar ikili şekilde karşılaştırıldığında HBV-HCC grubu ile kontrol grubu arasında ve KHB grubu ve kontrol grubu arasında güçlü bir ilişki saptandı sırasıyla p=0,031 ve p=0,002 olarak bulundu. Sonuç: Sonuç olarak; serum miRNA-146b-5p ve lncRNA-GAS5 seviyelerinin HBV-HCC için non-invaziv tanısal biyobelirteçler olarak hizmet edebilecek potansiyele sahip olduğunu öne sürdük. Birlikte ele alındığında, bulgularımız HBV-HCC tanısı için potansiyel biyobelirteçlere ışık tutmaktadır.
Özet (Çeviri)
Objective: MicroRNA (miR/miRNA) and long non-coding RNA (lncRNA) play an important role in hepatocellular carcinogenesis and may serve as a non-invasive biomarker for HCC. This study aimed to assess miRNA-4510, miRNA-146b-5p, and lncRNA-GAS5 expression in the serum of patients with hepatitis B virus (HBV)-related HCC (HBV-HCC), HBV-related cirrhosis (HBV-Cirrhosis), chronic hepatitis B (CHB), and healthy subjects. Materials and Methods: This cross-sectional study used serum from 15 HBV-HCC, 15 HBV-Cirrhosis, 16 CHB, and 16 healthy subjects. The total RNA was isolated from serum, and the expression of miRNAs and lncRNAs were measured by qRT-PCR and calculated using 2-ΔΔCt methods. The MiR-TV and UALCAN databases aided in analyzing ncRNA expressions, while MIENTURNET and Network Analyst were utilized for predicting miRNA-target interactions and functional enrichment analysis visualization. Results: miRNA-4510 was found exclusively in three control subjects. MiRNA-146b-5p levels were lowest in the HBV-HCC group and highest in controls. Significant correlations were observed between HBV-HCC and HBV-Cirrhosis (p=0.006), and HBV-HCC and controls (p=0.005). The lncRNA-GAS5 expression was the least in the CHB group and the most in the control group. A strong relationship was found between the HBV-HCC group and the control group, and between the CHB group and the control group, respectively, p=0.031 and p=0.002. Conclusion: The serum levels of miRNA-146b-5p and lncRNA-GAS5 show promise as non-invasive diagnostic biomarkers for HBV-related HCC. These findings contribute to the identification of potential biomarkers for HBV-HCC diagnosis.
Benzer Tezler
- Investigation of miRNAs regulating therapy response in Hepatocellular Carcinoma
Hepatoselüler Karsinoma'da tedavi yanıtını düzenleyen mikroRNA'ların araştırılması
EZGİ BAĞIRSAKÇI TEPE
Doktora
İngilizce
2024
GenetikDokuz Eylül ÜniversitesiGenom Bilimleri ve Moleküler Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUHAMMED KASIM DİRİL
PROF. DR. SAFİYE NEŞE ATABEY
- Zeytin (Olea europaea L. cv Gemlik) bitkisinde korunmuş miRNA'ların analizi
Analyze of some conserved miRNA in olive (Olea europaea L. cv Gemlik)
SULTAN CANSU GÖNENÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
GenetikYıldız Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NEHİR ÖZDEMİR ÖZGENTÜRK
- Mesane kanserli hastalarda uzun kodlamayan rna-pvtı ve mir-l28 ekspresyonlarının incelenmesi
Long non-coding rna-pvti and mir-l28 in bladder cancer conditionsexamination of expressions
TAGHI AHMADI RENDI
Doktora
Türkçe
2024
Biyokimyaİstanbul ÜniversitesiTıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEMRA ABBASOĞLU
- Mesane kanserli hastalarda uzun kodlamayan RNA-ATB ve MiR-200c ekspresyonlarının incelenmesi
Investigation of long non-coding RNA-ATB and MiR-200c expressions in bladder cancer patients
ARİF MURAT KAYTAZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
Biyokimyaİstanbul ÜniversitesiTıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEMRA DOĞRU ABBASOĞLU
- Investigating RNA interference, cross-kingdom RNA exchange and antioxidant response in Nicotiana benthamiana-Fusarium verticillioides phytopathosystem
Nicotiana benthamiana-Fusarıum verticillioides fitopatosisteminde RNA interferans, türler arası RNA değişimi ve antioksidan tepkisinin incelenmesi
ASLIHAN KULOĞLU
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyoteknolojiGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FATMA AYDINOĞLU